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水稻瘤矮病毒P8、Pns10基因的原核表达及生物信息学分析

独创性声明第1页
论文使用授权的说明第3-7页
摘要第7-8页
Abstract第8-9页
1 前言第9-17页
   ·RGDV研究进展第9-14页
   ·生物信息学研究进展第14-16页
   ·本研究目的意义第16-17页
2 材料与方法第17-30页
   ·实验材料第17-19页
     ·供试病毒第17页
     ·主要试剂第17页
     ·菌株与质粒第17页
     ·实验动物第17页
     ·实验仪器第17-19页
     ·软件与工具第19页
   ·实验方法第19-30页
     ·RGDV双链RNA的抽提及纯化定量第19-20页
       ·RGDV双链RNA的提取与纯化第19-20页
       ·双链RNA的分析定量第20页
     ·P8和Pns10基因的克隆第20-24页
       ·ORF分析及可靠性检验第20-21页
       ·P8和Pns10基因RT—PCR扩增第21-22页
       ·克隆操作第22-23页
       ·P8和Pns10基因的鉴定第23-24页
     ·P8和Pns10蛋白功能分析第24-25页
       ·蛋白质理化特性第24-25页
       ·蛋白质结构功能域预测第25页
       ·基序(Motif)搜索第25页
       ·蛋白质结构预测第25页
     ·呼肠孤病毒科的系统发育关系第25-26页
     ·P8和Pns10融合蛋白在大肠杆菌中表达第26-27页
       ·P8和Pns10原核表达载体的构建第26-27页
       ·融合蛋白的诱导表达第27页
       ·蛋白的SDS-PAGE电泳第27页
     ·融合蛋白特异性抗血清的制备及Western blot鉴定第27-30页
       ·融合蛋白抗血清的制备第27-28页
       ·间接ELISA测定抗血清效价第28页
       ·Western blot鉴定第28-30页
3.结果与分析第30-50页
   ·P8和Pns10基因的克隆及鉴定第30-34页
     ·ORF分析及可靠性检验第30-32页
     ·RT-PCR扩增第32页
     ·重组克隆质粒的筛选和鉴定第32-33页
     ·序列测定及分析第33-34页
   ·P8和Pns10蛋白功能分析第34-41页
     ·蛋白质理化特性分析第34页
     ·蛋白质结构功能域预测第34-36页
     ·基序(Motif)搜索第36-38页
     ·蛋白质结构预测第38-41页
   ·呼肠孤病毒科的系统发育分析第41-44页
   ·P8和Pns10的融合蛋白在大肠杆菌中表达第44-48页
     ·P8和Pns10原核表达载体的构建第44页
     ·重组质粒pGTP8、pGTPns10的酶切切鉴定第44-46页
     ·蛋白的SDS-PAGE分析第46-48页
   ·融合蛋白特异性抗血清的制备及Western blot鉴定第48-50页
     ·间接ELISA法测定抗血清效价第48页
     ·Western blot鉴定第48-50页
4 讨论第50-54页
   ·蛋白的结构特点与蛋白的表达特性第50页
   ·蛋白结构与功能关系第50-51页
   ·抗原决定簇预测第51-52页
   ·呼肠孤病毒科的系统发育关系第52-54页
小结第54-55页
参考文献第55-61页
致谢第61-62页
附录1 P8和Pns10基因核苷酸序列及氨基酸序列第62-65页
附录2 P8和Pns10蛋白的理化性质第65-66页
附录3 P8和Pns10蛋白二级结构预测第66-69页
附录4 建树所用到的呼肠孤病毒科病毒及其GenBank登录号第69页

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