| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-12页 |
| 1 绪论 | 第12-23页 |
| ·引言 | 第12页 |
| ·柽柳的概况 | 第12-15页 |
| ·柽柳是一种良好的抗逆研究材料 | 第12-13页 |
| ·柽柳的研究现状 | 第13-15页 |
| ·植物基因组学研究进展 | 第15-17页 |
| ·结构基因组学研究内容 | 第16页 |
| ·功能基因组学 | 第16页 |
| ·比较基因组学 | 第16-17页 |
| ·生物信息学 | 第17-20页 |
| ·生物信息学的应用 | 第17-19页 |
| ·EST分析技术 | 第19页 |
| ·ESTs的主要应用 | 第19-20页 |
| ·基因克隆及表达研究技术 | 第20-22页 |
| ·RACE技术 | 第20-21页 |
| ·基因芯片技术 | 第21页 |
| ·抑制性消减杂交技术 | 第21页 |
| ·差异显示技术 | 第21-22页 |
| ·本研究课题的来源及主要研究内容 | 第22-23页 |
| 2 研究目标、研究内容与技术路线 | 第23-25页 |
| ·研究意义 | 第23页 |
| ·研究目标 | 第23页 |
| ·本实验的研究方法 | 第23-24页 |
| ·技术路线 | 第24-25页 |
| 3 木本植物总RNA提取方法的建立 | 第25-35页 |
| ·柽柳等木本植物总RNA的提取方法的建立 | 第25页 |
| ·CTAB法提取植物总RNA研究 | 第25-27页 |
| ·材料与方法 | 第25-26页 |
| ·结果分析 | 第26-27页 |
| ·SDS法提取植物总RNA | 第27-30页 |
| ·材料与方法 | 第27-28页 |
| ·结果分析 | 第28-30页 |
| ·两种RNA分离方法的评价 | 第30-31页 |
| ·木本植物RNA的提取方法的研究 | 第31-34页 |
| ·提取植物组织RNA时常遇到的问题 | 第31-34页 |
| ·结论与讨论 | 第34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 4 差异显示技术研究柽柳耐盐机理 | 第35-45页 |
| ·材料与方法 | 第35-40页 |
| ·材料处理 | 第35页 |
| ·试剂 | 第35页 |
| ·总RNA的制备及反转录 | 第35-36页 |
| ·mRNA差异显示 | 第36页 |
| ·PCR产物的测序胶电泳 | 第36-37页 |
| ·差异条带的回收及再扩增 | 第37页 |
| ·反向Northern检测 | 第37-38页 |
| ·克隆产物的PCR鉴定 | 第38-39页 |
| ·重组质粒的PCR检测 | 第39页 |
| ·第二次杂交检测 | 第39-40页 |
| ·Northern点杂交检测 | 第40页 |
| ·结果分析 | 第40-43页 |
| ·RNA的检测 | 第40页 |
| ·柽柳mRNA差异显示 | 第40页 |
| ·差异显示条带的回收检测 | 第40-41页 |
| ·差异基因的反向Northern检测 | 第41页 |
| ·第二次杂交检测 | 第41-42页 |
| ·Northern点杂交检测 | 第42页 |
| ·基因的测序和序列同源性比较 | 第42-43页 |
| ·结论与讨论 | 第43-45页 |
| 5 差异显示技术研究星星草NaHCO_3胁迫下基因的表达 | 第45-52页 |
| ·材料与方法 | 第45-49页 |
| ·材料处理 | 第45页 |
| ·试剂 | 第45页 |
| ·RNA的制备与纯化 | 第45-46页 |
| ·差异显示 | 第46页 |
| ·电泳及差异条带的获得 | 第46-48页 |
| ·差异表达序列的反向Northern检测 | 第48页 |
| ·差异表达序列的测序与同源性分析 | 第48-49页 |
| ·结果分析 | 第49-51页 |
| ·RNA的质量检测 | 第49页 |
| ·差异条带的回收 | 第49页 |
| ·反向Northern检测结果 | 第49-50页 |
| ·基因的序列同源性比较 | 第50-51页 |
| ·结论与讨论 | 第51-52页 |
| 6 消减杂交技术研究柽柳抗盐机理 | 第52-61页 |
