| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 部分缩略语 | 第10-11页 |
| 前言 | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-23页 |
| 第一章 早期胚胎发育的研究 | 第12-18页 |
| ·配子的成熟与受精 | 第12-14页 |
| ·卵母细胞的成熟 | 第12页 |
| ·精子获能 | 第12-13页 |
| ·受精 | 第13-14页 |
| ·早期胚胎的发育 | 第14-16页 |
| ·早期胚胎发育的过程 | 第14页 |
| ·早期胚胎发育的相关基因 | 第14-16页 |
| ·早期胚胎体外培养 | 第16页 |
| ·牦牛体外受精的研究 | 第16-18页 |
| 第二章 单细胞RNA-seq的研究概况 | 第18-23页 |
| ·RNA-seq技术概述 | 第18-20页 |
| ·单细胞转录测序的应用 | 第20-21页 |
| ·牛早期胚胎发育的转录组学研究 | 第21-23页 |
| 第二部分 实验部分 | 第23-58页 |
| 第三章 牦牛胚胎的体外生产 | 第23-28页 |
| ·试剂与材料 | 第23-25页 |
| ·试验动物 | 第23页 |
| ·主要仪器设备 | 第23页 |
| ·试剂与牦材 | 第23-24页 |
| ·试剂配制 | 第24-25页 |
| ·试验方法 | 第25-26页 |
| ·卵母细胞的体外成熟（In vitro maturation, IVM） | 第25页 |
| ·体外受精（In vitro fertilization, IVF） | 第25-26页 |
| ·胚胎培养（In vitro culture, IVC） | 第26页 |
| ·结果 | 第26-27页 |
| ·讨论 | 第27页 |
| ·小结 | 第27-28页 |
| 第四章 RNA-seq解析牦牛早期胚胎发育的基因表达模式 | 第28-58页 |
| ·材料与方法 | 第28-33页 |
| ·样品处理 | 第28页 |
| ·文库构建和测序 | 第28页 |
| ·信息学分析概述 | 第28-29页 |
| ·数据深层次分析 | 第29-33页 |
| ·结果 | 第33-51页 |
| ·牦牛胚胎数据质量分析 | 第33-37页 |
| ·胚胎转录组数据的注释 | 第37页 |
| ·定量PCR及基因表达量分析 | 第37-39页 |
| ·SNP及可变剪切分析 | 第39-41页 |
| ·GO富集与KEGG通路分析 | 第41-51页 |
| ·讨论 | 第51-56页 |
| ·质量控制评估 | 第51页 |
| ·转录组分析 | 第51-53页 |
| ·差异表达基因 | 第53-56页 |
| ·小结 | 第56-58页 |
| 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-66页 |
| 附表 | 第66-72页 |
| 附录：研究生阶段发表的论文 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
