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腾冲嗜热厌氧杆菌EndoTT作用的分子机制研究

摘要第3-4页
Summary第4-5页
缩略词、符号中英文对照表第8-10页
氨基酸缩写表第10-11页
第一章 文献综述第11-20页
    1 嗜热微生物第11-12页
        1.1 嗜热微生物的特征及分类第11页
        1.2 嗜热微生物的嗜热机制第11-12页
    2 腾冲嗜热厌氧杆菌第12-14页
        2.1 腾冲嗜热厌氧杆菌的一般特征及基因组第12-13页
        2.2 腾冲嗜热厌氧杆菌的研究进展第13-14页
    3 单链DNA结合蛋白的概述第14-17页
        3.1 单链DNA结合蛋白的起源第14页
        3.2 单链DNA结合蛋白的特征及分类第14-15页
        3.3 单链DNA结合蛋白的生理功能第15页
        3.4 单链DNA结合蛋白的作用及机制第15页
        3.5 极端环境微生物单链DNA结合蛋白功能和结构特征第15-16页
        3.6 腾冲嗜热厌氧杆菌单链DNA结合蛋白的研究第16-17页
        3.7 单链DNA结合蛋白的应用前景第17页
    4 RNA测序第17-20页
        4.1 RNA测序的概述第17页
        4.2 RNA测序技术的发展第17-18页
        4.3 RNA测序在转录组中的应用第18-20页
第二章 腾冲嗜热厌氧杆菌EndoTT回补株的构建第20-30页
    1 材料与方法第20-27页
        1.1 材料第20-22页
            1.1.1 菌种与载体第20页
            1.1.2 主要试剂第20-21页
            1.1.3 主要仪器设备第21页
            1.1.4 主要溶液及缓冲液配制第21-22页
            1.1.5 主要培养基配制第22页
        1.2 方法第22-25页
            1.2.1 引物寡核苷酸序列第22页
            1.2.2 腾冲嗜热厌氧杆菌的活化和培养第22-23页
            1.2.3 腾冲嗜热厌氧杆菌全基因组提取(CTAB法)第23页
            1.2.4 大肠杆菌Ca Cl2感受态的制备及其转化第23-24页
            1.2.5 大肠杆菌质粒的提取第24页
            1.2.6 DNA片段的凝胶回收(试剂盒法)第24-25页
        1.3 EndoTT回补重组质粒的构建第25-27页
            1.3.1 ssb1右臂、ssb1左臂、endoTTS、endoTTB、endoTT基因克隆第25页
            1.3.2 ΔendoTT::endoTT、ΔendoTT::endoTTS、ΔendoTT::endoTTB回补质粒的构建第25-26页
            1.3.3 Endo TT回补株的构建及鉴定第26-27页
    2 结果第27-29页
        2.1 ssb1右臂、ssb1左臂及endoTTS、endoTTB、endoTT PCR扩增第27页
        2.2 重组质粒A(MB::PAT erm::ssb1右臂)的双酶切鉴定第27-28页
        2.3 回补重组质粒ΔendoTT:: endoTT、ΔendoTT::endoTTS、ΔendoTT::endoTTB双酶切验证第28页
        2.4 EndoTT回补株的鉴定第28页
        2.5 生长曲线第28-29页
    3 讨论第29-30页
第三章 腾冲嗜热厌氧杆菌ΔendoTT在不同温度下的转录组分析第30-40页
    1 材料与方法第30-32页
        1.1 菌株第30页
        1.2 腾冲嗜热厌氧杆菌总RNA的提取第30-31页
        1.3 mRNA的富集第31页
        1.4 RNA文库构建第31页
        1.5 测序结果处理第31页
        1.6 差异表达基因(DEGs)分析第31-32页
        1.7 差异表达基因的GO和KEGG分析第32页
    2 结果第32-38页
        2.1 测序结果第32-33页
        2.2 DEGs分析结果第33-36页
        2.3 在特定温度下显著表达的基因第36页
        2.4 GO和KEGG分析第36-37页
        2.5 ABC转运系统第37-38页
    3 讨论第38-40页
第四章 实时定量PCR第40-43页
    1 材料与方法第40-41页
        1.1 菌株与引物第40页
        1.2 腾冲嗜热厌氧管杆菌总RNA提取第40页
        1.3 RNA样品中基因组DNA的处理第40-41页
        1.4 cDNA的合成第41页
        1.5 实时定量PCR第41页
    2 结果第41-42页
    3 讨论第42-43页
小结第43-44页
参考文献第44-51页
致谢第51-52页
作者简介第52-53页
导师简介第53-54页

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