禽传染性支气管炎病毒H120株全基因组序列测定分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 1 前言 | 第9-22页 |
| ·禽传染性支气管炎概述 | 第9-10页 |
| ·禽传染性支气管炎病毒基因结构 | 第10-14页 |
| ·结构蛋白 | 第10-12页 |
| ·非编码区 | 第12页 |
| ·复制-转录酶蛋白 | 第12-14页 |
| ·全基因组序列测定分析的研究进展 | 第14-19页 |
| ·IBV重组 | 第19-20页 |
| ·禽传染性支气管炎病毒H120株研究 | 第20-22页 |
| 2 试验材料 | 第22页 |
| ·毒株 | 第22页 |
| ·菌种、质粒 | 第22页 |
| ·SPF鸡胚 | 第22页 |
| ·试剂 | 第22页 |
| ·主要仪器 | 第22页 |
| 3 试验方法 | 第22-35页 |
| ·病毒培养 | 第22-23页 |
| ·病毒RNA提取 | 第23页 |
| ·H120全基因组内部片段分段扩增 | 第23-26页 |
| ·引物设计 | 第23-24页 |
| ·cDNA合成 | 第24-25页 |
| ·PCR反应 | 第25页 |
| ·PCR产物回收和纯化 | 第25-26页 |
| ·PCR产物克隆 | 第26-28页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第26页 |
| ·PCR产物连接pMD19-T载体 | 第26-27页 |
| ·连接产物转化大肠杆菌感受态细胞 | 第27页 |
| ·阳性克隆筛选 | 第27页 |
| ·阳性克隆序列测定 | 第27-28页 |
| ·SMART RACE获取基因组末端片段 | 第28-31页 |
| ·RACE引物设计 | 第28页 |
| ·SMART RACE反应 | 第28-30页 |
| ·PCR产物克隆 | 第30-31页 |
| ·序列拼接和基因组全序列的生物信息学分析 | 第31-35页 |
| 4 结果 | 第35-49页 |
| ·全基因组分段扩增结果 | 第35页 |
| ·序列测定和拼接 | 第35页 |
| ·基因组结构分析 | 第35-36页 |
| ·转录调控序列分析 | 第36页 |
| ·序列同源性分析 | 第36-37页 |
| ·系统进化树分析 | 第37页 |
| ·重组推测 | 第37-49页 |
| 5 讨论 | 第49-52页 |
| ·全基因组分段扩增 | 第49页 |
| ·生物信息学分析 | 第49-50页 |
| ·基因重组研究 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附录 禽传染性支气管炎病毒H120株基因组全序列 | 第62-72页 |
