| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 多靶标弱结合药物的概念与研究现状 | 第12-15页 |
| 1.2 多靶标弱结合药物的特征 | 第15-17页 |
| 1.2.1 多向药理学特性 | 第15-16页 |
| 1.2.2 亲和力和动力学 | 第16-17页 |
| 1.3 筛选弱结合药物的方法 | 第17-18页 |
| 1.3.1 实验的方法 | 第17-18页 |
| 1.3.2 计算的方法 | 第18页 |
| 1.4 系统药理学方法 | 第18-19页 |
| 1.5 本文研究内容 | 第19-22页 |
| 第二章 理论与实验方法介绍 | 第22-32页 |
| 2.1 系统药理学方法 | 第22-26页 |
| 2.1.1 基元模块和信号通路模拟 | 第22-24页 |
| 2.1.2 小分子化合物ADME/T预测 | 第24-25页 |
| 2.1.3 药物靶标预测 | 第25-26页 |
| 2.2 分子动力学模拟 | 第26-28页 |
| 2.2.1 分子对接 | 第26-27页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟与结合自由能计算 | 第27-28页 |
| 2.3 结合力检测与药效学实验 | 第28-31页 |
| 2.3.1 激酶抑制酶学检测 | 第28-29页 |
| 2.3.2 细胞炎症模型 | 第29-30页 |
| 2.3.3 细胞炎性因子检测 | 第30-31页 |
| 2.4 本章小结 | 第31-32页 |
| 第三章 利用网络基元模块模拟药物多靶点扰动 | 第32-46页 |
| 3.1 引言 | 第32-34页 |
| 3.2 方法 | 第34-37页 |
| 3.2.1 网络基元模块描述 | 第34-35页 |
| 3.2.2 速率方程 | 第35-36页 |
| 3.2.3 网络基元模块扰动模拟 | 第36-37页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第37-45页 |
| 3.3.1 常见的网络基元模块 | 第37-39页 |
| 3.3.2 并联与串联基元模块 | 第39-40页 |
| 3.3.3 药物扰动下的网络基元模块响应 | 第40-45页 |
| 3.4 本章小结 | 第45-46页 |
| 第四章 应用基元模块寻找MAPK信号通路最优靶标组合 | 第46-58页 |
| 4.1 引言 | 第46-47页 |
| 4.2 材料与方法 | 第47-53页 |
| 4.2.1 MAPK信号通路模拟 | 第47-53页 |
| 4.2.2 模拟药物对信号通路的扰动 | 第53页 |
| 4.3 结果和讨论 | 第53-56页 |
| 4.3.1 MAPK信号通路与炎症响应 | 第53-54页 |
| 4.3.2 模拟扰动寻找最优靶标组合 | 第54-56页 |
| 4.4 本章小结 | 第56-58页 |
| 第五章 基于MAPK信号通路筛选有效的弱结合药物 | 第58-72页 |
| 5.1 引言 | 第58-59页 |
| 5.2 材料方法 | 第59-61页 |
| 5.2.1 化合物库与靶标预测 | 第59-60页 |
| 5.2.2 分子动力学模拟与结合自由能计算 | 第60页 |
| 5.2.3 化合物亲和力测定，药效模拟和抗炎实验验证 | 第60-61页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第61-70页 |
| 5.3.1 系统药理学筛选多靶标化合物 | 第61-66页 |
| 5.3.2 多靶标弱结合化合物的亲和力 | 第66-68页 |
| 5.3.3 多靶标弱结合化合物的药效模拟和验证 | 第68-70页 |
| 5.4 本章小结 | 第70-72页 |
| 第六章 结论与展望 | 第72-74页 |
| 6.1 结论 | 第72-73页 |
| 6.2 展望 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-84页 |
| 缩略词 | 第84-86页 |
| 致谢 | 第86-88页 |
| 作者简介 | 第88页 |