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乌鳢养殖围隔沉积物中厌氧氨氧化菌群落结构及与环境因子的关系

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
引言第10-11页
第一章 文献综述第11-20页
    1.1 高产淡水养殖池塘特征第11页
    1.2 淡水养殖环境氮循环第11-12页
    1.3 淡水养殖水体氨氮失衡第12-13页
    1.4 养殖水体氨氮处理方法第13页
    1.5 厌氧氨氧化菌研究进展第13-19页
        1.5.1 厌氧氨氧化第13-14页
        1.5.2 厌氧氨氧化菌第14-15页
        1.5.3 厌氧氨氧化菌的代谢第15-16页
        1.5.4 厌氧氨氧化菌已知物种第16页
        1.5.5 厌氧氨氧化菌探测方法第16-17页
        1.5.6 厌氧氨氧化菌在自然生态系统中的分布第17-19页
    1.6 本论文研究背景和意义第19-20页
第二章 乌鳢养殖围隔沉积物中微生物群落结构分析第20-35页
    2.1 材料和方法第20-24页
        2.1.1 实验围隔第20-21页
        2.1.2 样品采集第21页
        2.1.3 沉积物总DNA的提取第21页
        2.1.4 PCR扩增 16S rRNA第21页
        2.1.5 变性梯度凝胶电泳(DGGE)第21-22页
        2.1.6 目的条带割胶回收与克隆测序第22-23页
        2.1.7 数据分析第23-24页
    2.2 结果与分析第24-32页
        2.2.1 变性梯度凝胶电泳图谱分析第24页
        2.2.2 微生物群落的聚类分析第24-27页
        2.2.3 微生物 16S r DNA序列及系统发育分析第27-31页
        2.2.4 乌鳢和草鱼围隔沉积物微生物群落的差异第31页
        2.2.5 乌鳢和草鱼围隔沉积物微生物群落月间的变化第31-32页
    2.3 讨论第32-34页
    2.4 小结第34-35页
第三章 乌鳢养殖围隔厌氧氨氧化菌群落结构及其与环境因子的关系第35-49页
    3.1 材料和方法第35-37页
        3.1.1 实验围隔概况第35-36页
        3.1.2 样品采集第36页
        3.1.3 沉积物环境因子第36页
        3.1.4 DNA的提取第36页
        3.1.5 特异基因片段的PCR扩增及测序第36-37页
        3.1.6 数据分析第37页
    3.2 结果与分析第37-46页
        3.2.1 沉积物环境因子测定结果第37-38页
        3.2.2 高通量测序结果及厌氧氨氧化菌群落结构第38-42页
        3.2.3 厌氧氨氧化菌群落的聚类分析第42页
        3.2.4 月份间厌氧氨氧化菌群落结构的差异第42-43页
        3.2.5 厌氧氨氧化菌群落结构与环境因子的关系第43-46页
    3.3 讨论第46-48页
    3.4 小结第48-49页
全文总结第49页
展望第49-50页
参考文献第50-58页
在读期间拟发表的文章第58-59页
致谢第59页

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