| ·材料与方法 | 第52-55页 |
| ·材料处理 | 第52页 |
| ·消减杂交的引物序列 | 第52页 |
| ·总RNA的制备 | 第52-53页 |
| ·mRNA的分离与cDNA合成 | 第53-54页 |
| ·消减杂交 | 第54页 |
| ·消减文库的建立 | 第54-55页 |
| ·文库克隆序列测定 | 第55页 |
| ·消减文库的测序及序列同源性分析 | 第55页 |
| ·消减文库克隆的检测 | 第55页 |
| ·结果与分析 | 第55-58页 |
| ·总RNA质量的检测和Rsal酶切后cDNA电泳图 | 第55-56页 |
| ·消减杂交结果检测 | 第56页 |
| ·消减文库的反向Northern鉴定结果 | 第56-57页 |
| ·文库克隆的Northern杂交分析 | 第57页 |
| ·抗盐碱相关基因及序列相似性分析 | 第57-58页 |
| ·结论与讨论 | 第58-61页 |
| 7 NaHCO_3胁迫下柽柳基因表达谱的建立 | 第61-82页 |
| ·材料与方法 | 第61-63页 |
| ·NaHCO_3处理的柽柳cDNA文库的构建 | 第61-62页 |
| ·测序模板的准备与测序 | 第62-63页 |
| ·序列的编辑与分析 | 第63页 |
| ·结果与分析 | 第63-76页 |
| ·柽柳cDNA文库的质量 | 第63页 |
| ·柽柳文库ESTs的主要特性分析 | 第63页 |
| ·柽柳文库EST的GO(Gene Ontology)分类 | 第63-67页 |
| ·柽柳文库EST的按功能分类 | 第67-76页 |
| ·结论与讨论 | 第76-82页 |
| ·高质量cDNA文库的建立 | 第76-77页 |
| ·柽柳可能的抗逆途径 | 第77-81页 |
| ·NaHCO_3胁迫的柽柳文库构建意义 | 第81-82页 |
| 8 基因芯片技术研究柽柳基因的表达 | 第82-95页 |
| ·材料和方法 | 第82-84页 |
| ·材料 | 第82页 |
| ·柽柳的处理及RNA制备 | 第82-83页 |
| ·荧光标记与芯片杂交 | 第83页 |
| ·数据分析 | 第83-84页 |
| ·NaHCO_3处理芯片结果分析 | 第84-87页 |
| ·NaHCO_3处理下柽柳基因芯片表达谱 | 第84-85页 |
| ·基因的上调与下调表达 | 第85-87页 |
| ·干旱处理芯片结果分析 | 第87-89页 |
| ·基因芯片表达谱 | 第87页 |
| ·基因的上调与下调表达 | 第87-89页 |
| ·结论与讨论 | 第89-95页 |
| ·NaHCO_3胁迫下柽柳基因的表达特点 | 第89-91页 |
| ·干旱胁迫下柽柳基因的表达特点 | 第91-95页 |
| 9 干旱与NaHCO_3胁迫下柽柳基因表达的比较分析 | 第95-101页 |
| ·材料方法 | 第95-96页 |
| ·高密度表达芯片及杂交 | 第95页 |
| ·数据分析 | 第95-96页 |
| ·结果分析 | 第96-98页 |
| ·干旱、NaHCO_3胁迫下柽柳基因表达谱的建立 | 第96页 |
| ·干旱和NaHCO_3胁迫下上调或下调表达的基因 | 第96-98页 |
| ·结论与讨论 | 第98-101页 |
| ·NaHCO_3、旱胁迫下表达趋势相同的基因 | 第98-99页 |
| ·干旱、NaHCO_3胁迫后表达有差异的基因 | 第99-100页 |
| ·干旱、NaHCO_3胁迫下表达趋势相反的基因 | 第100-101页 |
| 10 柽柳抗逆基因的克隆 | 第101-137页 |
| ·生物信息学方法克隆全序列抗逆相关基因 | 第101-115页 |
| ·材料与方法 | 第101-102页 |
| ·结果分析 | 第102-115页 |
| ·RACE技术克隆柽柳抗逆基因 | 第115-137页 |
| ·材料与方法 | 第115-117页 |
| ·结果分析 | 第117-134页 |
| ·讨论 | 第134-137页 |
| 结论 | 第137-139页 |
| 参考文献 | 第139-147页 |
| 附录 | 第147-166页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第166-167页 |
| 致谢 | 第167页 |
