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嗜热毛壳菌热稳定超氧化物歧化酶的纯化及基因克隆和表达

中文摘要第1-12页
ABSTRACT第12-14页
第一章 文献综述第14-44页
 1. 引言第14页
 2. 超氧化物歧化酶的研究进展第14-34页
   ·SOD 的分布与类型第14-17页
   ·SOD 的结构和性质第17-25页
     ·SOD 的结构第17-23页
       ·SOD 的一级结构第17-19页
       ·SOD 的高级结构第19-23页
     ·SOD 的理化性质第23-25页
       ·SOD 是亲水性的蛋白质第23-24页
       ·SOD 的紫外吸收第24页
       ·金属辅基与酶活性第24页
       ·SOD 的还原和失活作用第24页
       ·SOD 的免疫原性第24-25页
       ·电离辐射对SOD 的影响第25页
       ·磁场对SOD 的影响第25页
   ·SOD 的分子生物学第25-32页
     ·SOD 编码的基因第25-27页
     ·SOD 的基因克隆和表达第27-30页
     ·SOD 的基因表达调控第30-32页
   ·SOD 的应用第32-34页
     ·SOD 在临床及工业上的应用第32-34页
     ·SOD 在农业领域的应用第34页
 3. 巴斯德毕赤酵母表达系统的研究进展第34-41页
   ·基因表达系统概述第34-36页
   ·巴斯德毕赤酵母的特性第36-37页
   ·毕赤酵母宿主菌和表达载体的类型第37-39页
   ·表达载体在毕赤酵母中的整合第39-41页
   ·巴斯德毕赤酵母中信号肽的剪切过程第41页
 4. 本研究的立题依据、研究内容和技术路线第41-44页
   ·立题依据第41-42页
   ·研究内容第42-43页
   ·技术路线第43-44页
第二章 嗜热毛壳菌(CHAETOMIUM THERMOPHILUM)超氧化物歧化酶的分离纯化及特性研究第44-68页
 1. 材料和方法第45-54页
   ·实验材料第45-46页
     ·供试菌株第45页
     ·培养基第45页
       ·固体PDA 培养基(马铃薯琼脂培养基)第45页
       ·液体Casein 培养基第45页
     ·主要仪器和试剂第45-46页
       ·仪器设备第45页
       ·试剂第45-46页
   ·实验方法第46-54页
     ·液体发酵培养第46页
     ·不同培养时间对超氧化物歧化酶产生的影响第46页
     ·酶活性测定第46页
       ·测定方法第46页
       ·酶的活力单位(U)第46页
     ·蛋白质含量测定第46-47页
     ·超氧化物歧化酶的分离纯化第47-48页
       ·粗酶液的制备第47页
       ·硫酸铵沉淀第47页
       ·DEAE-Sepharose 阴离子交换柱层析第47页
       ·Phenyl-Sepharose 疏水柱层析第47-48页
     ·纯度鉴定第48-50页
       ·电泳操作步骤第48页
       ·溶液的配制第48-50页
     ·分子量的测定第50-51页
       ·SDS-PAGE 测定蛋白质分子量第50-51页
       ·凝胶过滤层析测定蛋白质分子量第51页
     ·SOD 的非变性电泳(PAGE)及电泳的活性染色第51-53页
       ·SOD 的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)第51页
       ·SOD 的活性染色第51-52页
       ·凝胶的配制第52-53页
     ·超氧化物歧化酶性质的研究第53-54页
       ·SOD 的反应最适温度第53页
       ·SOD 的反应最适pH 值第53-54页
       ·SOD 的热稳定性第54页
       ·SOD 的pH 值稳定性第54页
     ·N-端氨基酸序列分析第54页
     ·SOD 种类的测定第54页
 2. 结果与分析第54-62页
   ·不同培养时间对产生超氧化物歧化酶的影响第54-55页
   ·C. thermophilum 超氧化物歧化酶的分离纯化及鉴定第55-57页
     ·DEAE-Sepharose 阴离子交换柱层析第55-56页
     ·Phenyl-Sepharose 疏水柱层析第56-57页
     ·超氧化物歧化酶纯化过程总表第57页
   ·超氧化物歧化酶的一般性质第57-61页
     ·SOD 的分子量第57-58页
     ·SOD 的最适反应温度第58-59页
     ·SOD 的最适反应pH 值第59-60页
     ·SOD 的热稳定性第60页
     ·SOD 的pH 值稳定性第60-61页
   ·N-端氨基酸序列测定第61-62页
   ·SOD 种类的测定第62页
 3. 讨论第62-68页
   ·研究结果第63-65页
   ·研究方法第65-67页
   ·今后还应开展的工作第67-68页
第三章 嗜热真菌超氧化物歧化酶的基因克隆及其序列分析第68-115页
 1. 材料和方法第69-87页
   ·材料第69-70页
     ·供试菌株第69页
     ·菌株与质粒第69页
     ·酶和生化试剂第69页
     ·仪器第69页
     ·培养基第69页
     ·溶液配制第69-70页
   ·嗜热真菌Mn-SOD 基因的cDNA 克隆第70-83页
     ·引物设计第70-72页
     ·总RNA 的提取( Trizol 法)第72-73页
     ·紫外检测RNA 产率和纯度第73页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第73-74页
     ·目的基因cDNA 中间片段的分离第74-78页
       ·目的基因cDNA 中间片段的扩增第74页
       ·PCR 产物回收第74-75页
       ·与载体连接第75页
       ·E.coli 感受态细胞的制备和转化第75-77页
       ·重组质粒的筛选与鉴定第77-78页
       ·序列测定第78页
     ·目的基因3’末端的分离第78-79页
       ·疏绵状嗜热丝孢菌Mn-SOD 基因3’末端的分离第78-79页
       ·嗜热毛壳菌Mn-SOD 基因3’末端的分离第79页
     ·目的基因5’末端的分离第79-83页
       ·cDNA 第一链的合成第79-80页
       ·cDNA 第一链的纯化第80页
       ·cDNA 第一链的加尾第80-81页
       ·RACE-PCR 扩增第81-82页
       ·二次PCR(巢式PCR)第82-83页
     ·目的基因全长cDNA 的克隆第83页
     ·全长序列的生物信息学分析第83页
   ·嗜热毛壳菌CuZn-SOD 基因的cDNA 和Genomic DNA 的克隆及序列分析第83-87页
     ·引物设计第83-85页
     ·目的基因cDNA 中间片段的扩增第85页
     ·目的基因3’末端的分离第85页
     ·目的基因全长cDNA 的克隆第85页
     ·全长序列的生物信息学分析第85页
     ·嗜热毛壳菌CuZn-SOD Genomic DNA 的克隆及序列分析第85-87页
       ·菌丝体DNA 的抽提第85-86页
       ·嗜热毛壳菌Genomic DNA PCR 扩增第86页
       ·CuZn-SOD 的DNA 序列分析第86-87页
 2 结果与分析第87-111页
   ·C. thermophilum 和T. lanuginosus 总RNA 的提取第87-88页
   ·嗜热真菌Mn-SOD 基因的分离第88-98页
     ·Mn-SOD 基因中间片段的分离第88-89页
     ·T. lanuginosus Mn-SOD 基因cDNA 3’-末端的分离及序列分析第89-92页
     ·C. thermophilum Mn-SOD 基因cDNA 3’-末端的分离第92-93页
     ·C. thermophilum Mn-SOD 基因cDNA 5’-末端的分离第93-94页
     ·C. thermophilum Mn-SOD 基因全长cDNA 的分离及扩增片段的序列拼接第94页
     ·C. thermophilum Mn-SOD 基因的核苷酸和氨基酸序列分析第94-98页
       ·Mn-SOD 基因的核苷酸序列分析第96-97页
       ·Mn-SOD 基因的氨基酸序列分析第97-98页
   ·嗜热毛壳菌CuZn-SOD 基因的分离第98-111页
     ·C. thermophilum CuZn-SOD 基因中间片段的分离第98-100页
     ·C. thermophilum CuZn-SOD 基因cDNA 3’-末端的分离第100-102页
     ·C. thermophilum CuZn-SOD 基因全长cDNA 的分离及扩增片段的序列拼接第102-103页
