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基于cDNA芯片的玉米O2/o2 NIL胚乳差异表达基因的分析及O2启动子结合蛋白的分离

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略语表第10-11页
1 前言第11-24页
   ·高赖氨酸玉米研究概述第11-13页
     ·玉米作传统饲料的优缺点第11页
     ·高赖氨酸或优质蛋白玉米研究的意义第11-12页
     ·玉米籽粒胚乳的蛋白质第12页
     ·玉米醇溶蛋白第12页
     ·改善玉米胚乳蛋白质品质的突变基因及其遗传第12-13页
   ·Opauqe2基因研究进展第13-17页
     ·O2位点功能等位基因的结构与功能第13-14页
     ·O2基因的表达与功能第14-17页
   ·芯片杂交技术第17-18页
   ·鉴定与已知的顺式作用因子结合的反式因子的方法第18-23页
     ·凝胶电泳迁移率变动分析第18-21页
     ·鉴定DNA结合蛋白的方法及其比较第21-23页
   ·本课题研究的目的和意义第23-24页
2 材料与方法第24-30页
   ·植物材料和取材第24页
   ·与芯片杂交探针的制各第24-25页
   ·芯片杂交第25-26页
   ·EMSA分析第26-27页
     ·EMSA探针的制备第26-27页
     ·核蛋白的抽提第27页
     ·核蛋白浓度测定第27页
     ·靶定DNA末端标记第27页
     ·结合反应第27页
     ·显影和定影第27页
   ·磁珠分离法得到与靶定DNA区域结合的蛋白质第27-29页
     ·末端标记生物素第27-28页
     ·磁珠分离与靶定DNA结合的蛋白第28-29页
   ·分离出的蛋白检测和分析第29-30页
3 结果与分析第30-42页
   ·芯片杂交结果分析第30-34页
   ·差异表达基因的分析第34-35页
     ·o2/o2材料醇溶蛋白基因的下调表达及效应分析第34-35页
     ·修饰基因和γ-zein基因上调表达第35页
   ·EMSA分析结果第35-39页
     ·PCR扩增靶定DNA的检测第35-37页
     ·核蛋白的检测第37页
     ·核蛋白浓度测定第37页
     ·在EMSA中结合反应条件的摸索第37-39页
     ·EMSA分析结果第39页
   ·磁珠分离蛋白的检测第39-40页
   ·质谱分析结果第40-42页
4 讨论第42-49页
   ·o2籽粒不良性状形成的原因分析第42-43页
   ·修饰基因和γ-zein基因第43-44页
   ·在两套O2/o2 NILs中共同检测到的克隆数第44页
   ·在测序的差异克隆中没有检测到O2或o2基因本身第44-45页
   ·Dynabeads磁珠分离结合蛋白第45-48页
   ·质谱在肽及蛋白质测序中的应用第48-49页
参考文献第49-57页
致谢第57-58页
附录1 CTAB法抽提大量DNA及DNA的纯化第58-59页
附录2 CASpure Gel Extraction Kit纯化回收DNA第59页
附录3 将片段与载体连接第59-60页
附录4 电转化第60-61页
附录5 核蛋白的抽提第61-63页
附录6 [γ-~(32)p]ATP标记末端DNA第63页
附录7 4.5%非变性聚丙烯酰胺凝胶(60ml)配方第63-64页
附录8 SDS-PAGE凝胶制备第64-65页
附录9 SDS-PAGE考马斯亮蓝染色第65页
附录10 SDS-PAGE银染法第65页

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