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调节NMD通路中SMG5的miR-433的鉴定及miRNA-NMD-作用底物调控通路的初步研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
第一章 文献综述第12-23页
 1 前言第12-16页
   ·NMD是真核细胞中mRNA降解的重要监督机制第12-14页
   ·NMD途径的作用因子和底物基因第14-16页
   ·NMD与疾病的关系第16页
 2 miRNA的生物过程及与靶基因的调控机制第16-21页
   ·miRNA生物过程第16-20页
     ·miRNA的检测方法第18页
     ·miRNA的功能第18-20页
       ·miRNA与动物生长发育的调控作用第19页
       ·miRNA调控细胞增殖、分化和凋亡第19-20页
       ·miRNA与肿瘤第20页
   ·miRNA与靶基因的调控机制第20-21页
 3 miRNA靶基因的预测与检测方法第21-22页
 4 研究的目的和意义第22-23页
第二章 材料方法第23-50页
 1 实验材料第23-27页
   ·实验样品第23-24页
     ·组织样品第23页
     ·载体、菌株和细胞系第23页
     ·主要仪器设备第23-24页
   ·主要试剂及药品第24-25页
     ·主要试剂第24页
     ·培养细胞所用试剂第24页
     ·Western bolt主要试剂第24-25页
   ·常用试剂的配制第25-27页
     ·转化所用溶液的配制第25页
     ·细胞培养所用试剂第25-26页
     ·用于SDS-PAGE缓冲液的配制第26-27页
     ·其他常用试剂配制第27页
   ·主要应用到的生物信息学网站和分析软件第27页
 2 试验方法第27-50页
   ·生物信息学预测SMG5调控相关的miRNAs第27-28页
   ·mRNA和miRNA组织表达谱的检测第28-35页
     ·mRNA组织表达谱的检测第28-31页
     ·miRNA组织表达谱的检测第31-35页
   ·双荧光素酶报告载体的构建第35-41页
     ·野生型双荧光素酶报告载体的构建第35-40页
     ·突变型双荧光素酶报告载体的构建第40-41页
   ·细胞培养与转染第41-44页
     ·细胞培养和传代第41-42页
     ·细胞冻存第42页
     ·细胞复苏第42页
     ·HEK-293T细胞转染第42-43页
     ·Hela细胞的转染第43-44页
     ·双荧光素酶报告基因的检测第44页
   ·miRNA的超表达和抑制表达第44-46页
     ·miR-433 mimic瞬时转染转染BHK和C2C12细胞第44页
     ·转染效率估测第44-45页
     ·转染后miRNA和mRNA的检测第45-46页
   ·western boltting检测靶基因的水平第46-48页
     ·细胞总蛋白的提取第46页
     ·蛋白浓度测定第46-47页
     ·Western blot具体步骤第47-48页
   ·干扰SMG5对NMD底物基因的影响第48-50页
     ·siRNA转染的主要试剂及仪器第48-49页
     ·细胞总RNA的提取第49页
     ·cDNA的合成第49页
     ·实时定量PCR检测底物基因的mRNA变化第49页
     ·Western bolt检测底物基因蛋白的变化第49-50页
第三章 结果分析第50-65页
 1 作用于SMG5的miRNA的预测第50页
 2 mRNA和miRNA的组织表达谱分析第50-54页
   ·组织总RNA的质量检测第50-51页
   ·cDNA结果检测第51-52页
     ·mRNA的cDNA检测结果第51页
     ·miR-433的cDNA的检测结果及成熟序列的扩增第51-52页
   ·SMG5在小鼠各个组织中的表达谱分析结果第52-53页
   ·miRNA在小鼠各组织中的表达谱分析结果第53-54页
 3 双荧光素酶报告载体的构建与鉴定结果第54-57页
   ·野生型双荧光素酶报告载体的构建第54-55页
     ·SMG53’UTR序列的扩增第54页
     ·pmirGLO-SMG5-WT重组质粒的构建第54-55页
   ·突变型双荧光素酶报告载体的构建第55-56页
     ·重组质粒的碱基突变第55-56页
   ·双荧光素酶报告基因的检测结果第56-57页
 4 miR-433超表达和抑制表达试验结果第57-61页
   ·荧光显微镜下mimic转染效率检测第57-58页
   ·实时定量PCR检测miR-433的超表达和抑制表达结果第58-59页
   ·荧光定量PCR检测miR-433对SMG5的调控第59-60页
   ·SMG5的Western blotting检测结果第60-61页
 5 NMD底物基因调控研究结果第61-65页
   ·实时荧光定量PCR检测下游基因的表达第61-62页
   ·底物基因的Western blotting检测结果第62页
   ·干扰SMG5基因对底物基因表达的影响第62-65页
     ·干扰SGM5后导致底物基因mRNA水平上升第62-63页
     ·干扰SMG5后底物蛋白表达水平升高第63-65页
第四章 讨论第65-70页
 1 miRNA-433功能和作用的靶基因第65页
 2 SMG5在NMD通路的作用第65-66页
 3 miRNA-433通过调控SMG5来参与NMD通路及其意义第66-67页
 4 关于本研究涉及到的实验技术和方法的讨论第67-70页
   ·关于实时荧光定量PCR第67-68页
   ·关于Western bolt第68-70页
第五章 小结第70-71页
参考文献第71-80页
附录第80-84页
致谢第84页

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