| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1.1 水产养殖的病害 | 第10页 |
| 1.2 爱德华氏菌 | 第10页 |
| 1.3 杀鱼爱德华氏菌 | 第10-12页 |
| 1.3.1 理化特性 | 第10页 |
| 1.3.2 杀鱼爱德华氏菌的危害 | 第10-11页 |
| 1.3.3 感染过程 | 第11-12页 |
| 1.4 杀鱼爱德华氏菌的主要毒力因子 | 第12-17页 |
| 1.4.1 溶血素 | 第12页 |
| 1.4.2 三型分泌系统(T3SS) | 第12-15页 |
| 1.4.3 六型分泌系统(T6SS) | 第15-17页 |
| 1.5 病原菌主要毒力调控元件 | 第17-18页 |
| 1.5.1 EsrA-EsrB双组分系统 | 第17-18页 |
| 1.5.2 PhoQ-PhoP双组分系统 | 第18页 |
| 1.6 铁摄取系统 | 第18-20页 |
| 1.6.1 铁摄取系统的重要性 | 第18-19页 |
| 1.6.2 fur基因及其表达的蛋白 | 第19-20页 |
| 1.7 cAMP的胞内功能 | 第20-21页 |
| 1.8 课题研究内容与意义 | 第21-22页 |
| 第2章 E. piscicida EIB202转录谱分析 | 第22-29页 |
| 2.1 前言 | 第22页 |
| 2.2 实验材料 | 第22-23页 |
| 2.2.1 菌株 | 第22页 |
| 2.2.2 培养基、试剂与设备仪器 | 第22-23页 |
| 2.2.3 生物数据库及信息分析软件 | 第23页 |
| 2.3 实验方法 | 第23-25页 |
| 2.3.1 E. piscicida EIB202转录组分析 | 第23-24页 |
| 2.3.2 qRT-PCR(实时荧光定量PCR) | 第24-25页 |
| 2.4 实验结果 | 第25-28页 |
| 2.4.1 链特异性RNA-Seq结果重复性分析 | 第25页 |
| 2.4.2 转录谱的差异分析 | 第25-28页 |
| 2.5 讨论 | 第28页 |
| 2.6 本章小结 | 第28-29页 |
| 第3章 E. piscicida EIB202铁摄取相关基因的筛查 | 第29-34页 |
| 3.1 前言 | 第29页 |
| 3.2 实验材料 | 第29-30页 |
| 3.2.1 菌株及质粒 | 第29页 |
| 3.2.2 试剂、培养基与实验器材 | 第29-30页 |
| 3.3 实验方法 | 第30-31页 |
| 3.3.1 转座子插入突变株文库的构建 | 第30页 |
| 3.3.2 限铁条件下转座子插入突变体文库的筛选 | 第30-31页 |
| 3.4 实验结果 | 第31-33页 |
| 3.4.1 转座子突变体文库中筛选铁摄取相关基因 | 第31页 |
| 3.4.2 铁载体合成与转运基因簇的同源比对 | 第31-33页 |
| 3.5 讨论 | 第33页 |
| 3.6 本章小结 | 第33-34页 |
| 第4章 Fur蛋白的下游调控机制 | 第34-51页 |
| 4.1 前言 | 第34页 |
| 4.2 实验材料 | 第34页 |
| 4.3 实验方法 | 第34-40页 |
| 4.3.1 菌株构建 | 第34-36页 |
| 4.3.2 染色质免疫共沉淀-二代测序技术(ChIP-seq) | 第36-39页 |
| 4.3.3 Fur蛋白的表达纯化 | 第39-40页 |
| 4.3.4 凝胶迁移阻滞实验(EMSA) | 第40页 |
| 4.4 实验结果 | 第40-49页 |
| 4.4.1 fur回补菌株的功能验证 | 第40页 |
| 4.4.2 ChIP-seq筛选Fur蛋白直接调控的DNA序列 | 第40-47页 |
| 4.4.3 Fur蛋白的binding box分析 | 第47页 |
| 4.4.4 体内及体外实验验证ChIP-seq实验结果 | 第47-49页 |
| 4.5 讨论 | 第49-50页 |
| 4.6 本章小结 | 第50-51页 |
| 第5章 Fur对cAMP的调控作用 | 第51-54页 |
| 5.1 前言 | 第51页 |
| 5.2 实验材料 | 第51-52页 |
| 5.3 实验方法 | 第52页 |
| 5.3.1 △icc的构建 | 第52页 |
| 5.3.2 菌体内cAMP水平的检测 | 第52页 |
| 5.4 实验结果 | 第52页 |
| 5.4.1 Fur参与了胞内cAMP水平的调控 | 第52页 |
| 5.5 讨论 | 第52-53页 |
| 5.6 本章小结 | 第53-54页 |
| 第6章 EsrB的比较蛋白组学分析 | 第54-63页 |
| 6.1 前言 | 第54页 |
| 6.2 实验材料 | 第54-56页 |
| 6.2.1 菌株、质粒及引物 | 第54页 |
| 6.2.2 主要设备仪器及试剂 | 第54-55页 |
| 6.2.3 软件分析及技术 | 第55-56页 |
| 6.3 实验方法 | 第56-57页 |
| 6.3.1 双向电泳 | 第56-57页 |
| 6.3.2 差异蛋白点分析 | 第57页 |
| 6.4 实验结果 | 第57-61页 |
| 6.4.1 E. piscicida野生株和AesrB的比较蛋白组学分析 | 第57-60页 |
| 6.4.2 qRT-PCR的验证分析 | 第60页 |
| 6.4.3 生长曲线的测定 | 第60-61页 |
| 6.5 讨论 | 第61-62页 |
| 6.6 本章小结 | 第62-63页 |
| 第7章 结论与展望 | 第63-64页 |
| 7.1 主要结论 | 第63页 |
| 7.2 展望 | 第63-64页 |
| 中英文缩写对照 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-71页 |
| 攻读硕士学位期间的论文成果 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
