摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
第一章 前言 | 第11-17页 |
1.1 可变剪接简介 | 第11页 |
1.2 可变剪接的生物功能 | 第11-12页 |
1.3 可变剪接的分子机制 | 第12-13页 |
1.4 可变剪接的类型 | 第13-14页 |
1.5 可变剪接的特点 | 第14-15页 |
1.6 经济植物中华猕猴桃与大豆 | 第15-17页 |
第二章 中华猕猴桃基因组可变剪接鉴定及分析 | 第17-30页 |
2.1 引言 | 第17页 |
2.2 实验材料与方法 | 第17-19页 |
2.2.1 猴桃基因组及组织转录组数据下载 | 第17页 |
2.2.2 数据的质量过滤及可变剪接事件鉴定 | 第17-18页 |
2.2.3 GO富集分析及猕猴桃维生素功能相关基因分析 | 第18-19页 |
2.3 结果与分析 | 第19-27页 |
2.3.1 猕猴桃基因组可变剪接事件鉴定 | 第19-21页 |
2.3.2 猕猴桃基因组可变剪接基因GO注释及富集分析 | 第21-24页 |
2.3.3 猕猴桃维生素相关基因表达差异分析 | 第24-27页 |
2.4 讨论与结论 | 第27-30页 |
第三章 大豆基因组可变剪接鉴定及分析 | 第30-42页 |
3.1 引言 | 第30页 |
3.2 材料和方法 | 第30-32页 |
3.2.1 大豆基因组及组织转录组数据下载 | 第30-31页 |
3.2.2 数据的质量过滤及可变剪接事件鉴定 | 第31页 |
3.2.3 GO富集分析及大豆油脂相关基因的表达分析 | 第31-32页 |
3.3 结果与分析 | 第32-39页 |
3.3.1 大豆基因组可变剪接事件鉴定 | 第32-35页 |
3.3.2 大豆基因组可变剪接基因GO注释及富集分析 | 第35-37页 |
3.3.3 大豆转录因子的可变剪切事件分析 | 第37-39页 |
3.4 讨论 | 第39-42页 |
第四章 多物种间保守可变剪接基因分析 | 第42-48页 |
4.1 引言 | 第42页 |
4.2 实验材料与方法 | 第42-44页 |
4.2.1 基因组可变剪接基因数据 | 第42-43页 |
4.2.2 大豆与猕猴桃基因组可变剪接事件 | 第43页 |
4.2.3 保守可变剪接基因鉴定 | 第43页 |
4.2.4 GO富集分析及基因结构分析 | 第43-44页 |
4.3 结果与分析 | 第44-47页 |
4.3.1 大豆与猕猴桃基因组可变剪接事件 | 第44页 |
4.3.2 保守可变剪接基因GO富集分析 | 第44-47页 |
4.4 讨论 | 第47-48页 |
第五章 总讨论 | 第48-50页 |
参考文献 | 第50-57页 |
致谢 | 第57-59页 |
附录A 硕士学位期间发表文章 | 第59-60页 |
附录B 保守可变剪接基因生理学途径富集结果 | 第60-64页 |
附录C 保守可变剪接基因细胞学组件富集结果 | 第64-66页 |
附录D 保守可变剪接基因分子功能富集结果 | 第66页 |