| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第14-37页 |
| 1.1 土壤重金属污染及危害 | 第14-16页 |
| 1.2 重金属污染土壤的修复技术 | 第16页 |
| 1.2.1 物理和化学方法 | 第16页 |
| 1.2.2 生物方法 | 第16页 |
| 1.3 植物修复 | 第16-19页 |
| 1.3.1 植物修复策略 | 第16-18页 |
| 1.3.2 植物修复的局限 | 第18页 |
| 1.3.3 微生物强化植物修复 | 第18-19页 |
| 1.4 根瘤菌强化豆科植物修复 | 第19-31页 |
| 1.4.1 豆科植物用于植物修复的优势 | 第19-25页 |
| 1.4.2 根瘤菌对胁迫响应的机制 | 第25-31页 |
| 1.5 重金属对土壤微生物活性及群落结构的影响 | 第31-32页 |
| 1.5.1 重金属对土壤微生物酶活性的影响 | 第31页 |
| 1.5.2 重金属对土壤微生物群落结构的影响 | 第31-32页 |
| 1.6 高通量测序技术在环境微生物群落研究中的应用 | 第32-34页 |
| 1.7 研究内容及技术路线 | 第34-37页 |
| 1.7.1 研究目的 | 第34-35页 |
| 1.7.2 研究内容及技术路线 | 第35-37页 |
| 第二章 重金属污染土壤中微生物多样性及群落结构的研究 | 第37-58页 |
| 2.1 引言 | 第37-38页 |
| 2.2 材料与方法 | 第38-39页 |
| 2.2.1 土壤样品的采集策略 | 第38页 |
| 2.2.2 土壤理化性质的测定 | 第38页 |
| 2.2.3 DNA提取、PCR和 16S rRNA基因V4-V5区测序 | 第38-39页 |
| 2.2.4 16S rRNA基因序列生物信息学分析 | 第39页 |
| 2.2.5 数据统计分析 | 第39页 |
| 2.3 结果与分析 | 第39-55页 |
| 2.3.1 土壤理化因子分析 | 第39-44页 |
| 2.3.2 测序及分类确定 | 第44页 |
| 2.3.3 沉淀池周边土壤中微生物群落结构分析 | 第44页 |
| 2.3.4 土壤微生物群落结构和理化因子的关系 | 第44-51页 |
| 2.3.5 基于两个分组的微生物潜在代谢特征分析 | 第51页 |
| 2.3.6 基于两个分组的微生物指示种分析 | 第51-55页 |
| 2.4 讨论 | 第55-58页 |
| 2.4.1 微生物群落和多样性的变化 | 第55-56页 |
| 2.4.2 主导微生物以及基于两个分组的微生物潜在代谢特征分析 | 第56-57页 |
| 2.4.3 基于两个分组的微生物群落指示种分析 | 第57-58页 |
| 第三章 铅锌矿区刺槐根瘤中具有重金属抗性及促生特性的内生细菌的分离鉴定 | 第58-73页 |
| 3.1 引言 | 第58-59页 |
| 3.2 材料和方法 | 第59-60页 |
| 3.2.1 植物和土壤样品的采集及土壤理化性质的测定 | 第59页 |
| 3.2.2 根瘤内生细菌的分离纯化与保存 | 第59页 |
| 3.2.3 细菌重金属耐受性检测 | 第59页 |
| 3.2.4 细菌ACC脱氨酶活性的检测 | 第59页 |
| 3.2.5 细菌产IAA能力的检测 | 第59页 |
| 3.2.6 细菌产铁载体能力的检测 | 第59-60页 |
| 3.2.7 细菌溶解磷酸钙能力的检测 | 第60页 |
| 3.2.8 细菌 16S rRNA、nod A和nif H基因扩增和测序 | 第60页 |
| 3.2.9 系统发育分析 | 第60页 |
| 3.2.10 选择强化植物修复的优势菌株 | 第60页 |
| 3.3 结果与分析 | 第60-70页 |
| 3.3.1 土壤理化性质 | 第60-61页 |
| 3.3.2 根瘤内可培养细菌的遗传多样性 | 第61-69页 |
| 3.3.3 细菌对重金属的耐受性检测 | 第69页 |
