| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 发展中的计算化学 | 第10-11页 |
| 1.2 论文选题背景 | 第11-15页 |
| 1.2.1 卤代烃以及双分子亲核取代反应 | 第11-14页 |
| 1.2.2 DNA碱基-鸟嘌呤 | 第14-15页 |
| 1.3 论文结构安排 | 第15-18页 |
| 第二章 理论知识概况 | 第18-26页 |
| 2.1 混合量子力学和分子力学方法 | 第18-20页 |
| 2.2 密度泛函理论 | 第20-21页 |
| 2.3 耦合簇理论 | 第21-22页 |
| 2.4 过渡态理论 | 第22-23页 |
| 2.5 NEB方法 | 第23页 |
| 2.6 SPC/E水分子模型 | 第23-26页 |
| 第三章 液相下X~-+CH_3Y→Y~-+CH_3X的多种反应机制 | 第26-62页 |
| 3.1 液相中F?+CH_3Cl S_N2反应的双翻转反应机制 | 第26-40页 |
| 3.1.1 简介 | 第26-27页 |
| 3.1.2 理论方法和系统建立 | 第27-29页 |
| A.混合量子力学和分子力学方法 | 第27-29页 |
| B.计算细节 | 第29页 |
| 3.1.3 结果和讨论 | 第29-38页 |
| A.沿着反应路径的驻点 | 第30-32页 |
| B.详细的原子层面的反应机制 | 第32-36页 |
| C.平均力势能以及溶液对反应的贡献 | 第36-38页 |
| D.反应剖面图的比较 | 第38页 |
| 3.1.4 总结 | 第38-40页 |
| 3.2 液相中F~-+CH_3I S_N2反应的双翻转反应机制 | 第40-52页 |
| 3.2.1 简介 | 第40-41页 |
| 3.2.2 理论方法和系统建立 | 第41-42页 |
| 3.2.3 结果和讨论 | 第42-51页 |
| A.沿反应路径的驻点 | 第42-45页 |
| B.详细的原子层面的反应机制 | 第45-48页 |
| C.平均力势能和溶剂化效应 | 第48页 |
| D.比较反应剖面图 | 第48-50页 |
| E.比较F~-+CH_3Cl和F~-+CH_3I | 第50-51页 |
| 3.2.4 总结 | 第51-52页 |
| 3.3 液相中Cl~-+CH_3I S_N2反应的背面进攻反应机制 | 第52-62页 |
| 3.3.1 简介 | 第52-53页 |
| 3.3.2 理论方法和系统建立 | 第53页 |
| 3.3.3 结果和讨论 | 第53-59页 |
| A.反应络合物,过渡态和产物络合物 | 第53-57页 |
| B.沿着反应路径的详细的演化过程 | 第57页 |
| C.平均力势能和溶剂的贡献 | 第57-58页 |
| D.与利用气相数据获得的PMF相比较 | 第58-59页 |
| 3.3.4 总结 | 第59-62页 |
| 第四章 液相下8-OHGRAD的环打开反应以及质子转移反应 | 第62-86页 |
| 4.1 液相中8-OHGrad的环打开反应 | 第62-75页 |
| 4.1.1 简介 | 第62-63页 |
| 4.1.2 理论方法和系统建立 | 第63-64页 |
| 4.1.3 结果和讨论 | 第64-74页 |
| A.沿反应路径的驻点 | 第66-67页 |
| B.沿着NEB反应路径结构的变化和电荷的演化。 | 第67-70页 |
| C.平均力势能和溶剂贡献 | 第70-73页 |
| D.反应速率常数 | 第73-74页 |
| 4.1.4 总结 | 第74-75页 |
| 4.2 液相中水辅助的8-OHGrad的质子转移过程 | 第75-86页 |
| 4.2.1 简介 | 第75-76页 |
| 4.2.2 理论方法 | 第76页 |
| 4.2.3 结果与讨论 | 第76-85页 |
| A.沿着反应路径的驻点 | 第76-81页 |
| B.详细的,原子层面的反应机制 | 第81-83页 |
| C.平均力势能和溶剂的贡献 | 第83-85页 |
| 4.2.4 总结 | 第85-86页 |
| 第五章 总结与展望 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-96页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第96-98页 |
| 致谢 | 第98页 |
