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粗糙脉孢菌SCF型泛素连接酶组装与去组装调控机制的研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
缩略词第8-9页
第一章 引言第9-45页
    1.1 蛋白质稳态及其维持第9-11页
    1.2 泛素-蛋白酶体途径第11-15页
        1.2.1 泛素及泛素化修饰第11-13页
        1.2.2 蛋白酶体第13-15页
    1.3 泛素连接酶第15-17页
        1.3.1 HECT型泛素连接酶第16页
        1.3.2 RING-finger型泛素连接酶第16页
        1.3.3 RBR型泛素连接酶第16-17页
    1.4 CRL型泛素连接酶第17-36页
        1.4.1 Cul1与SCF泛素连接酶第19-27页
        1.4.2 Cul2/Cul5和泛素连接酶ECS第27-30页
        1.4.3 CRL3泛素连接酶第30-32页
        1.4.4 CRL4泛素连接酶第32-35页
        1.4.5 CRL7泛素连接酶第35-36页
    1.5 CRL组装与活性的动态调节第36-44页
        1.5.1 Nedd8分子和Nedd8修饰(neddylation)第37-39页
        1.5.2 COP9信号体和Cullin蛋白的去Nedd8修饰第39-42页
        1.5.3 CSN悖论(CSN paradox)第42-44页
    1.6 本课题的研究内容及意义第44-45页
第二章 材料与方法第45-63页
    2.1 培养基第45-48页
        2.1.1 LB培养基第45页
        2.1.2 Trace element储液第45页
        2.1.3 50× Vogel's salt第45-46页
        2.1.4 0.5 M QA第46页
        2.1.5 Minimal media第46页
        2.1.6 Minmal slants第46-47页
        2.1.7 Race tube培养基(300 mL)第47页
        2.1.8 10×Fig's第47页
        2.1.9 Bottom agar/Top agar第47页
        2.1.10 2×Westergaard's salt(1 L)第47-48页
        2.1.11 crossing plate+ His(1 L)第48页
    2.2 菌株第48页
    2.3 实验方法第48-63页
        2.3.1 基因组DNA的提取第48-49页
        2.3.2 载体构建第49-52页
        2.3.3 电穿孔转化第52-53页
        2.3.4 杂交第53页
        2.3.5 孢子萌发第53页
        2.3.6 粗糙脉孢菌基因敲除(Knock out)菌株的构建第53-54页
        2.3.7 表型分析第54-55页
        2.3.8 可溶性蛋白质提取第55页
        2.3.9 蛋白质免疫印迹(Western blot)第55-57页
        2.3.10 蛋白质降解第57页
        2.3.11 免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)第57-58页
        2.3.12 原核蛋白表达及纯化第58-61页
        2.3.13 多克隆抗体制备第61-63页
第三章 Cul1~(Nedd8)/Cul1可作为粗糙脉孢菌生理和发育的指标第63-70页
    3.1 cul1~(K722R)点突变菌株与csn突变体表型相似第63-66页
    3.2 Cul1~(Nedd8)/Cul1可以反映粗糙脉孢菌的生长和发育情况第66-68页
    3.3 小结与讨论第68-70页
第四章 通过诱导表达Cul1~(K722R)蛋白降低Cul1~(Nedd8)/Cul1比率能够救回csn突变体的表型缺陷第70-86页
    4.1 诱导表达Cul1~(K722R)蛋白能够救回csn突变体的表型缺陷第70-76页
    4.2 诱导表达Cul1~(K722R)蛋白能够降低csn突变体中的Cul1~(Nedd8)/Cul1比值第76-80页
    4.3 诱导表达Cul1~(K722R)能够救回csn-3~(KO)和339-59菌株的表型缺陷第80-84页
    4.4 小结与讨论第84-86页
第五章 Cul1~(K722R)通过与底物识别模块形成复合体而稳定F-box蛋白第86-96页
    5.1 没有Nedd8修饰的Cul1具有稳定F-box蛋白的作用第86-90页
    5.2 Cul1~(K722R)通过与Skp-1-F-box模块相互作用来稳定F-box蛋白第90-95页
    5.3 小结与讨论第95-96页
第六章 结论与展望第96-97页
参考文献第97-112页
致谢第112-113页
附录第113-118页
简历第118页

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