| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-18页 |
| ·水稻白叶枯病菌致病机制的研究现状 | 第12-14页 |
| ·水稻白叶枯病菌的致病机制 | 第12-13页 |
| ·Xoo 的基因组学研究 | 第13页 |
| ·Xoo 与水稻互作简介 | 第13-14页 |
| ·细菌环鸟苷二磷酸 c-di-GMP 信号机制 | 第14-15页 |
| ·c-di-GMP 的生物学功能 | 第15页 |
| ·c-di-GMP 的代谢与调控 | 第15页 |
| ·细菌三型分泌系统 | 第15-16页 |
| ·本研究的目的意义和技术路线 | 第16-18页 |
| ·研究目的和意义 | 第16-17页 |
| ·技术路线 | 第17-18页 |
| 第二章 水稻白叶枯病菌 c-di-GMP 信号蛋白基因 PXO_01021 的功能分析 | 第18-37页 |
| ·实验材料 | 第20-22页 |
| ·菌株和质粒 | 第20-21页 |
| ·生化试剂及使用仪器 | 第21页 |
| ·培养基和菌株培养条件 | 第21-22页 |
| ·实验方法 | 第22-26页 |
| ·Xoo 基因组 DNA 的制备 | 第22-23页 |
| ·标记置换法构建ΔPXO_01021 | 第23-25页 |
| ·构建突变体的互补菌株 | 第25页 |
| ·突变体的致病性和致敏性（HR）检测 | 第25页 |
| ·突变体的运动性（motility）检测 | 第25-26页 |
| ·突变体的生物膜（biofilm）形成的检测 | 第26页 |
| ·结果与分析 | 第26-35页 |
| ·基因克隆及连接克隆载体 | 第26-27页 |
| ·左右臂克隆与克隆质粒构建 | 第27-28页 |
| ·突变体质粒的构建 | 第28页 |
| ·突变体的筛选 | 第28-29页 |
| ·突变体互补菌株的筛选 | 第29页 |
| ·突变体致病性检测 | 第29-31页 |
| ·突变体生长曲线测定 | 第31-33页 |
| ·突变体生物膜测定 | 第33-34页 |
| ·突变体致敏性检测 | 第34-35页 |
| ·突变体运动性测定 | 第35页 |
| ·讨论 | 第35-37页 |
| 第三章 外源信号分子对 PXO_01021 基因表达调控的分析 | 第37-48页 |
| ·实验材料 | 第38页 |
| ·关于载体的供试菌株、生物试剂及使用仪器 | 第38页 |
| ·实验方法 | 第38-41页 |
| ·RNA 的提取 | 第38页 |
| ·cDNA 的合成 | 第38-39页 |
| ·RT-qPCR 原理及程序 | 第39页 |
| ·外界信号调控的研究 | 第39-40页 |
| ·PXO_01021 的启动子分析及活性检测 | 第40页 |
| ·启动子扩增、纯化及连接克隆载体 | 第40-41页 |
| ·启动子连接中间载体 pBluescript II KS+ | 第41页 |
| ·PXO_01021-p::gfp 连接目的载体 pBBR1CMS | 第41页 |
| ·结果与分析 | 第41-46页 |
| ·PXO_01021 表达受外界信号的影响 | 第41-43页 |
| ·基因启动子的确定、扩增与纯化 | 第43-44页 |
| ·启动子连接中间载体 pBluescript II KS+ | 第44-45页 |
| ·PXO_01021-p::gfp 连接目的载体 pBBR1CMS | 第45页 |
| ·启动子活性的检测 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-48页 |
| 第四章 基因簇 PXO_01021/PXO_01020/PXO_01019/ PXO_01018 的转录分析 | 第48-51页 |
| ·实验材料 | 第48页 |
| ·菌株、质粒和培养条件 | 第48页 |
| ·生化试剂 | 第48页 |
| ·实验方法 | 第48-49页 |
| ·Xoo 基因组 RNA 的制备 | 第48-49页 |
| ·cDNA 的合成 | 第49页 |
| ·RT-PCR | 第49页 |
| ·结果与分析 | 第49-50页 |
| ·RNA 的提取 | 第49页 |
| ·转录单元的验证 | 第49-50页 |
| ·讨论 | 第50-51页 |
| 第五章 全文结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 附录 1 | 第58页 |
| 附录 2 | 第58-59页 |
| 附录 3 QS 信号系统调控水稻白叶枯菌 T3SS 相关基因的表达 | 第59-65页 |
| 1 实验材料 | 第59-60页 |
| 2 实验方法 | 第60-61页 |
| ·引物合成 | 第60页 |
| ·白叶枯总 RNA 的提取 | 第60页 |
| ·cDNA 的合成 | 第60-61页 |
| ·实时定量 PCR 反应程序及体系 | 第61页 |
| 3 实验结果 | 第61-64页 |
| ·扩增目的基因片段引物的设计及特异性检验 | 第61页 |
| ·RNA 的提取 | 第61-62页 |
| ·荧光定量检测基因的相对表达量 | 第62-64页 |
| 4 讨论 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 作者简历 | 第66页 |
