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几种经济植物可变剪接预测及分析

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
第一章 前言第11-17页
    1.1 可变剪接简介第11页
    1.2 可变剪接的生物功能第11-12页
    1.3 可变剪接的分子机制第12-13页
    1.4 可变剪接的类型第13-14页
    1.5 可变剪接的特点第14-15页
    1.6 经济植物中华猕猴桃与大豆第15-17页
第二章 中华猕猴桃基因组可变剪接鉴定及分析第17-30页
    2.1 引言第17页
    2.2 实验材料与方法第17-19页
        2.2.1 猴桃基因组及组织转录组数据下载第17页
        2.2.2 数据的质量过滤及可变剪接事件鉴定第17-18页
        2.2.3 GO富集分析及猕猴桃维生素功能相关基因分析第18-19页
    2.3 结果与分析第19-27页
        2.3.1 猕猴桃基因组可变剪接事件鉴定第19-21页
        2.3.2 猕猴桃基因组可变剪接基因GO注释及富集分析第21-24页
        2.3.3 猕猴桃维生素相关基因表达差异分析第24-27页
    2.4 讨论与结论第27-30页
第三章 大豆基因组可变剪接鉴定及分析第30-42页
    3.1 引言第30页
    3.2 材料和方法第30-32页
        3.2.1 大豆基因组及组织转录组数据下载第30-31页
        3.2.2 数据的质量过滤及可变剪接事件鉴定第31页
        3.2.3 GO富集分析及大豆油脂相关基因的表达分析第31-32页
    3.3 结果与分析第32-39页
        3.3.1 大豆基因组可变剪接事件鉴定第32-35页
        3.3.2 大豆基因组可变剪接基因GO注释及富集分析第35-37页
        3.3.3 大豆转录因子的可变剪切事件分析第37-39页
    3.4 讨论第39-42页
第四章 多物种间保守可变剪接基因分析第42-48页
    4.1 引言第42页
    4.2 实验材料与方法第42-44页
        4.2.1 基因组可变剪接基因数据第42-43页
        4.2.2 大豆与猕猴桃基因组可变剪接事件第43页
        4.2.3 保守可变剪接基因鉴定第43页
        4.2.4 GO富集分析及基因结构分析第43-44页
    4.3 结果与分析第44-47页
        4.3.1 大豆与猕猴桃基因组可变剪接事件第44页
        4.3.2 保守可变剪接基因GO富集分析第44-47页
    4.4 讨论第47-48页
第五章 总讨论第48-50页
参考文献第50-57页
致谢第57-59页
附录A 硕士学位期间发表文章第59-60页
附录B 保守可变剪接基因生理学途径富集结果第60-64页
附录C 保守可变剪接基因细胞学组件富集结果第64-66页
附录D 保守可变剪接基因分子功能富集结果第66页

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