| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-25页 |
| ·S rDNA基因克隆文库 | 第13-14页 |
| 2.遗传指纹技术(DNA Fingerprint Techniques) | 第14-18页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第15-17页 |
| ·单链构象多态性(SSCP) | 第17页 |
| ·末端限制性片段长度多态性(TRFLP) | 第17-18页 |
| ·随机扩增多态性分析(RAPD) | 第18页 |
| 3.核酸分子杂交技术 | 第18-20页 |
| ·斑点(Dotblot)杂交(点渍杂交) | 第19页 |
| ·荧光原位杂交技术(FISH) | 第19-20页 |
| ·基因芯片技术(DNA Microarrays) | 第20页 |
| 4.实时荧光定量PCR技术(Real-time PCR) | 第20-21页 |
| 5.微生物群落功能多样性的研究 | 第21-23页 |
| ·宏基因组文库(Metagenomic Libraries) | 第21-22页 |
| ·环境基因组标签法(EGTs) | 第22-23页 |
| 6.问题与展望 | 第23-24页 |
| 本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 第二章 胃肠道微生物生态研究 | 第25-52页 |
| 第一节 山羊瘤胃微生物遗传多样性研究 | 第25-43页 |
| 1.实验材料 | 第25-26页 |
| ·材料 | 第25页 |
| ·菌种和质粒 | 第25页 |
| ·工具酶 | 第25页 |
| ·仪器和试剂 | 第25页 |
| ·溶液 | 第25-26页 |
| ·培养基 | 第26页 |
| 2.研究方法 | 第26-31页 |
| ·总DNA的提取 | 第26页 |
| ·PCR扩增 | 第26-29页 |
| ·DGGE电泳凝胶制备 | 第28页 |
| ·DGGE电泳 | 第28页 |
| ·DGGE电泳条件 | 第28-29页 |
| ·DNA片段的回收和连接 | 第29页 |
| ·电泳 | 第29页 |
| ·回收 | 第29页 |
| ·DNA片段的连接 | 第29页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第29-30页 |
| ·电转化 | 第30页 |
| ·重组DNA的纯化 | 第30页 |
| ·转化 | 第30页 |
| ·重组子筛选 | 第30-31页 |
| ·DNA测序 | 第31页 |
| ·DGGE图谱中部分优势条带的序列分析和系统发育分析 | 第31页 |
| 3.结果与分析 | 第31-40页 |
| ·总DNA的提取及PCR扩增 | 第31-33页 |
| ·DGGE指纹图谱建立及分析 | 第33-39页 |
| ·部分优势条带的序列比对与系统发育树分析 | 第39-40页 |
| 4.讨论 | 第40-43页 |
| 第二节 草鱼肠道细菌多样性分析 | 第43-51页 |
| 1.实验材料 | 第43页 |
| ·材料 | 第43页 |
| ·菌种和质粒,工具酶,仪器和试剂,溶液,培养基 | 第43页 |
| 2.研究方法 | 第43-44页 |
| ·草鱼肠道的处理 | 第43页 |
| ·总DNA的提取 | 第43-44页 |
| ·PCR扩增 | 第44页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第44页 |
| ·DNA片段的回收和连接,感受态细胞的制备,电转化,重组子筛选 | 第44页 |
| ·DNA测序 | 第44页 |
| ·DGGE图谱中部分优势条带的序列分析和系统发育分析 | 第44页 |
| 3.结果与分析 | 第44-48页 |
| ·总DNA的提取及PCR扩增 | 第44-45页 |
| ·DGGE指纹图谱建立及分析 | 第45-47页 |
| ·部分优势条带的序列比对与系统发育树分析 | 第47-48页 |
| 4.讨论 | 第48-51页 |
| 本章小结 | 第51-52页 |
| 第三章 草鱼肠道产纤维素酶可培养细菌的分离鉴定及系统发育分析 | 第52-62页 |
| 1.实验材料 | 第52页 |
| ·材料 | 第52页 |
| ·溶液 | 第52页 |
| ·实验仪器 | 第52页 |
| ·培养基 | 第52页 |
| 2.研究方法 | 第52-54页 |
| ·草鱼肠道的处理 | 第52-53页 |
| ·纤维素酶产生菌株的分离 | 第53页 |
| ·纤维素酶产生菌株的初筛 | 第53页 |
| ·纤维素酶产生菌的纯化 | 第53页 |
| ·纤维素酶产生菌的保藏 | 第53页 |
| ·基因组总DNA的提取 | 第53页 |
| ·16S rDNA的PCR扩增 | 第53-54页 |
| ·DNA片段的回收 | 第54页 |
| ·DNA测序 | 第54页 |
| ·系统发育进化树的构建 | 第54页 |
| 3.结果与分析 | 第54-59页 |
| ·菌株分离筛选结果 | 第54页 |
| ·菌株16S rDNA鉴定结果 | 第54-59页 |
| ·细菌基因组DNA的提取结果 | 第54-56页 |
| ·16S rDNA PCR扩增和测序 | 第56-57页 |
| ·16S rDNA序列相似性比较以及系统发育学分析 | 第57-59页 |
| 4.讨论 | 第59-61页 |
| 本章小结 | 第61-62页 |
| 第四章 β-葡萄糖苷酶基因多样性分析及酶基因的克隆 | 第62-80页 |
| 1.实验材料 | 第62页 |
| ·菌株与质粒 | 第62页 |
| ·引物合成 | 第62页 |
| ·试剂盒、工具酶和生化试剂 | 第62页 |
| 2.实验方法 | 第62-65页 |
| ·β-葡萄糖苷酶基因部分序列的克隆 | 第62-63页 |
| ·DNA片段的回收和连接,转化,重组子筛选,DNA测序 | 第63页 |
| ·β-葡萄糖苷酶基因片段的相似性分析 | 第63页 |
| ·系统进化树分析 | 第63页 |
| ·基因文库的构建和筛选 | 第63-65页 |
| 3.结果与分析 | 第65-76页 |
| ·β-葡萄糖苷酶部分编码基因序列的克隆 | 第65-66页 |
| ·β-葡萄糖苷酶编码基因序列相似性分析 | 第66-69页 |
| ·系统进化树分析 | 第69页 |
| ·基因文库的构建和筛选 | 第69-70页 |
| ·β-葡萄糖苷酶基因的DNA序列 | 第70-76页 |
| 4.讨论 | 第76-79页 |
| 本章小结 | 第79-80页 |
| 第五章 结论 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 作者简历 | 第92页 |
