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鄂、滇主要淡水湖泊T4类噬菌体g23基因系统发育与时空分布研究

摘要第1-8页
Abstract第8-11页
主要符号及縮略语表第11-12页
1. 前言第12-23页
     ·选题意义第12页
     ·文献综述第12-21页
       ·浮游病毒及其主要类群第12-15页
       ·浮游病毒的遗传多样性及其研究方法第15-18页
       ·浮游病毒遗传多样性的环境影响因素第18-19页
       ·以g23基因为分子标记的T4类噬菌体遗传多样性相关研究第19-21页
     ·研究内容及技术路线第21-23页
       ·研究内容第21页
       ·技术路线第21-23页
2. 材料与方法第23-37页
     ·采样点设置与采样方法第23-24页
       ·采样点设置第23-24页
       ·采样方法第24页
     ·序列来源及环境背景参数第24-32页
       ·淡水湖泊g23基因序列片段第24-26页
       ·环境因子测定结果第26-29页
       ·其它环境g23基因序列片段第29-32页
     ·序列翻译第32页
     ·序列去冗余第32-33页
     ·序列BLAST比对第33页
     ·序列相似性分析第33页
     ·序列同源比对第33页
     ·系统发育树构建方法第33-34页
     ·多样性指数计算方法第34-35页
     ·Unifrac分析第35-36页
     ·梯度分析第36-37页
3. 淡水湖泊T4类噬菌体g23基因序列总体分析第37-50页
     ·序列翻译第37-38页
     ·冗余率第38-40页
     ·同源分析第40-41页
     ·相似性分析第41-49页
     ·讨论第49页
     ·小结第49-50页
4. 季节对淡水湖泊T4类噬菌体g23基因系统发育多样性的影响第50-66页
     ·研究材料第50页
     ·结果与分析第50-64页
       ·序列特征的总体分析第50-51页
       ·冬、夏季湖泊g23序列遗传多样性指数的比较第51-53页
       ·冬、夏季序列分布差异的总体分析第53页
       ·季节相关的特有序列和共有序列的深入分析第53-60页
       ·季节相关的保守区段及保守位点分析第60-63页
       ·冬、夏季序列分布差异的影响因素第63-64页
     ·讨论第64-65页
     ·小结第65-66页
5. 不同营养水平淡水湖泊T4类噬菌体g23基因系统发育比较第66-88页
     ·研究材料第66页
     ·结果与分析第66-85页
       ·序列特征的总体分析第66-68页
       ·不同营养水平湖泊g23序列遗传多样性指数的比较第68-70页
       ·营养水平相关的特有序列和共有序列的深入分析第70-81页
       ·营养水平相关的保守区段分析第81-85页
       ·不同营养水平湖泊序列分布差异的影响因素第85页
     ·讨论第85-87页
     ·小结第87-88页
6. 不同海拔淡水湖泊T4类噬菌体g23基因系统发育比较第88-99页
     ·研究材料第88页
     ·结果与分析第88-97页
       ·序列的特征的总体分析第88-89页
       ·高、平原湖泊g23序列遗传多样性指数的比较第89-91页
       ·海拔相关序列分布差异的总体分析第91页
       ·海拔相关的特有序列和共有序列的深入分析第91-94页
       ·海拔相关的保守区段分析第94-96页
       ·不同营养水平湖泊序列分布差异的影响因素第96-97页
     ·讨论第97-98页
     ·小结第98-99页
7. 总结第99-101页
参考文献第101-108页
附录第108-163页
致谢第163页

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