| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-24页 |
| 1.1 引言 | 第10页 |
| 1.2 染色质三维结构研究概述 | 第10-12页 |
| 1.2.1 染色质三维结构 | 第11页 |
| 1.2.2 三维基因组学 | 第11-12页 |
| 1.3 染色质构象捕获(3C)及衍生技术 | 第12-15页 |
| 1.3.1 3C及衍生技术的功能 | 第12-13页 |
| 1.3.2 Hi-C技术特征 | 第13-15页 |
| 1.4 三维基因组研究 | 第15-21页 |
| 1.4.1 三维基因组调控网络 | 第16-17页 |
| 1.4.2 三维基因组建模方法 | 第17-20页 |
| 1.4.3 染色质组织动态研究 | 第20-21页 |
| 1.5 研究内容与意义 | 第21-22页 |
| 1.5.1 研究内容 | 第21页 |
| 1.5.2 研究意义 | 第21-22页 |
| 1.6 论文结构 | 第22-24页 |
| 第二章 染色质多重相互作用及其关联网络动态分析 | 第24-34页 |
| 2.1 引言 | 第24-25页 |
| 2.2 数据和方法 | 第25-27页 |
| 2.2.1 染色质多重相互作用位点识别 | 第25-26页 |
| 2.2.2 染色质多重相互作用关联网络识别 | 第26页 |
| 2.2.3 染色质多重相互作用关联基因网络提取与表达分析 | 第26-27页 |
| 2.3 结果与分析 | 第27-32页 |
| 2.3.1 多重相互作用位点数目的统计与分布 | 第27-28页 |
| 2.3.2 相互作用网络形态与集中度 | 第28-30页 |
| 2.3.3 基因网络组成与表达特征 | 第30-32页 |
| 2.4 本章小结 | 第32-34页 |
| 第三章 染色质三维结构动态研究 | 第34-48页 |
| 3.1 引言 | 第34-35页 |
| 3.2 数据与方法 | 第35-41页 |
| 3.2.1 三维结构建模原理与流程 | 第35-37页 |
| 3.2.2 基于MDS算法的三维结构建模 | 第37-39页 |
| 3.2.3 基于染色质间互作数据的修正模型 | 第39-41页 |
| 3.3 结果与分析 | 第41-46页 |
| 3.3.1 三维结构位点间位置与方向角波动 | 第41-42页 |
| 3.3.2 三维结构保守性与活跃度保守性分析 | 第42-43页 |
| 3.3.3 表观遗传修饰在三维结构中的分布 | 第43-46页 |
| 3.4 本章小节 | 第46-48页 |
| 第四章 总结与展望 | 第48-50页 |
| 4.1 总结 | 第48页 |
| 4.2 展望 | 第48-50页 |
| 致谢 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 附录 | 第58-59页 |
| 作者简介 | 第59页 |