| 3.3.4 细菌的ACC脱氨酶活性及产IAA、铁载体和溶解磷的能力 | 第69-70页 |
| 3.3.5 优势促生菌株的筛选 | 第70页 |
| 3.4 讨论 | 第70-73页 |
| 第四章 重金属污染土壤修复过程中根际土壤微生物群落多样性和功能的研究 | 第73-117页 |
| 4.1 引言 | 第73-74页 |
| 4.2 材料和方法 | 第74-78页 |
| 4.2.1 污染土壤的采集 | 第74页 |
| 4.2.2 试验设计 | 第74-76页 |
| 4.2.3 植物和土壤样品的采集及理化性质的测定 | 第76页 |
| 4.2.4 DNA的提取 | 第76-77页 |
| 4.2.5 PCR、16S rRNA基因V4-V5区测序及生物信息学分析 | 第77页 |
| 4.2.6 宏基因组测序及生物信息学分析 | 第77-78页 |
| 4.2.7 数据统计分析 | 第78页 |
| 4.3 结果与分析 | 第78-114页 |
| 4.3.1 植物修复评价 | 第78-81页 |
| 4.3.2 细菌群落结构和多样性分析（基于 16S rRNA基因V4-V5区测序） | 第81-88页 |
| 4.3.3 环境因子对细菌群落结构的影响 | 第88-89页 |
| 4.3.4 接种和未接种刺槐根际土壤中指示物种分析 | 第89-93页 |
| 4.3.5 重度污染土壤中接种M. loti HZ76对根际细菌群落的影响（基于宏基因组测序） | 第93-100页 |
| 4.3.6 重度污染土壤中接种HZ76对根际细菌功能的影响 | 第100-104页 |
| 4.3.7 重度污染土壤中细菌群落和功能基因之间的关系 | 第104-114页 |
| 4.4 讨论 | 第114-117页 |
| 第五章 重金属污染土壤修复过程中刺槐根和根瘤内微生物群落的研究 | 第117-139页 |
| 5.1 引言 | 第117页 |
| 5.2 材料与方法 | 第117-118页 |
| 5.2.1 温室试验 | 第117页 |
| 5.2.2 样品采集 | 第117-118页 |
| 5.2.3 DNA提取 | 第118页 |
| 5.2.4 PCR、16S rRNA基因V4-V5区测序及生物信息学分析 | 第118页 |
| 5.2.5 数据统计分析 | 第118页 |
| 5.3 结果与分析 | 第118-135页 |
| 5.3.1 测序结果和物种分类 | 第118-123页 |
| 5.3.2 刺槐根、根瘤和根际土的细菌群落结构差异分析 | 第123-128页 |
| 5.3.3 不同根际部位显著富集的OTU比较 | 第128-131页 |
| 5.3.4 根和根瘤从根际土中对特异物种平行选择的过程 | 第131-133页 |
| 5.3.5 根和根瘤中细菌群落潜在的代谢特征分析 | 第133-135页 |
| 5.4 讨论 | 第135-139页 |
| 5.4.1 重金污染土壤中刺槐不同部位细菌群落的变化 | 第135-136页 |
| 5.4.2 根和根瘤中微生物的选择过程 | 第136-137页 |
| 5.4.3 根和根瘤中细菌群落的潜在代谢特征变化 | 第137-139页 |
| 第六章 总结 | 第139-141页 |
| 6.1 结论 | 第139页 |
| 6.1.1 铅锌矿区重金属污染土壤中微生物多样性及群落结构的研究 | 第139页 |
| 6.1.2 铅锌矿区刺槐根瘤中具有重金属抗性及促生特性内生细菌的分离鉴定 | 第139页 |
| 6.1.3 重金属污染土壤修复过程中根际土壤微生物群落多样性和功能的研究 | 第139页 |
| 6.1.4 重金属污染土壤修复过程中刺槐根和根瘤内微生物群落的研究 | 第139页 |
| 6.2 创新点 | 第139-140页 |
| 6.3 研究展望 | 第140-141页 |
| 参考文献 | 第141-169页 |
| 附录 | 第169-174页 |
| 缩略词 | 第174-175页 |
| 致谢 | 第175-177页 |
| 作者简介 | 第177-178页 |
| 发表及待发表的相关学术论文 | 第178页 |
