| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-21页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.2 宏基因组组装相关概念 | 第9-15页 |
| 1.2.1 DNA和RNA | 第9页 |
| 1.2.2 基因、基因组和宏基因组 | 第9-10页 |
| 1.2.3 DNA测序 | 第10-12页 |
| 1.2.4 微生物群落 | 第12-13页 |
| 1.2.5 宏基因组学研究过程 | 第13页 |
| 1.2.6 宏基因组组装 | 第13-15页 |
| 1.3 宏基因组序列组装问题 | 第15-19页 |
| 1.3.1 归类 | 第15-17页 |
| 1.3.2 拼接 | 第17-19页 |
| 1.3.3 研究现状 | 第19页 |
| 1.4 论文主要研究内容 | 第19-20页 |
| 1.5 论文结构安排 | 第20-21页 |
| 第2章 CLUSTERH：基于DE BRUIJN图的宏基因组组装算法 | 第21-35页 |
| 2.1 问题及符号定义 | 第21-25页 |
| 2.2 组装方法 | 第25-30页 |
| 2.2.1 构建De Bruijn图 | 第27-29页 |
| 2.2.2 划分De Bruijn图 | 第29-30页 |
| 2.2.3 多序列比对 | 第30页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第30-34页 |
| 2.3.1 实验数据 | 第30-31页 |
| 2.3.2 性能分析指标 | 第31页 |
| 2.3.3 实验结果与分析 | 第31-34页 |
| 2.4 本章小结 | 第34-35页 |
| 第3章 CLUSTERH软件的设计与实现 | 第35-40页 |
| 3.1 CLUSTERH测试软件包的介绍 | 第35-39页 |
| 3.2 本章小结 | 第39-40页 |
| 第4章 结束语 | 第40-41页 |
| 4.1 总结 | 第40页 |
| 4.2 展望 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-44页 |
| 附录1 | 第44-45页 |
| 攻读硕士期间发表论文 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |