摘要 | 第1-8页 |
Abstract | 第8-11页 |
主要符号及縮略语表 | 第11-12页 |
1. 前言 | 第12-23页 |
·选题意义 | 第12页 |
·文献综述 | 第12-21页 |
·浮游病毒及其主要类群 | 第12-15页 |
·浮游病毒的遗传多样性及其研究方法 | 第15-18页 |
·浮游病毒遗传多样性的环境影响因素 | 第18-19页 |
·以g23基因为分子标记的T4类噬菌体遗传多样性相关研究 | 第19-21页 |
·研究内容及技术路线 | 第21-23页 |
·研究内容 | 第21页 |
·技术路线 | 第21-23页 |
2. 材料与方法 | 第23-37页 |
·采样点设置与采样方法 | 第23-24页 |
·采样点设置 | 第23-24页 |
·采样方法 | 第24页 |
·序列来源及环境背景参数 | 第24-32页 |
·淡水湖泊g23基因序列片段 | 第24-26页 |
·环境因子测定结果 | 第26-29页 |
·其它环境g23基因序列片段 | 第29-32页 |
·序列翻译 | 第32页 |
·序列去冗余 | 第32-33页 |
·序列BLAST比对 | 第33页 |
·序列相似性分析 | 第33页 |
·序列同源比对 | 第33页 |
·系统发育树构建方法 | 第33-34页 |
·多样性指数计算方法 | 第34-35页 |
·Unifrac分析 | 第35-36页 |
·梯度分析 | 第36-37页 |
3. 淡水湖泊T4类噬菌体g23基因序列总体分析 | 第37-50页 |
·序列翻译 | 第37-38页 |
·冗余率 | 第38-40页 |
·同源分析 | 第40-41页 |
·相似性分析 | 第41-49页 |
·讨论 | 第49页 |
·小结 | 第49-50页 |
4. 季节对淡水湖泊T4类噬菌体g23基因系统发育多样性的影响 | 第50-66页 |
·研究材料 | 第50页 |
·结果与分析 | 第50-64页 |
·序列特征的总体分析 | 第50-51页 |
·冬、夏季湖泊g23序列遗传多样性指数的比较 | 第51-53页 |
·冬、夏季序列分布差异的总体分析 | 第53页 |
·季节相关的特有序列和共有序列的深入分析 | 第53-60页 |
·季节相关的保守区段及保守位点分析 | 第60-63页 |
·冬、夏季序列分布差异的影响因素 | 第63-64页 |
·讨论 | 第64-65页 |
·小结 | 第65-66页 |
5. 不同营养水平淡水湖泊T4类噬菌体g23基因系统发育比较 | 第66-88页 |
·研究材料 | 第66页 |
·结果与分析 | 第66-85页 |
·序列特征的总体分析 | 第66-68页 |
·不同营养水平湖泊g23序列遗传多样性指数的比较 | 第68-70页 |
·营养水平相关的特有序列和共有序列的深入分析 | 第70-81页 |
·营养水平相关的保守区段分析 | 第81-85页 |
·不同营养水平湖泊序列分布差异的影响因素 | 第85页 |
·讨论 | 第85-87页 |
·小结 | 第87-88页 |
6. 不同海拔淡水湖泊T4类噬菌体g23基因系统发育比较 | 第88-99页 |
·研究材料 | 第88页 |
·结果与分析 | 第88-97页 |
·序列的特征的总体分析 | 第88-89页 |
·高、平原湖泊g23序列遗传多样性指数的比较 | 第89-91页 |
·海拔相关序列分布差异的总体分析 | 第91页 |
·海拔相关的特有序列和共有序列的深入分析 | 第91-94页 |
·海拔相关的保守区段分析 | 第94-96页 |
·不同营养水平湖泊序列分布差异的影响因素 | 第96-97页 |
·讨论 | 第97-98页 |
·小结 | 第98-99页 |
7. 总结 | 第99-101页 |
参考文献 | 第101-108页 |
附录 | 第108-163页 |
致谢 | 第163页 |