     ·嗜热毛壳菌CuZn-SOD Genomic DNA 的扩增第103-105页
     ·C. thermophilum CuZn-SOD 基因的核苷酸和氨基酸序列分析第105-111页
       ·CuZn-SOD 基因的核苷酸序列分析第106-107页
       ·CuZn-SOD 基因的氨基酸序列分析第107-111页
 3. 讨论第111-115页
第四章 嗜热毛壳菌CUZN-SOD 基因在毕赤酵母中的表达第115-143页
 1. 材料和方法第115-127页
   ·材料第115-117页
     ·菌株和质粒第115页
     ·酶和生化试剂第115-116页
     ·培养基及有关溶液的配制第116-117页
     ·主要仪器设备第117页
   ·实验方法第117-127页
     ·CuZn-SOD 成熟肽基因序列的分离第117-118页
       ·CuZn-SOD 成熟肽基因序列的限制性酶切位点分析第117页
       ·引物设计和CuZn-SOD 成熟肽基因序列的分离第117-118页
     ·CuZn-SOD 基因在毕赤酵母中的表达第118-127页
       ·酵母表达载体的构建第119页
       ·线性化质粒DNA 的制备第119-120页
       ·酵母转化第120-122页
       ·酵母转化子的筛选与鉴定第122-123页
       ·酵母转化子的PCR 鉴定第123-124页
       ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第124-125页
       ·酵母工程菌的培养和CuZn-SOD 的诱导分泌表达第125-126页
       ·表达产物的生物学活性检测第126页
       ·表达产物CuZn-SOD 的SDS-PAGE 分析第126页
       ·超氧化物歧化酶工程菌产酶曲线的测定第126页
       ·超氧化物歧化酶工程菌的遗传稳定性分析第126-127页
       ·超氧化物歧化酶工程菌表达产物的酶学性质第127页
 2. 结果与分析第127-139页
   ·CuZn-SOD 成熟肽基因序列的分离第127-129页
     ·CuZn-SOD 成熟肽基因序列的限制性酶切位点分析结果第127-128页
     ·CuZn-SOD 成熟肽基因序列的分离第128-129页
   ·超氧化物歧化酶基因 cz1 在毕赤酵母中的表达第129-139页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第129-131页
     ·重组酵母表达质粒pPIC9K/cz1 转化 Pichia pastoris GS115 及酵母转化子的筛选第131-134页
       ·酵母转化子的甲醇利用表型的筛选第131页
       ·酵母转化子的PCR 鉴定第131-134页
       ·cz1 基因多拷贝整合子的筛选第134页
     ·嗜热毛壳菌热稳定超氧化物歧化酶 cz1 基因在 Pichia pastoris 中的高 效表达及表达产物的检测第134-136页
       ·超氧化物歧化酶 cz1 基因在 Pichia pastoris 中的诱导表达和高表达 酵母菌株的筛选第134页
       ·超氧化物歧化酶酵母工程菌产酶曲线的测定第134-135页
       ·甲醇的体积分数对超氧化物歧化酶产量的影响第135-136页
       ·超氧化物歧化酶基因 cz1 表达产物的 SDS-PAGE 检测第136页
     ·超氧化物歧化酶酵母工程菌的遗传稳定性分析第136页
     ·表达超氧化物歧化酶CuZn-SOD 的酶学性质研究第136-139页
       ·表达超氧化物歧化酶CuZn-SOD 的最适反应温度第136-137页
       ·表达超氧化物歧化酶CuZn-SOD 的最适反应pH 值第137-138页
       ·表达超氧化物歧化酶CuZn-SOD 的热稳定性第138页
       ·表达超氧化物歧化酶CuZn-SOD 的pH 稳定性第138-139页
 3 讨论第139-143页
   ·影响Pichia pastoris 表达系统表达重组超氧化物歧化酶的因素第139-143页
第五章 结论和建议第143-145页
 1 结论第143-144页
 2 建议第144-145页
参考文献第145-161页
致谢第161-162页
攻读学位期间发表论文情况第162页

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