| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 1 绪论 | 第11-38页 |
| 1.1 前言 | 第11-15页 |
| 1.1.1 蛋白质组 | 第11-13页 |
| 1.1.2 质谱用于蛋白质分析 | 第13-15页 |
| 1.2 LC-MS/MS数据处理 | 第15-21页 |
| 1.2.1 数据转换,提取与存储 | 第15-16页 |
| 1.2.2 质谱预处理 | 第16-21页 |
| 1.3 多肽定性 | 第21-29页 |
| 1.3.1 蛋白质序列库搜索 | 第22-26页 |
| 1.3.2 从头测序法(De Novo Sequencing) | 第26-27页 |
| 1.3.3 多肽质量指纹图谱 | 第27-28页 |
| 1.3.4 多肽质谱库搜索 | 第28-29页 |
| 1.4 蛋白质库搜索结果评估方法及蛋白质定性 | 第29-35页 |
| 1.4.1 蛋白质序列库搜索结果评价方法 | 第30-32页 |
| 1.4.2 翻转蛋白质序列库用于估计定性结果 | 第32-35页 |
| 1.4.3 蛋白质定性 | 第35页 |
| 1.5 本论文研究内容 | 第35-38页 |
| 2 多肽裂解基础 | 第38-55页 |
| 2.1 前言 | 第38-40页 |
| 2.1.1 离子命名 | 第38-39页 |
| 2.1.2 多肽裂解 | 第39-40页 |
| 2.2 多肽CID裂解行为研究 | 第40-54页 |
| 2.2.1 实验 | 第41-43页 |
| 2.2.2 结果与讨论 | 第43-53页 |
| 2.2.3 结论 | 第53-54页 |
| 2.3 本章小结 | 第54-55页 |
| 3 杂排离子及其对质谱定性的影响研究 | 第55-83页 |
| 3.1 质谱中的杂排离子 | 第56-69页 |
| 3.1.1 实验 | 第56-59页 |
| 3.1.2 结果与讨论 | 第59-69页 |
| 3.1.3 本节小结 | 第69页 |
| 3.2 杂排离子对多肽定性结果的影响 | 第69-82页 |
| 3.2.1 实验 | 第70-71页 |
| 3.2.2 结果与讨论 | 第71-81页 |
| 3.2.3 小结 | 第81-82页 |
| 3.3 本章小结 | 第82-83页 |
| 4 多肽质谱预测 | 第83-96页 |
| 4.1 质谱预测 | 第83-93页 |
| 4.1.1 实验 | 第84-88页 |
| 4.1.2 结果与讨论 | 第88-93页 |
| 4.2 本章小结 | 第93-96页 |
| 5 质谱预处理算法的开发 | 第96-124页 |
| 5.1 质谱峰提取和去同位素分布 | 第97-103页 |
| 5.1.1 质谱峰提取 | 第97-100页 |
| 5.1.2 去同位素分布 | 第100-103页 |
| 5.1.3 小结 | 第103页 |
| 5.2 质谱处理 | 第103-123页 |
| 5.2.1 质谱质量评估 | 第104-115页 |
| 5.2.2 电荷预测 | 第115-122页 |
| 5.2.3 小结 | 第122-123页 |
| 5.3 本章小结 | 第123-124页 |
| 6 结论 | 第124-127页 |
| 参考文献 | 第127-154页 |
| 附录 | 第154-158页 |
| 附录1 | 第154-157页 |
| 附录2 | 第157-158页 |
| 攻读博士学位期间的主要研究成果 | 第158-160页 |
| 致谢 | 第160页 |