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基于宏基因组的芳烃加氧酶获取及特性研究

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
1 宏基因组学技术的研究进展第12-36页
   ·微生物的多样性与可培养性第12-15页
     ·微生物的多样性及意义第12页
     ·可培养微生物第12-14页
     ·未培养微生物第14-15页
   ·宏基因组学研究进展第15-30页
     ·宏基因组学的起源第15-17页
     ·宏基因组学的技术策略第17-24页
     ·宏基因组学的应用第24-29页
     ·宏基因组学的瓶颈及发展第29-30页
   ·芳环加氧酶第30-34页
     ·芳环加氧酶的分类及催化机理第30-33页
     ·芳环加氧酶的应用第33-34页
   ·本论文研究内容及意义第34-36页
     ·选题依据第34页
     ·本论文研究内容及意义第34-36页
2 宏基因组DNA的提取第36-50页
   ·材料与方法第36-43页
     ·实验材料第36-37页
     ·实验方法第37-43页
   ·结果与讨论第43-49页
     ·溶菌酶-SDS-蛋白酶K法提取宏基因组DNA的条件优化第43-47页
     ·试剂盒提取活性污泥宏基因组DNA第47-48页
     ·CTAB法提取活性污泥宏基因组DNA第48页
     ·琼脂糖包埋法提取活性污泥宏基因组DNA第48-49页
   ·本章小结第49-50页
3 宏基因组Fosmid文库的构建第50-55页
   ·材料与方法第50-51页
     ·实验材料第50-51页
     ·实验方法第51页
   ·结果与讨论第51-54页
   ·本章小结第54-55页
4 宏基因组中芳烃加氧酶的筛选策略第55-65页
   ·材料与方法第55-60页
     ·实验材料第55-56页
     ·实验方法第56-60页
   ·结果与讨论第60-64页
     ·Fosmid文库的活性筛选第60-61页
     ·Fosmid文库的序列筛选第61-63页
     ·宏基因组DNA的直接PCR扩增第63-64页
   ·本章小结第64-65页
5 芳烃加氧酶基因侧翼序列的获取第65-83页
   ·材料与方法第65-73页
     ·实验材料第65-66页
     ·实验方法第66-73页
   ·结果与讨论第73-82页
     ·苯酚羟化酶基因侧翼未知序列的扩增第73-81页
     ·2,3-二羟基联苯1,2-双加氧酶基因侧翼未知序列的扩增第81-82页
   ·本章小结第82-83页
6 苯酚羟化酶基因的序列分析及表达第83-101页
   ·材料与方法第83-89页
     ·实验材料第83-84页
     ·实验方法第84-89页
   ·结果与讨论第89-100页
     ·苯酚羟化酶基因的序列分析第89-92页
     ·苯酚羟化酶基因的克隆第92-94页
     ·苯酚羟化酶基因的突变修复第94-96页
     ·苯酚羟化酶基因的异源表达第96-100页
   ·本章小结第100-101页
7 2,3-二羟基联苯1,2-双加氧酶基因的表达及特性第101-119页
   ·材料与方法第101-107页
     ·实验材料第101-102页
     ·实验方法第102-107页
   ·结果与讨论第107-118页
     ·2,3-二羟基联苯1,2-双加氧酶基因的序列分析第107-108页
     ·2,3-二羟基联苯1,2-双加氧酶基因的克隆与构建第108-109页
     ·bphC_meta基因的突变修复第109-110页
     ·BphC_meta的表达及特性考察第110-118页
   ·本章小结第118-119页
8 芳烃加氧酶获取策略的评价第119-130页
   ·材料与方法第119-121页
     ·实验材料第119-120页
     ·实验方法第120-121页
   ·结果与讨论第121-128页
     ·Sphingomonas xenophaga QYY中邻苯二酚双加氧酶的获取第121-123页
     ·宏基因组学技术与纯培养技术的综合评价第123-126页
     ·三种宏基因组学筛选策略的评价第126-127页
     ·不同筛选策略的总结第127页
     ·宏基因组学技术未来的发展趋势第127-128页
   ·本章小结第128-130页
9 结论与建议第130-132页
   ·主要结论第130-131页
   ·建议第131-132页
创新点摘要第132-133页
参考文献第133-143页
附录A 活性污泥宏基因组中苯酚羟化酶基因序列登录GenBank第143-148页
附录B 活性污泥宏基因组中bphC基因序列登录GenBank第148-150页
作者简介第150页
攻读博士学位期间发表学术论文情况第150-151页
致谢第151-152页

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