| 中文摘要 | 第1-13页 |
| 英文摘要 | 第13-15页 |
| 第一章 绪言 | 第15-43页 |
| 1 鱼类线粒体基因组概述 | 第15-35页 |
| ·线粒体的起源与进化 | 第15-16页 |
| ·鱼类mtDNA 的组成和结构特征 | 第16-18页 |
| ·鱼类线粒体基因组的遗传特征 | 第18-24页 |
| ·分子较小 | 第18页 |
| ·编码效率高 | 第18页 |
| ·编码体系简单 | 第18-20页 |
| ·缺乏重组 | 第20-21页 |
| ·母系遗传 | 第21页 |
| ·无异质性 | 第21-22页 |
| ·进化速度快 | 第22-23页 |
| ·不同区域的进化速率存在差异 | 第23页 |
| ·具有明显的核质基因互作关系 | 第23-24页 |
| ·mtDNA 的复制和表达调控研究 | 第24-25页 |
| ·mtDNA 的复制 | 第24页 |
| ·mtDNA 的转录与加工 | 第24页 |
| ·线粒体蛋白质基因的翻译 | 第24-25页 |
| ·线粒体基因表达产物的定位和功能 | 第25页 |
| ·鱼类线粒体各基因的进化特点 | 第25-29页 |
| ·tRNA 基因 | 第25-26页 |
| ·rRNA 基因 | 第26-27页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第27页 |
| ·控制区 | 第27-29页 |
| ·鱼类mtDNA 的研究意义及其应用 | 第29-34页 |
| ·线粒体基因组的研究意义 | 第29-30页 |
| ·mtDNA 在鱼类系统学中的应用 | 第30-31页 |
| ·mtDNA 在鱼类群体遗传学中的应用 | 第31-32页 |
| ·mtDNA 在鱼类起源和分化研究中的应用 | 第32-33页 |
| ·mtDNA 在鱼类分子生物地理学中的应用 | 第33-34页 |
| ·mtDNA 作为分子钟来推测物种分歧时间 | 第34页 |
| ·鱼类线粒体基因组研究方法 | 第34-35页 |
| 2 石斑鱼类MTDNA 研究进展 | 第35-36页 |
| ·石斑鱼类简介 | 第35页 |
| ·石斑鱼类mtDNA 的研究现状 | 第35-36页 |
| 3 研究对象介绍 | 第36-41页 |
| ·斜带石斑鱼简介 | 第37-39页 |
| ·斜带石斑鱼的形态特征 | 第37-38页 |
| ·斜带石斑鱼的地理分布 | 第38-39页 |
| ·斜带石斑鱼mtDNA 研究进展 | 第39页 |
| ·赤点石斑鱼简介 | 第39-41页 |
| ·赤点石斑鱼的形态特征 | 第39-40页 |
| ·赤点石斑鱼的地理分布 | 第40-41页 |
| ·赤点石斑鱼mtDNA 研究进展 | 第41页 |
| 4 本研究的目的与意义 | 第41-43页 |
| 第二章 材料与方法 | 第43-52页 |
| 1 材料 | 第43-45页 |
| ·样品的采集与鉴定 | 第43页 |
| ·主要仪器 | 第43页 |
| ·主要试剂 | 第43-44页 |
| ·常用溶液配制 | 第44-45页 |
| 2 方法 | 第45-52页 |
| ·总DNA 提取方法 | 第45-46页 |
| ·PCR 引物的设计 | 第46-48页 |
| ·PCR 扩增 | 第48-49页 |
| ·PCR 反应体系组成 | 第48-49页 |
| ·PCR 反应条件 | 第49页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第49页 |
| ·PCR 产物的回收和纯化 | 第49页 |
| ·序列测定 | 第49-50页 |
| ·PCR 产物直接测序 | 第49-50页 |
| ·PCR 产物进行克隆后测序 | 第50页 |
| ·序列拼接及全序列的分析 | 第50页 |
| ·比较进化分析 | 第50-51页 |
| ·系统进化分析 | 第51-52页 |
| 第三章 结果与分析 | 第52-82页 |
| 1 斜带石斑鱼和赤点石斑鱼总DNA 提取结果 | 第52页 |
| 2 斜带石斑鱼和赤点石斑鱼 mtDNA 的 PCR 扩增结果 | 第52-55页 |
| 3 测序结果与序列拼接 | 第55页 |
| 4 碱基组成 | 第55页 |
| 5 基因组成与定位 | 第55-58页 |
| 6 限制性内切酶酶切图谱分析 | 第58-60页 |
| 7 MTDNA 中各类基因的分析 | 第60-82页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第60-65页 |
| ·蛋白质的起始与终止密码子使用情况 | 第60-61页 |
| ·蛋白编码基因密码子的碱基组成及含量 | 第61-63页 |
| ·蛋白编码基因密码子的利用情况 | 第63-65页 |
| ·tRNA 基因 | 第65-74页 |
| ·rRNA 基因 | 第74-75页 |
| ·D-Loop 控制区 | 第75-81页 |
| ·终止结合序列区 | 第76-77页 |
| ·中央保守区 | 第77页 |
| ·保守序列区 | 第77-80页 |
| ·控制区的进化速率 | 第80-81页 |
| ·L 链复制起始区 | 第81-82页 |
| 第四章 讨论 | 第82-95页 |
| 1 石斑鱼类线粒体基因组的进化比较 | 第82-87页 |
| ·斜带石斑鱼、赤点石斑鱼和豹纹鳃棘鲈线粒体各类基因的进化速率比较 | 第82-86页 |
| ·蛋白质编码基因进化速率比较 | 第82-84页 |
| ·tRNA 进化速率比较 | 第84-85页 |
| ·rRNA 进化速率比较 | 第85-86页 |
| ·主要非编码区进化速率比较 | 第86页 |
| ·斜带石斑鱼、赤点石斑鱼和豹纹鳃棘鲈的分歧时间 | 第86-87页 |
| 2 鲈形目鱼类系统进化及石斑鱼类在鲈形目中的进化地位 | 第87-95页 |
| ·鲈形目鱼类线粒体基因组长度及结构特征 | 第87-90页 |
| ·鲈形目鱼类线粒体基因组序列变异及碱基组成特征 | 第90-92页 |
| ·鲈形目鱼类系统进化分析 | 第92-94页 |
| ·石斑鱼类在鲈形目中的进化地位 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-108页 |
| 在学期间已发表论文 | 第108-109页 |
| 致谢语 | 第109页 |
