摘要 | 第1-11页 |
Abstract | 第11-13页 |
1 引言 | 第13-27页 |
·牛基因组学的研究 | 第13-16页 |
·基因组遗传图谱 | 第13页 |
·基因组物理图谱 | 第13-14页 |
·基因组DNA测序 | 第14页 |
·功能基因组学研究 | 第14-16页 |
·基因表达谱 | 第16-23页 |
·二代测序技术基础的基因芯片表达谱 | 第16-19页 |
·数字基因表达谱 | 第19-23页 |
·GRK2基因概述 | 第23-25页 |
·G蛋白偶联受体激酶 | 第23-24页 |
·蛋白激酶家族 | 第24页 |
·βARKs | 第24-25页 |
·GRK2相关功能 | 第25页 |
·研究的目的与意义 | 第25-27页 |
2 材料与方法 | 第27-54页 |
·实验动物的选取 | 第27页 |
·奶牛乳腺组织获取及总RNA提取 | 第27-29页 |
·主要试剂和耗材 | 第27页 |
·主要仪器 | 第27-28页 |
·乳腺组织的获取 | 第28页 |
·RNA提取 | 第28页 |
·RNA质量检测 | 第28-29页 |
·数字基因表达谱检测 | 第29-30页 |
·实验材料 | 第29页 |
·实验设备与试剂 | 第29页 |
·实验步骤 | 第29-30页 |
·数字基因表达谱数据分析 | 第30-33页 |
·原始数据处理 | 第31页 |
·测序质量评估 | 第31页 |
·测序饱和度分析 | 第31页 |
·实验重复性分析 | 第31页 |
·Clean Tag拷贝数分布统计 | 第31页 |
·基因表达注释 | 第31-32页 |
·差异表达基因的筛选 | 第32页 |
·反义链转录分析 | 第32页 |
·新转录本的检测 | 第32页 |
·GO功能显著性富集分析 | 第32-33页 |
·Pathway显著性富集分析 | 第33页 |
·荧光定量RT-PCR验证 | 第33-37页 |
·基因选取及引物设计 | 第33-35页 |
·cDNA的生成 | 第35-36页 |
·引物效果验证 | 第36-37页 |
·实时荧光定量PCR反应 | 第37页 |
·奶牛乳腺组织的获取及上皮细胞的培养 | 第37-40页 |
·主要试剂及配制方法 | 第37-39页 |
·主要仪器 | 第39页 |
·用于细胞培养的乳腺组织的获取 | 第39页 |
·乳腺上皮细胞的原代培养 | 第39页 |
·细胞传代及纯化 | 第39-40页 |
·乳腺上皮细胞鉴定 | 第40页 |
·功能基因的筛选 | 第40-41页 |
·GRK2在不同状态的奶牛乳腺组织中的表达 | 第40-41页 |
·GRK2基因过表达检验基因功能 | 第41-52页 |
·引物设计及PCR扩增 | 第41-43页 |
·克隆载体构建 | 第43-45页 |
·pGCMV/IRES/EGFP真核表达载体构建 | 第45-47页 |
·重组质粒载体转染奶牛乳腺上皮细胞 | 第47-48页 |
·转染后荧光基团的检测 | 第48页 |
·荧光定量RT-PCR检测GRK2过表达效果 | 第48页 |
·Western blotting检测GRK2过表达对泌乳功能的影响 | 第48-52页 |
·GRK2基因沉默检验基因功能 | 第52-54页 |
·主要试剂 | 第52页 |
·主要仪器 | 第52页 |
·细胞转染 | 第52-53页 |
·干扰效率的观察 | 第53页 |
·荧光定量RT-PCR检测GRK2沉默效果 | 第53页 |
·Western blotting检测GRK2沉默对泌乳功能的影响 | 第53-54页 |
3 结果 | 第54-85页 |
·奶牛乳腺组织RNA提取质量检验结果 | 第54-55页 |
·数字基因表达谱检测结果 | 第55-57页 |
·差异表达基因 | 第55-56页 |
·Gene Ontology结果 | 第56-57页 |
·Pathway分析结果 | 第57页 |
·新转录本的检测结果 | 第57页 |
·Real-Time荧光定量PCR验证结果 | 第57-66页 |
·奶牛乳腺上皮细胞的培养 | 第66-67页 |
·原代和传代细胞培养 | 第66页 |
·乳腺上皮细胞的鉴定 | 第66-67页 |
·GRK2基因的筛选 | 第67-69页 |
·GRK2基因在各组奶牛乳腺组织中的表达 | 第67-69页 |
·GRK2过表达功能检验结果 | 第69-79页 |
·GRK2基因PCR扩增结果 | 第69-70页 |
·GRK2克隆载体构建结果 | 第70-71页 |
·GRK2表达载体构建结果 | 第71-73页 |
·GRK2过表达效果检验 | 第73-74页 |
·蛋白质水平检测GRK2过表达对泌乳调控的影响 | 第74-79页 |
·GRK2基因沉默功能检验结果 | 第79-85页 |
·GRK2干扰效果检验 | 第79-80页 |
·蛋白质水平检测GRK2沉默对泌乳调控的影响 | 第80-85页 |
4 讨论 | 第85-90页 |
·奶牛乳腺数字基因表达谱 | 第85-87页 |
·荧光定量RT-PCR验证 | 第87页 |
·Gene Ontology分析 | 第87-88页 |
·Pathway分析 | 第88页 |
·GRK2对乳腺上皮细胞泌乳功能的影响 | 第88-90页 |
5 结论 | 第90-91页 |
致谢 | 第91-92页 |
参考文献 | 第92-98页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第98页 |