| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8页 |
| INTRODUCTION | 第9-60页 |
| Ⅰ Chromatin organization and remodeling | 第10-35页 |
| Ⅰ-1 Euchromatin and Heterochromatin | 第11-12页 |
| Ⅰ-2 Epigenetic regulation and chromatin structure | 第12页 |
| Ⅰ-3 ATP-dependent chromatin remodeling | 第12-13页 |
| Ⅰ-4 Histone va riants | 第13-15页 |
| Ⅰ-4-1 H2A variants | 第14-15页 |
| Ⅰ-4-2 H3 variants | 第15页 |
| Ⅰ-5 Histone covalent modifications | 第15-22页 |
| Ⅰ-5-1 Histone Acetylation and deacetylation | 第16页 |
| Ⅰ-5-2 Histone Ubiquitination | 第16-17页 |
| Ⅰ-5-3 Histone Phsophorylation | 第17-18页 |
| Ⅰ-5-4 Histone Methylation | 第18-22页 |
| Ⅰ-6 Nucleosome assembly and Histone chaperones | 第22-35页 |
| Ⅰ-6-1 CAF-1(Chromatin Assembly Factor-1) | 第24-27页 |
| Ⅰ-6-2 HIRA(Histone regulatory homolog A) | 第27-28页 |
| Ⅰ-6-3 Asf1(Anti-silencing function 1) | 第28-29页 |
| Ⅰ-6-4 FACT(Faciliates chromatin transcription)complex | 第29-30页 |
| Ⅰ-6-5 NAP1(Nucleosome Assembly Protein 1) | 第30-35页 |
| Ⅰ-6-5-1 Histone binding and Chaperone activity of NAP1 | 第32-33页 |
| Ⅰ-6-5-2 TAF-1β/SET | 第33-34页 |
| Ⅰ-6-5-3 Plant homoOgue of NAP1 family genes | 第34-35页 |
| Ⅱ. DNA damage and repair | 第35-50页 |
| Ⅱ-1. Stress induced DNA damage | 第35-36页 |
| Ⅱ-2. DNA damage repair pathways | 第36-37页 |
| Ⅱ-3. Photoreactivation repair | 第37-38页 |
| Ⅱ-4. Nucleotide excision repair | 第38-42页 |
| Ⅱ-5. DNA double-strand break repair | 第42-50页 |
| Ⅱ-5-1. Non-homologous end joining | 第44-46页 |
| Ⅱ-5-2. Homologous recombination | 第46-50页 |
| Ⅲ DNA repair in the context of chromatin | 第50-58页 |
| Ⅲ-1 Histone modifications in DNA damage response | 第51-55页 |
| Ⅲ-1-1 H2A/H2AX phosphorylation in DNA damage respose | 第52-53页 |
| Ⅲ-1-2 Histone H2A/H2B ubiquitination in DNA Repair | 第53页 |
| Ⅲ-1-3 Histone acetylation in DNA Repair | 第53-54页 |
| Ⅲ-1-4 histone H3/H4 methylation in DNA Repair | 第54-55页 |
| Ⅲ-2 Chromatin remodeling in DNA Repair | 第55-56页 |
| Ⅲ-3 Knowledge in plants | 第56-58页 |
| Ⅳ Thesis work | 第58-60页 |
| RESULTS | 第60-111页 |
| Ⅰ SDG25 Encodes a Histone Methyltransferase and is Involved in FLCActivation and Repression of Flowering | 第61-72页 |
| Ⅱ Functional analysis of Arabidopsis Nucleosome Assembly Protein1(NAP1) | 第72-111页 |
| Ⅱ-1 Molecular and reverse genetic characterization of Nucleosome Assembly Protein1(NAP1)genes unravels their function in transcription and nucleotide excision repair in Arabidopsis thaliana | 第73-86页 |
| Ⅱ-2 A Truncated Arabidopsis Nucleosome Assembly Proteinl,AtNAP1;3T, Alters Plant Growth Responses to Abscisic Acid and Salt in the Atnap1;3-2 Mutant | 第86-99页 |
