摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
英文缩略表 | 第13-14页 |
第一章 引言 | 第14-19页 |
1.1 粘虫的发生和危害 | 第14页 |
1.2 迁飞行为发生与调控研究 | 第14-15页 |
1.2.1 昆虫迁飞行为发生与调控的研究进展 | 第14-15页 |
1.2.2 粘虫迁飞行为发生与调控机制研究进展 | 第15页 |
1.3 粘虫迁飞型向居留型转化的调控机制研究进展 | 第15-16页 |
1.4 RNA-Seq技术概述 | 第16-17页 |
1.4.1 RNA-Seq技术 | 第16页 |
1.4.2 转录组测序在迁飞昆虫研究中的应用 | 第16-17页 |
1.5 SSR标记 | 第17-18页 |
1.6 研究目的和意义 | 第18-19页 |
第二章 迁飞型和居留型粘虫转录组测序及基因表达分析 | 第19-40页 |
2.1 材料与方法 | 第19-23页 |
2.1.1 供试虫源及饲养方法 | 第19页 |
2.1.2 实验试剂与仪器 | 第19页 |
2.1.3 样品的收集 | 第19页 |
2.1.4 转录组测序流程 | 第19-21页 |
2.1.5 生物信息分析 | 第21-23页 |
2.2 结果与分析 | 第23-39页 |
2.2.1 转录组测序样品检测结果 | 第23-24页 |
2.2.2 数据质量评估和数量统计 | 第24-26页 |
2.2.3 转录本拼接 | 第26-27页 |
2.2.4 基因功能注释 | 第27-28页 |
2.2.5 GO分类 | 第28-29页 |
2.2.6 KOG分类 | 第29-30页 |
2.2.7 KEGG分类 | 第30-32页 |
2.2.8 差异表达基因的分析 | 第32页 |
2.2.9 差异基因维恩图 | 第32-33页 |
2.2.10 差异基因GO富集分析 | 第33-35页 |
2.2.11 差异基因KEGG富集分析 | 第35-37页 |
2.2.12 迁飞相关基因的筛选 | 第37-38页 |
2.2.13 化学感应相关基因的筛选 | 第38页 |
2.2.14 其他重要基因的筛选 | 第38-39页 |
2.3 讨论 | 第39-40页 |
第三章 差异表达基因的q-PCR验证 | 第40-48页 |
3.1 材料和方法 | 第40-43页 |
3.1.1 供试昆虫 | 第40页 |
3.1.2 试剂仪器 | 第40页 |
3.1.3 试验方法 | 第40-43页 |
3.2 结果与分析 | 第43-47页 |
3.2.1 差异表达基因引物验证结果 | 第43-44页 |
3.2.2 差异表达基因q-PCR结果 | 第44-47页 |
3.3 讨论 | 第47-48页 |
第四章 应用转录组测序高通量发掘粘虫SSR标记 | 第48-54页 |
4.1 材料与方法 | 第48页 |
4.1.1 供试虫源和转录组测序 | 第48页 |
4.1.2 SSR筛选方法 | 第48页 |
4.2 结果与分析 | 第48-52页 |
4.2.1 粘虫转录组中SSR位点数量和分布 | 第48-49页 |
4.2.2 粘虫转录组中SSR位点重复次数和基序长度 | 第49-50页 |
4.2.3 粘虫转录组中SSR基元类型和数量 | 第50-52页 |
4.3 讨论 | 第52-54页 |
第五章 全文结论 | 第54-56页 |
参考文献 | 第56-61页 |
附录 | 第61-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
作者简历 | 第66页 |