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猪繁殖与呼吸综合征病毒5非编码区顺式作用元件的解析

目录第1-8页
摘要第8-10页
ABSTRACT第10-13页
符号说明第13-14页
第一篇 文献综述第14-46页
 第一章 猪繁殖与呼吸综合征及其病原的分子生物学研究进展第14-28页
  1 病毒概述第14-15页
  2 基因组第15页
  3 非结构蛋白与结构蛋白第15-18页
  4 基因组复制与亚基因组转录第18-19页
  5 PRRSV免疫与疫苗研制第19-20页
  6 诊断第20-21页
  7 小结与讨论第21页
  参考文献第21-28页
 第二章 单股正链RNA病毒5'UTR顺式作用元件的研究进展第28-36页
  1 结构第28-29页
  2 功能第29-30页
  3 问题与讨论第30-31页
  参考文献第31-36页
 第三章 猪繁殖与呼吸综合征病毒基因表达调控序列的初步解析第36-46页
  1 PRRSV 5’UTR病毒复制过程调控因子的界定第36-39页
  2 PRRSV 3’UTR病毒复制过程调控因子的界定第39-40页
  3 POLY(A)对PRRSV复制的影响及复制起始位点的界定第40页
  4 PRRSV的转录调控机制的研究第40-42页
  5 高致病性PRRSV复制调控机制的研究第42页
  6 展望第42-43页
  参考文献第43-46页
第二篇 试验研究第46-132页
 第四章 猪繁殖与呼吸综合征病毒5’非翻译区存在与病毒感染性相关的顺式作用元件第46-78页
  摘要第46页
  ABSTRACT第46-47页
  前言第47-49页
  1 材料与方法第49-61页
   ·病毒和细胞第49页
   ·试剂第49页
   ·主要仪器第49-50页
   ·通过突变PCR构建5’末端系列缺失突变体第50-55页
   ·转染和病毒拯救第55-57页
   ·间接免疫荧光第57页
   ·5 ’RACE,RT-PCR和序列测定第57-60页
   ·病毒空斑形态第60页
   ·第一轮病毒滴定和突变病毒的生长曲线第60页
   ·RNA杂交第60-61页
   ·RNA二级结构预测分析第61页
  2 结果第61-71页
   ·PRRSV基因组5’末端的反向遗传操作第61-64页
   ·PRRSV 5’末端前三个核苷酸对病毒粒子的活力是非必需的第64页
   ·病毒5’末端前16个核苷酸可以被改变而不影响其感染性第64-67页
   ·改变的5’末端区域被外源AU-rich序列所修复第67-68页
   ·末端修复的突变病毒遗传稳定第68-70页
   ·由序列形成的结构元件而不是初级序列才是调控PRRSV复制的关键第70-71页
  3 讨论第71-73页
  参考文献第73-78页
 第五章 PRRSV 5’UTR 5’端序列缺失突变体外源序列修复分析第78-92页
  摘要第78页
  ABSTRACT第78-79页
  前言第79-80页
  1 材料与方法第80-84页
   ·材料第80页
   ·方法第80-84页
  2 结果第84-89页
   ·重组突变质粒的构建第84-85页
   ·突变病毒的拯救,5’端原缺失序列出现AU-rich修复序列第85-86页
   ·拯救病毒的5’端AU-rich修复序列在传代过程中能够稳定存在第86-87页
   ·突变体与亲本病毒基因组复制,亚基因组转录的分析比较第87-88页
   ·突变病毒与野毒在病毒生物学水平的比较第88页
   ·突变病毒与野毒5’UTR二级结构预测分析第88-89页
  3 讨论第89-90页
  参考文献第90-92页
 第六章 Ⅰ型5’UTR在功能上可以完全替代Ⅱ型5’UTR发挥作用第92-116页
  摘要第92页
  ABSTRACT第92-93页
  前言第93-94页
  1 材料与方法第94-103页
   ·细胞与病毒第94页
   ·试剂第94页
   ·主要仪器第94页
   ·突变中间质粒的构建第94-98页
   ·质粒转染和病毒拯救第98-99页
   ·5’RACE,RT-PCR和全长测序第99-100页
   ·亚基因组及负链基因组检测第100-102页
   ·拯救病毒的滴定第102页
   ·病毒空斑形态第102-103页
   ·Northern杂交第103页
   ·RNA二级结构的预测第103页
  2 结果第103-111页
   ·PRRSV Ⅰ型和Ⅱ型的5’UTR中有保守区存在,且它们拥有相似的二级结构第103-105页
   ·突变全长cDNA克隆的构建以及病毒拯救第105-107页
   ·嵌合病毒与亲本病毒拥有相似的生物特性,嵌合病毒的RNA组份用Ⅰ型和Ⅱ型的探针都可以检测到第107-109页
   ·Ⅱ型的5’UTR的功能可完全被Ⅰ型所替换,且突变序列遗传稳定第109-110页
   ·Nde Ⅰ的插入对突变体的遗传稳定性无影响第110页
   ·5’UTR的替换会造成vAPLV5中其他位点的突变第110-111页
  3 讨论第111-112页
  参考文献第112-116页
 第七章 异源5’非翻译区在猪繁殖与呼吸综合征病毒感染性拯救过程中的功能解析第116-132页
  摘要第116页
  ABSTRACT第116-117页
  前言第117-118页
  1 材料与方法第118-124页
   ·材料第118-119页
   ·方法第119-124页
  2 结果第124-128页
   ·vAPLV5全长测序发现Nsp9位置出现4处突变位点引发有义突变第124页
   ·嵌合衍生突变病毒的构建第124-125页
   ·嵌合衍生突变病毒较嵌合亲本病毒更早产生CPE第125-126页
   ·突变病毒与野毒的基因组复制与亚基因组转录的分析比较第126-127页
   ·突变病毒与野毒在病毒生物学水平的比较第127-128页
   ·突变病毒与野毒在亚基因组合成水平的分析比较第128页
  3 讨论第128-129页
  参考文献第129-132页
全文总结第132-134页
致谢第134-136页
作者简介第136-138页

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