| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-26页 |
| 1.1 铜绿假单胞菌 | 第13页 |
| 1.2 假单胞菌的生防机理 | 第13-14页 |
| 1.3 主要次级代谢物的合成途径 | 第14-18页 |
| 1.3.1 吩嗪及其衍生物 | 第14-16页 |
| 1.3.2 藤黄绿菌素合成途径 | 第16-17页 |
| 1.3.3 铁载体 | 第17-18页 |
| 1.4 假单胞菌株 M18 中 PCA 和 Plt 合成的调控 | 第18-19页 |
| 1.5 双元调控系统 GacS/GacA | 第19-22页 |
| 1.5.1 双元系统简介 | 第19-21页 |
| 1.5.2 GacS/GacA 双元系统组成 | 第21-22页 |
| 1.6 假单胞菌的分泌系统 | 第22-24页 |
| 1.7 假单胞菌转录组研究 | 第24-25页 |
| 1.7.1 转录组概述 | 第24页 |
| 1.7.2 假单胞菌转录组研究进展 | 第24-25页 |
| 1.8 本课题研究目的、内容与意义 | 第25-26页 |
| 1.8.1 研究目的 | 第25页 |
| 1.8.2 研究内容 | 第25页 |
| 1.8.3 研究意义 | 第25-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-30页 |
| 2.1 培养基 | 第26-27页 |
| 2.2 菌株培养条件 | 第27页 |
| 2.3 DNA 操作技术 | 第27页 |
| 2.4 PCA, Plt 和 PYO 的定量分析 | 第27页 |
| 2.5 感受态细胞的制备 | 第27-28页 |
| 2.6 β-半乳糖苷酶活性的测定 | 第28页 |
| 2.7 qRT-PCR | 第28页 |
| 2.8 GacA 表达载体的构建及蛋白表达检测 | 第28-30页 |
| 第三章 P.aeruginosa M18 中 gacA 对转录组的全局性影响 | 第30-41页 |
| 引言 | 第30页 |
| 3.1 材料方法 | 第30-33页 |
| 3.1.1 菌株，质粒与引物 | 第30-32页 |
| 3.1.2 数据分析 | 第32页 |
| 3.1.3 荧光定量反转录 PCR | 第32-33页 |
| 3.1.4 质粒构建 | 第33页 |
| 3.1.5 酶活检测 | 第33页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第33-40页 |
| 3.2.1 转录组学验证实验 | 第33-36页 |
| 3.2.2 M18 与 M18gacA 转录组总体比较分析 | 第36-37页 |
| 3.2.3 GacA 特异调控基因的 COG 分类 | 第37-39页 |
| 3.2.4 GacA 对转录调控系统或因子的影响 | 第39-40页 |
| 3.3 本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 gacA 对次级代谢的调控研究 | 第41-54页 |
| 引言 | 第41页 |
| 4.1 材料与方法 | 第41-43页 |
| 4.1.1 菌株与质粒 | 第41-42页 |
| 4.1.2 PYO, PCA, Plt 产量测定 | 第42页 |
| 4.1.3 铁载体定性检测 | 第42-43页 |
| 4.1.4 氢氰酸定性检测 | 第43页 |
| 4.1.5 gacA 对 Plt 调控机制研究 | 第43页 |
| 4.2 结果与分析 | 第43-52页 |
| 4.2.1 gacA 对 M18 次级代谢的组学分析 | 第43-46页 |
| 4.2.2 gacA 正调控 Plt 合成 | 第46-47页 |
| 4.2.3 gacA 负调控 PCA 合成 | 第47页 |
| 4.2.4 GacA 互补实验 | 第47-48页 |
| 4.2.5 gacA 正调控铁载体合成 | 第48-49页 |
| 4.2.6 gacA 正调控 HCN 合成 | 第49-50页 |
| 4.2.7 gacA 转录水平正调控 pltL | 第50-51页 |
| 4.2.8 gacA 转录后水平正调控 pltR | 第51页 |
| 4.2.9 rsmY 对 pltL 和 pltR 的调控研究 | 第51-52页 |
| 4.3 本章小结 | 第52-54页 |
| 第五章 gacA 对初级代谢的调控研究 | 第54-60页 |
| 引言 | 第54页 |
| 5.1 材料与方法 | 第54-55页 |
| 5.1.1 菌株与培养条件 | 第54页 |
| 5.1.2 测定 P 元素利用率 | 第54-55页 |
| 5.1.3 测定 S 元素利用率 | 第55页 |
| 5.1.4 测定 N 元素利用率 | 第55页 |
| 5.2 结果与分析 | 第55-58页 |
| 5.2.1 gacA 对 M18 初级代谢的组学分析 | 第55-57页 |
| 5.2.2 gacA 负调控 P 元素利用 | 第57页 |
| 5.2.3 gacA 正调控 N 元素利用 | 第57页 |
| 5.2.4 gacA 负调控 S 元素利用 | 第57-58页 |
| 5.3 本章小结 | 第58-60页 |
| 第六章 gacA 对运动性和分泌系统的调控研究 | 第60-69页 |
| 引言 | 第60-61页 |
| 6.1 材料与方法 | 第61-62页 |
| 6.1.1 菌株，质粒与引物 | 第61页 |
| 6.1.2 质粒构建 | 第61-62页 |
| 6.1.3 运动性检测 | 第62页 |
| 6.2 结果 | 第62-67页 |
| 6.2.1 gacA 对分泌系统的组学分析 | 第62-65页 |
| 6.2.2 gacA 对分泌系统的影响 | 第65-66页 |
| 6.2.3 gacA 对 M18 运动性的影响 | 第66-67页 |
| 6.3 本章小结 | 第67-69页 |
| 第七章 结论与展望 | 第69-72页 |
| 参考文献 | 第72-79页 |
| 附录 转录组学研究结果 | 第79-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 攻读学位期间（待）发表的学术论文 | 第106页 |
