| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-43页 |
| 1.1 表观遗传学简介 | 第12-15页 |
| 1.2 蛋白质翻译后修饰 | 第15-17页 |
| 1.2.1 组蛋白翻译后修饰 | 第15-16页 |
| 1.2.2 非组蛋白翻译后修饰 | 第16-17页 |
| 1.3 SUMO修饰 | 第17-25页 |
| 1.3.1 SUMO蛋白 | 第17-18页 |
| 1.3.2 SUMO修饰通路 | 第18-19页 |
| 1.3.3 SUMO修饰基序 | 第19页 |
| 1.3.4 SUMO修饰酶系 | 第19-22页 |
| 1.3.5 去SUMO化蛋白酶 | 第22-23页 |
| 1.3.6 SUMO修饰去除蛋白家族SENPs和基因表达调控 | 第23-25页 |
| 1.4 SUMO修饰与染色质 | 第25-28页 |
| 1.4.1 SUMO富集于染色质 | 第25-26页 |
| 1.4.2 SUMO修饰与组蛋白 | 第26-28页 |
| 1.5 SUMO修饰与组蛋白乙酰化 | 第28-33页 |
| 1.6 SUMO与组蛋白甲基化 | 第33-37页 |
| 1.7 SUMO修饰介导的生物学功能 | 第37-39页 |
| 1.7.1 SUMO修饰与细胞周期调控 | 第37页 |
| 1.7.2 SUMO修饰与DNA损伤修复 | 第37页 |
| 1.7.3 SUMO修饰与染色质重塑 | 第37-38页 |
| 1.7.4 SUMO修饰与转录调控 | 第38-39页 |
| 1.7.5 SUMO修饰与泛素生物学功能相关性 | 第39页 |
| 1.8 SUMO修饰与疾病的相关性 | 第39-43页 |
| 1.8.1 SUMO修饰与肿瘤 | 第39-40页 |
| 1.8.2 SUMO修饰与心脏疾病 | 第40-41页 |
| 1.8.3 SUMO修饰与神经退行性疾病 | 第41页 |
| 1.8.4 SUMO修饰和与免疫性疾病 | 第41-43页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第43-79页 |
| 2.1 实验材料 | 第43-52页 |
| 2.1.1 实验细胞系 | 第43页 |
| 2.1.2 原核细菌 | 第43页 |
| 2.1.3 质粒信息 | 第43-44页 |
| 2.1.4 实验仪器 | 第44-45页 |
| 2.1.5 实验试剂 | 第45-46页 |
| 2.1.6 引物序列 | 第46-49页 |
| 2.1.7 相关实验试剂的配制 | 第49-52页 |
| 2.2 实验方法 | 第52-79页 |
| 2.2.1 分子克隆 | 第52-62页 |
| 2.2.2 细胞培养 | 第62-63页 |
| 2.2.3 蛋白质印迹 | 第63-65页 |
| 2.2.4 细胞免疫染色 | 第65-67页 |
| 2.2.5 免疫共沉淀 | 第67-69页 |
| 2.2.6 核质分离 | 第69-70页 |
| 2.2.7 真核细胞组蛋白抽提 | 第70-71页 |
| 2.2.8 真核细胞基因组抽提 | 第71-72页 |
| 2.2.9 细胞稳系构建 | 第72-73页 |
| 2.2.10 qPCR | 第73-74页 |
| 2.2.11 原核表达蛋白的纯化 | 第74-75页 |
| 2.2.12 考马斯亮蓝染色 | 第75-76页 |
| 2.2.13 体外SUMO修饰反应 | 第76页 |
| 2.2.14 染色质免疫共沉淀(ChIP) | 第76-79页 |
| 第三章 SUMO修饰调控HDAC1/2组蛋白去乙酰化酶活性的分子机制研究 | 第79-107页 |
| 3.1 前言 | 第79-83页 |
| 3.2 实验结果 | 第83-104页 |
| 第一部分 ：HDAC1/2的SUMO修饰功能研究 | 第83-95页 |
| 3.2.1 ChIP-Seq证明SUMOmimic修饰促进HDAC1H3去乙酰化酶活性.. | 第83-84页 |
| 3.2.2 代表性基因转录水平分析表明HDAC1SUMO修饰抑制靶基因转录 | 第84-87页 |
| 3.2.3 HDAC1/2mimicSUMO修饰不影响其亚细胞定位 | 第87-88页 |
| 3.2.4 HDAC1/2SUMO修饰位点的鉴定 | 第88-90页 |
| 3.2.5 HDAC1/2SUMO修饰位点突变部分抑制其组蛋白去乙酰化酶活性. | 第90-91页 |
| 3.2.6 HDAC1/2SUMO修饰突变体蛋白稳定性降低 | 第91-92页 |
| 3.2.7 HDAC1/2SUMO修饰突变体不影响HDAC1/2复合体形成 | 第92-94页 |
| 3.2.8 HDAC1/2SUMO修饰突变体抑制其染色质定位 | 第94-95页 |
| 第二部分 ：SENPs去除HDAC1/2的SUMO修饰研究 | 第95-104页 |
| 3.2.9 SENP家族蛋白中,SENP1/6/7可以去除HDAC1/2SUMO修饰 | 第95-96页 |
| 3.2.10 过表达SENP6能够明显增加组蛋白乙酰化水平 | 第96-98页 |
| 3.2.11 SENP6调控组蛋白乙酰化水平依赖于其去SUMO化酶活性 | 第98-99页 |
| 3.2.12 SENP6抑制HDAC1/2蛋白稳定性 | 第99-101页 |
| 3.2.13 SENP6抑制HDAC1/2与染色质结合 | 第101-103页 |
| 3.2.14 SENP6抑制细胞增殖 | 第103-104页 |
| 3.3 总结与讨论 | 第104-107页 |
| 第四章 SUMO修饰调控组蛋白甲基化的分子机制研究 | 第107-118页 |
| 4.1 前言 | 第107-108页 |
| 4.2 实验结果 | 第108-115页 |
| 4.2.1 外源过表达SUMO-1和UBC9能增加H3K4/9/27me3水平 | 第108-110页 |
| 4.2.2 敲低SUMO修饰的E2结合酶UBC9能降低H3K4/9/27me3水平 | 第110-111页 |
| 4.2.3 MLL复合体中的WDR5能发生SUMO修饰 | 第111-113页 |
| 4.2.4 SUMO修饰不影响WDR5的转录水平 | 第113-114页 |
| 4.2.5 WDR5发生SUMO修饰增强WDR5蛋白稳定性 | 第114-115页 |
| 4.3 总结与讨论 | 第115-118页 |
| 参考文献 | 第118-131页 |
| 附录(缩略语) | 第131-132页 |
| 在学期间所取得的科研成果 | 第132-133页 |
| 致谢 | 第133页 |
