| 缩略语表 | 第1-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 引言 | 第12-22页 |
| ·野生稻资源特征 | 第12-14页 |
| ·热激转录因子-热激蛋白转录调控途径 | 第14-19页 |
| ·热激转录因子结构 | 第17页 |
| ·DNA结合域结构和功能 | 第17页 |
| ·OD结构域 | 第17-18页 |
| ·核定位信号(NLS) | 第18页 |
| ·出核信号(NES) | 第18页 |
| ·激活基序(AHA) | 第18页 |
| ·植物热激转录因子研究进展 | 第18-19页 |
| ·基因的比较分析 | 第19-21页 |
| ·SNP的类型与作用 | 第19-20页 |
| ·基因复制与共线性 | 第20-21页 |
| ·本文研究内容 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-29页 |
| ·数据收集 | 第22-24页 |
| ·栽培稻日本晴基因组数据 | 第22页 |
| ·短舌野生稻基因组数据 | 第22-23页 |
| ·展颖野生稻基因组数据 | 第23页 |
| ·南方野生稻基因组数据 | 第23页 |
| ·尼瓦拉野生稻基因组数据 | 第23-24页 |
| ·斑点野生稻基因组数据 | 第24页 |
| ·普通野生稻基因组数据 | 第24页 |
| ·基因组中HSFs的鉴定 | 第24-25页 |
| ·日本晴与野生稻间HSFs进化分析 | 第25页 |
| ·水稻中HSF复制方式的检测和共线性检测 | 第25页 |
| ·HSFs的选择压力分析 | 第25页 |
| ·栽培稻与各个野生稻间SNPs的检测 | 第25-26页 |
| ·非同义SNPs的功能预测 | 第26-28页 |
| ·VCF文件格式说明 | 第26-27页 |
| ·VCF文件注释 | 第27-28页 |
| ·对预测有影响的nSNPs蛋白三维结构的预测 | 第28-29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-57页 |
| ·各供试水稻基因组中HSFs的鉴定结果分析 | 第29-31页 |
| ·供试水稻品种中HSFs的进化分析 | 第31-35页 |
| ·日本晴和野生稻种内HSFs的共线性分析 | 第35-42页 |
| ·HSFs基因重复类型分析 | 第42-43页 |
| ·日本晴和野生稻HSFs之间的的选择压力分析 | 第43-49页 |
| ·各供试水稻品种基因组HSFs上的SNPs检测结果分析 | 第49-53页 |
| ·供试野生水稻品种基因组的HSFs上SNPs的功能预测分析 | 第53-56页 |
| ·蛋白三维结构的预测分析 | 第56-57页 |
| 4 讨论与分析 | 第57-60页 |
| ·热激转录因子的鉴定 | 第57页 |
| ·野生稻与栽培稻热激转录因子的进化分析 | 第57-58页 |
| ·野生稻基因组中HSFs基因上的SNPs功能分析 | 第58-60页 |
| 5 小结 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 附录 | 第67-77页 |
| 致谢 | 第77页 |