| Ⅱ-3 NAP1 family histone-chaperones are required for somatic homologous recombination in Arabidopsis | 第99-111页 |
| GENERAL DISCUSSION AND PERSPECTIVES | 第111-118页 |
| Ⅰ General Discussion | 第112-117页 |
| Ⅰ-1.Roles of Histone methylation in transcription activation and flowering time control | 第112-114页 |
| Ⅰ-2.Roles of histone chaperones in regulation of plant development and DNA Repair | 第114-117页 |
| Ⅱ Perspectives | 第117-118页 |
| MATERIAL AND METHODS | 第118-136页 |
| Ⅰ materials | 第119-126页 |
| Ⅰ-1 plant materials | 第119页 |
| Ⅰ-2 Bacteria strains | 第119-120页 |
| Ⅰ-2-1 Escherichia coli | 第119-120页 |
| Ⅰ-2-2 Agrobacterium tumefaciens | 第120页 |
| Ⅰ-3 Cloning and expression vectors | 第120-122页 |
| Ⅰ-4 Antibodies | 第122-123页 |
| Ⅰ-5 Antibiotics | 第123页 |
| Ⅰ-6 Chemicals | 第123-124页 |
| Ⅰ-7 Oligos | 第124-126页 |
| Ⅱ methods | 第126-136页 |
| Ⅱ-1 General techniques in molecular biology | 第126-132页 |
| Ⅱ-1-1 Vector construction | 第126-128页 |
| Ⅱ-1-1-1 PCR(Polymerase Chain Reaction) | 第126页 |
| Ⅱ-1-1-2 Restriction enzyme digestion | 第126页 |
| Ⅱ-1-1-3 Agarose gel electrophoresis | 第126页 |
| Ⅱ-1-1-4 Ligation | 第126页 |
| Ⅱ-1-1-5 Competent cell preparation | 第126-127页 |
| Ⅱ-1-1-6 Transformation of competent cells | 第127-128页 |
| Ⅱ-1-1-7 Mini-preparation of plasmid DNA by alkaline lysis with SDS | 第128页 |
| Ⅱ-1-2 Genomic DNA isolation | 第128-129页 |
| Ⅱ-1-3 RNA isolation and analysis | 第129-130页 |
| Ⅱ-1-3-1 Total RNA extraction | 第129页 |
| Ⅱ-1-3-2 Reverse transcription | 第129-130页 |
| Ⅱ-1-4 Quantitative PCR analysis | 第130页 |
| Ⅱ-1-5 Protein expression,purification and detection | 第130-132页 |
| Ⅱ-1-5-1 Protein expression in E.Coli | 第130页 |
| Ⅱ-1-5-2 Purification of expressed proteins from E.Coli | 第130-131页 |
| Ⅱ-1-5-3 Separation of proteins by SDS-PAGE | 第131页 |
| Ⅱ-1-5-4 Western blot | 第131-132页 |
| Ⅱ-1-5-5 In vitro histone methytranferase activity assay | 第132页 |
| Ⅱ-2 Tobacco BY2 cells culture and transformation | 第132-133页 |
| Ⅱ-2-1 TBY2 cell culture | 第132页 |
| Ⅱ-2-2 TBY2 cell transformation | 第132-133页 |
| Ⅱ-3 Arabidopsis thaliana culture and transformation | 第133页 |
| Ⅱ-3-1 Arabidopsis culture | 第133页 |
| Ⅱ-3-2 Arabidopsis transformation by flower dip method | 第133页 |
| Ⅱ-4 Phenotype analysis of ABA and salt treatment | 第133-134页 |
| Ⅱ-5 UV treatment and In Vitro DNA Repair Assay | 第134页 |
| Ⅱ-6 The GUS-based HR reporter lines analysis | 第134-136页 |
| Ⅱ-6-1 Growth conditions and stress treatments | 第135页 |
| Ⅱ-6-2 Histochemical staining and HR assessment | 第135-136页 |
| REFERENCE | 第136-156页 |
| ABBREVIATIONS | 第156-157页 |
| ACKNOWLEDGEMENTS | 第157-158页 |
