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肺炎克雷伯氏菌感染牛乳腺上皮细胞基因表达谱分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
缩略词表第12-13页
文献综述第13-19页
第一章 肺炎克雷伯氏菌与牛乳腺上皮细胞体外感染模型的建立第19-40页
   ·实验材料第19-21页
     ·主要仪器和设备第19页
     ·活体材料第19-20页
     ·主要试剂与耗材第20页
     ·主要溶剂的配制第20-21页
   ·实验方法第21-26页
     ·细胞的分离培养第21页
     ·生长曲线的测定第21页
     ·侵染实验第21-22页
     ·粘附实验第22页
     ·扫描电镜第22页
     ·透射电镜第22页
     ·Hoechst 33342染色第22-23页
     ·流式细胞仪检测细胞凋亡试验第23页
     ·Real-time PCR检测肺炎克雷伯氏菌感染牛乳腺上皮细胞前后细胞因子的变化第23-25页
     ·ELISA检测感染后TNF-α及IL-1β的表达第25页
     ·统计学分析方法第25-26页
   ·实验结果第26-37页
     ·牛乳腺上皮细胞原代培养结果第26页
     ·肺炎克雷伯氏菌生长曲线第26-27页
     ·肺炎克雷伯氏菌对牛乳腺上皮细胞粘附侵染率结果第27-28页
     ·光镜观察结果第28-29页
     ·扫描电镜观察结果第29页
     ·透射电镜观察结果第29-30页
     ·Hoechst染色结果第30-31页
     ·Annexin V-FITC细胞凋亡检测试剂盒检测细胞凋亡第31-33页
     ·Real-time PCR检测感染前后NODs及RIP2的变化结果第33-34页
     ·Real-time PCR检测感染前后TLR2,TLR4,TLR6及TLR9的变化结果第34-35页
     ·Real-time PCR检测感染前后TNF-α及IL-1β的变化结果第35-36页
     ·Elisa检测感染前后TNF-α及IL-1β的变化结果第36-37页
     ·Real-time PCR检测感染前后IL-6及IL-8的变化结果第37页
   ·讨论第37-40页
第二章 深度测序技术分析肺炎克雷伯氏菌毒染牛乳腺上皮细胞前后基因表达谱的变化第40-59页
   ·实验材料第40-41页
     ·主要仪器设备第40-41页
     ·主要试剂与耗材第41页
     ·细菌及细胞第41页
   ·实验方法第41-45页
     ·感染肺炎克雷伯氏菌后的牛乳腺上皮细胞总RNA提取第41-42页
     ·Tag制备及测序第42页
     ·基因表达注释第42页
     ·差异性表达基因的筛选第42页
     ·差异性表达基因的GO功能显著性富集分析第42-43页
     ·差异性表达基因的Pathway显著性富集分析第43页
     ·Real-time PCR验证深度测序数据第43-45页
   ·实验结果第45-57页
     ·细胞总RNA提取质量评估第45页
     ·测序数据的评估结果第45-47页
     ·差异性表达基因的蹄选结果第47-50页
     ·差异性表达基因的GO功能显著性富集分析第50-51页
     ·差异性表达基因的Pathway显著性富集分析结果第51-52页
     ·先天性免疫相关基因蹄选结果第52-54页
     ·氧化应激、氧化碟酸化及细胞调亡相关基因蹄选结果第54-55页
     ·劳光定量PCR验证测序数据结果第55-57页
   ·讨论第57-59页
第三章 NOD1 siRNA载体的构建及沉默NOD1对乳腺上皮细胞抗菌免疫作用的初探第59-67页
   ·实验材料第60页
     ·主要仪器设备第60页
     ·主要试剂与耗材第60页
     ·细菌及细胞第60页
   ·实验方法第60-61页
     ·化学合成siRNA表达载体第60-61页
     ·siRNA表达载体转染牛乳腺上皮细胞第61页
     ·Real-time PCR法检测肺炎克雷伯氏菌感染转染后牛乳腺上皮细胞NOD蛋白及相关炎性因子表达情况第61页
   ·实验结果第61-65页
     ·表达载体P-SIREN-RetroQ-DsRed-Express转染牛乳腺上皮细胞第62页
     ·siRNA转染牛乳腺上皮细胞后Real-Time PCR检测NOD1及RIP2的表达结果第62-63页
     ·siRNA转染牛乳腺上皮细胞后Real-Time PCR检测TLR2、TLR4、TLR6及TLR9的表达结果第63-64页
     ·siRNA转染牛乳腺上皮细胞后Real-Time PCR检测TNF-α、IL-1β、IL-6及IL-8的表达结果第64-65页
   ·讨论第65-67页
结论第67-68页
参考文献第68-84页
硕士期间发表学术论文第84-85页
致谢第85-86页
附录第86-88页

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