| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 主要符号表 | 第13-15页 |
| 第1章 引言 | 第15-31页 |
| 1.1 “模式药用植物”丹参概况 | 第15-21页 |
| 1.1.1 丹参主要次生代谢产物生源合成途径研究 | 第15-18页 |
| 1.1.2 丹参组学研究 | 第18-20页 |
| 1.1.3 丹参次生代谢产物调控研究 | 第20-21页 |
| 1.2 茉莉素信号通路研究进展 | 第21-27页 |
| 1.2.1 茉莉素的功能 | 第22-23页 |
| 1.2.2 茉莉素信号合成与转导通路 | 第23-27页 |
| 1.3 COI1基因研究进展 | 第27-30页 |
| 1.3.1 F-box在植物激素传导通路中的功能研究 | 第27-29页 |
| 1.3.2 COI1基因的研究进展 | 第29-30页 |
| 1.4 本研究意义 | 第30-31页 |
| 第2章 丹参COI1基因的克隆及表达分析 | 第31-57页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第32-34页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第32-33页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第33-34页 |
| 2.2 实验方法 | 第34-43页 |
| 2.2.1 提取丹参总RNA及合成cDNA第一链 | 第34-35页 |
| 2.2.2 丹参COI1基因的克隆 | 第35-42页 |
| 2.2.3 丹参COI1蛋白理化性质分析 | 第42页 |
| 2.2.4 丹参COI1基因表达模式分析 | 第42-43页 |
| 2.3 实验结果 | 第43-55页 |
| 2.3.1 丹参COI1基因片段克隆 | 第43-44页 |
| 2.3.2 丹参COI1基因RACE扩增 | 第44-46页 |
| 2.3.3 丹参COI1基因序列分析 | 第46-53页 |
| 2.3.4 丹参COI1基因表达模式分析 | 第53-55页 |
| 2.4 讨论 | 第55页 |
| 2.5 本章小结 | 第55-57页 |
| 第3章 丹参酵母双杂交cDNA文库构建及丹参COI1互作蛋白筛选 | 第57-85页 |
| 3.1 实验材料与仪器 | 第58-60页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第58-59页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第59-60页 |
| 3.2 实验方法 | 第60-70页 |
| 3.2.1 Total RNA提取及mRNA分离 | 第60-61页 |
| 3.2.2 cDNA初级文库的构建 | 第61-65页 |
| 3.2.3 pGADT7-DEST酵母双杂交文库的构建 | 第65-67页 |
| 3.2.4 丹参COI1蛋白“诱饵”载体构建 | 第67-68页 |
| 3.2.5 转化酵母细胞及毒性和自激活活性检测 | 第68-69页 |
| 3.2.6 阳性菌株文库Mating筛选互作蛋白 | 第69-70页 |
| 3.3 实验结果 | 第70-81页 |
| 3.3.1 Total RNA提取及mRNA分离 | 第70-71页 |
| 3.3.2 cDNA初级文库的构建 | 第71-72页 |
| 3.3.3 pGADT7-DEST酵母双杂交文库的构建 | 第72-74页 |
| 3.3.4 丹参COI1“诱饵”载体构建 | 第74-75页 |
| 3.3.5 丹参COI1“诱饵”载体毒性和自激活活性检测 | 第75-76页 |
| 3.3.6 文库Mating筛选丹参COI1互作蛋白 | 第76-81页 |
| 3.4 讨论 | 第81-83页 |
| 3.5 本章小结 | 第83-85页 |
| 第4章 丹参COI1调控丹参抗虫性和主要次生代谢产物积累的功能研究 | 第85-113页 |
| 4.1 实验材料与仪器 | 第85-87页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第85-87页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第87页 |
| 4.2 实验方法 | 第87-96页 |
| 4.2.1 丹参COI1干涉载体pSmCOI1-RNAi构建及验证 | 第87-90页 |
| 4.2.2 丹参COI1沉默株的获得及验证 | 第90-94页 |
| 4.2.3 丹参COI1沉默株抗虫性检测 | 第94页 |
| 4.2.4 丹参COI1沉默株内主要次生代谢产物含量检测 | 第94-96页 |
| 4.3 实验结果 | 第96-108页 |
| 4.3.1 丹参COI1干涉载体pSmCOI1-RNAi的构建及验证 | 第96-99页 |
| 4.3.2 丹参COI1沉默株iCOI1s的获得及验证 | 第99-101页 |
| 4.3.3 丹参COI1沉默株抗虫性检测 | 第101-102页 |
| 4.3.4 丹参COI1沉默株内主要次生代谢产物含量检测 | 第102-108页 |
| 4.4 讨论 | 第108-110页 |
| 4.5 本章小结 | 第110-113页 |
| 第5章 丹参COI1在茉莉素调控丹参根生长及次生代谢产物积累过程中的功能研究 | 第113-125页 |
| 5.1 实验材料与仪器 | 第113-114页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第113页 |
| 5.1.2 实验仪器 | 第113-114页 |
| 5.2 实验方法 | 第114页 |
| 5.3 实验结果 | 第114-121页 |
| 5.3.1 茉莉素诱导丹参COI1沉默株根生长情况观测 | 第114-116页 |
| 5.3.2 茉莉素诱导丹参COI1沉默株内主要次生代谢产物含量检测 | 第116-119页 |
| 5.3.3 茉莉素诱导丹参COI1沉默株内应答茉莉素基因表达量检测 | 第119-121页 |
| 5.4 讨论 | 第121-123页 |
| 5.5 本章小结 | 第123-125页 |
| 第6章 利用比较转录组筛选丹参茉莉素信号通路下游基因 | 第125-157页 |
| 6.1 实验材料 | 第126页 |
| 6.1.1 植物材料 | 第126页 |
| 6.1.2 试剂药品 | 第126页 |
| 6.2 实验方法 | 第126-131页 |
| 6.2.1 样品RNA的提取及检测 | 第126-127页 |
| 6.2.2 mRNA文库构建 | 第127页 |
| 6.2.3 转录组测序 | 第127页 |
| 6.2.4 转录组de novo测序数据分析 | 第127-131页 |
| 6.2.5 对部分筛选出的差异基因进行实时定量荧光PCR验证 | 第131页 |
| 6.3 实验结果 | 第131-150页 |
| 6.3.1 RNA样本质量检测 | 第131-132页 |
| 6.3.2 原始数据产出及处理后统计 | 第132-133页 |
| 6.3.3 数据的组装与Unigene统计 | 第133页 |
| 6.3.4 全长转录本分析及ORF预测 | 第133-134页 |
| 6.3.5 Unigene功能注释 | 第134-135页 |
| 6.3.6 差异基因筛选 | 第135-137页 |
| 6.3.7 差异基因GO通路富集和KEGG代谢通路分析 | 第137-146页 |
| 6.3.8 参与次生代谢、防御反应和植物激素应答相关差异基因筛选 | 第146-149页 |
| 6.3.9 依赖丹参COI1基因表达的茉莉素应答转录因子筛选 | 第149-150页 |
| 6.4 讨论 | 第150-155页 |
| 6.5 本章小结 | 第155-157页 |
| 第7章 结论与展望 | 第157-161页 |
| 7.1 研究工作总结 | 第157-159页 |
| 7.2 展望 | 第159-161页 |
| 参考文献 | 第161-185页 |
| 附录 | 第185-187页 |
| 致谢 | 第187-189页 |
| 攻读学位期间科研成果 | 第189-190页 |
