| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 目录 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-23页 |
| ·鱼类系统发育研究概述 | 第14页 |
| ·鱼类系统发育研究方法 | 第14-18页 |
| ·表型性状研究 | 第14-15页 |
| ·分子生物学技术研究 | 第15-18页 |
| ·线粒体概述 | 第18-20页 |
| ·线粒体DNA(mt DNA)的发展 | 第18页 |
| ·线粒体DNA的遗传特性 | 第18-19页 |
| ·线粒体控制区的研究与应用 | 第19-20页 |
| ·线粒体DNA的应用 | 第20页 |
| ·鳅科研究现状 | 第20-21页 |
| ·本研究的目的 | 第21-23页 |
| 第二章 大鳞副泥鳅和台湾泥鳅的形态学比较研究 | 第23-34页 |
| ·鱼类形态学研究成果 | 第23-24页 |
| ·形态学研究在鳅科中的应用 | 第24-26页 |
| ·鳅科的简介和分类情况 | 第24-25页 |
| ·国内学者对鳅科的研究 | 第25-26页 |
| ·研究物种介绍 | 第26-27页 |
| ·大鳞副泥鳅 | 第26页 |
| ·台湾泥鳅 | 第26-27页 |
| ·材料和方法 | 第27-29页 |
| ·泥鳅样本 | 第27-28页 |
| ·外部形态特征观察 | 第28-29页 |
| ·数据测量和处理 | 第29页 |
| ·结果 | 第29-31页 |
| ·讨论 | 第31-34页 |
| 第三章 大鳞副泥鳅和台湾泥鳅的线粒体基因组全序列测定与系统分析 | 第34-72页 |
| ·材料与方法 | 第35-45页 |
| ·样本采集 | 第35-36页 |
| ·实验仪器 | 第36-37页 |
| ·实验试剂 | 第37页 |
| ·实验分析软件（包括在线软件） | 第37-38页 |
| ·总DNA提取方法 | 第38-40页 |
| ·PCR扩增 | 第40-44页 |
| ·线粒体基因组序列的拼接和分析 | 第44页 |
| ·序列分析和分子系统树的构建 | 第44-45页 |
| ·大鳞副泥鳅的序列结果 | 第45-54页 |
| ·大鳞副泥鳅线粒体全基因组的组成 | 第46-47页 |
| ·基因结构与排序 | 第47页 |
| ·基因重叠和间隔 | 第47-50页 |
| ·大鳞副泥鳅核苷酸的组成 | 第50页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第50-51页 |
| ·起始密码和终止密码 | 第51页 |
| ·转运RNA（t RNA) | 第51-52页 |
| ·核糖体RNA（r RNA） | 第52-53页 |
| ·非编码区（D-loop区） | 第53-54页 |
| ·台湾泥鳅线粒体基因组序列分析 | 第54-61页 |
| ·台湾泥鳅线粒体基因组排序 | 第54-57页 |
| ·基因重叠和间隔 | 第57页 |
| ·台湾泥鳅核苷酸的组成 | 第57-58页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第58页 |
| ·起始密码和终止密码 | 第58-59页 |
| ·转运RNA（t RNA) | 第59-60页 |
| ·核糖体RNA（r RNA） | 第60页 |
| ·非编码区（D-loop区） | 第60-61页 |
| ·分析与讨论 | 第61-68页 |
| ·鳅科系统进化树的构建 | 第61-63页 |
| ·系统树分析 | 第63-68页 |
| ·讨论 | 第68-72页 |
| ·线粒体基因组全序列特征分析 | 第68-69页 |
| ·鳅科鱼类系统发育分析 | 第69-72页 |
| 结论 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第82页 |