生物序列分析中若干概率模型研究及应用
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-25页 |
| ·生物序列分析的研究背景 | 第9页 |
| ·生物序列分析的一些基础知识 | 第9-11页 |
| ·生物序列分析中数学模型的研究概况 | 第11-23页 |
| ·生物序列分析中比对模型的研究概况 | 第11-15页 |
| ·生物序列分析中非比对模型的研究概况 | 第15-23页 |
| ·本文的主要内容 | 第23-25页 |
| 2 马尔可夫链模型 | 第25-43页 |
| ·引言 | 第25页 |
| ·DNA序列的双核酸成份相对丰度值 | 第25-26页 |
| ·马尔可夫链的基本概念 | 第26-27页 |
| ·DNA序列的马尔可夫链模型 | 第27-32页 |
| ·DNA序列的马尔可夫链模型的构建 | 第27页 |
| ·DNA序列的马尔可夫链模型的参数估计 | 第27-28页 |
| ·DNA序列的马尔可夫链模型中的加权相对熵 | 第28-32页 |
| ·DNA序列的马尔可夫链模型的应用 | 第32-41页 |
| ·相似性搜索 | 第32-35页 |
| ·进化分析 | 第35-41页 |
| ·本章小结 | 第41-43页 |
| 3 条件多项式分布模型 | 第43-57页 |
| ·引言 | 第43-44页 |
| ·几何分布模型 | 第44-46页 |
| ·DNA序列的间隔数值表示 | 第44页 |
| ·DNA序列的间隔序列的几何分布模型 | 第44-46页 |
| ·条件多项式分布模型 | 第46-53页 |
| ·条件多项式分布模型的构建 | 第46页 |
| ·条件多项式分布的参数估计 | 第46-47页 |
| ·k阶多项式成份向量(k-MCV) | 第47-48页 |
| ·k阶多项式完全成份向量(CMCV(S,k)) | 第48页 |
| ·条件多项式分布模型中k的选择 | 第48-52页 |
| ·k阶多项式成份向量k-MCV的χ~2得分 | 第52页 |
| ·k阶多项式完全成份向量的累积得分 | 第52-53页 |
| ·条件多项式分布模型在进化分析中的应用 | 第53-56页 |
| ·本章小结 | 第56-57页 |
| 4 公共子串模型 | 第57-69页 |
| ·引言 | 第57页 |
| ·K字符串模型 | 第57-60页 |
| ·K字符串模型的构建 | 第57-58页 |
| ·K字符串统计模型中的度量 | 第58-60页 |
| ·最长公共子串 | 第60-61页 |
| ·最长公共子串模型 | 第60页 |
| ·平均公共子串测度(ACS) | 第60-61页 |
| ·公共子串的调和分布 | 第61-67页 |
| ·公共子串的调和分布 | 第61页 |
| ·公共子串的调和分布测度 | 第61-62页 |
| ·公共子串的调和分布在转铁蛋白进化分析的应用 | 第62-67页 |
| ·本章小结 | 第67-69页 |
| 结论 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-79页 |
| 攻读博士学位期间发表、完成学术论文情况 | 第79-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 作者简介 | 第82-83页 |
