| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 缩略语说明 | 第10-15页 |
| 第一章 前言 | 第15-31页 |
| ·天然产物研究背景 | 第15-18页 |
| ·天然产物结构研究概况 | 第15-17页 |
| ·天然产物活性研究概况 | 第17-18页 |
| ·可用于天然产物研究的计算机技术 | 第18-23页 |
| ·结构预测 | 第18-19页 |
| ·绝对构型的计算 | 第19页 |
| ·数据库构建 | 第19-20页 |
| ·虚拟筛选 | 第20-22页 |
| ·正向对接 | 第20页 |
| ·反向对接 | 第20页 |
| ·分子相似性搜索 | 第20-22页 |
| ·基于药效团的筛选 | 第22页 |
| ·分子网络在中药中的应用 | 第22-23页 |
| ·研究方案 | 第23-26页 |
| ·选题指导思想 | 第23-24页 |
| ·课题设计 | 第24-26页 |
| ·量化计算确定绝对构型的设计 | 第24页 |
| ·通过正向对接活性化合物的发现 | 第24页 |
| ·通过反向对阐述药用植物的作用机理 | 第24-26页 |
| 参考文献 | 第26-31页 |
| 第二章 通过量子化学计算确定天然产物的绝对构型 | 第31-83页 |
| ·前言 | 第31页 |
| ·理论知识 | 第31-35页 |
| ·圆二色光谱(ECDs)及其计算 | 第31-33页 |
| ·旋光及其计算 | 第33-34页 |
| ·13C-NMR 及其计算 | 第34页 |
| ·Gaussian 软件 | 第34-35页 |
| ·通过计算天然产物小分子的 ECDs、旋光、NMR 来确定绝对构型 | 第35-79页 |
| ·前言 | 第35-36页 |
| ·天然刚性分子的计算 | 第36-45页 |
| ·天然产物小分子 1 的计算 | 第36-39页 |
| ·小分子 2 和 3 的计算 | 第39-43页 |
| ·化合物 4 的计算 | 第43-45页 |
| ·天然柔性结构的计算 | 第45-79页 |
| ·天然产物小分子 5 的计算 | 第45-52页 |
| ·天然产物小分子 6 的计算 | 第52-61页 |
| ·天然小分子 7 的计算 | 第61-73页 |
| ·天然小分子 8 的计算 | 第73-79页 |
| ·本章小结 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-83页 |
| 第三章 通过正向对接从天然产物中寻找活性化合物 | 第83-118页 |
| ·前言 | 第83页 |
| ·天然产物数据库的建立 | 第83-86页 |
| ·天然产物数据库介绍 | 第84-85页 |
| ·天然产物库建立的方法 | 第85-86页 |
| ·工具 | 第85-86页 |
| ·方法 | 第86页 |
| ·通过正向对接从天然产物中寻找 Bcl-2 的抑制剂 | 第86-112页 |
| ·实验背景 | 第86-89页 |
| ·实验流程 | 第89页 |
| ·实验结果与讨论 | 第89-107页 |
| ·对接结果 | 第89-96页 |
| ·荧光偏振（Fluorescence Polarization，简称 FP）试验结果 | 第96-102页 |
| ·表明等离子共振(Surface Plasmon Resonance, SPR)实验结果 | 第102-104页 |
| ·细胞实验 | 第104-107页 |
| ·白血病动物实验 | 第107页 |
| ·实验方法 | 第107-112页 |
| ·分子对接 | 第107-108页 |
| ·荧光偏振 | 第108-109页 |
| ·SPR | 第109页 |
| ·细胞实验 | 第109-110页 |
| ·动物实验 | 第110-111页 |
| ·化合物 | 第111-112页 |
| ·本章总结 | 第112-113页 |
| 参考文献 | 第113-118页 |
| 第四章 通过反向对接阐述药用植物作用机理 | 第118-141页 |
| ·前言 | 第118-119页 |
| ·通过反向对接寻找药用植物金边瑞香和假马齿苋中主要化学成分治疗糖尿病的主要靶点以及起作用的主要成分 | 第119-139页 |
| ·研究思路 | 第119页 |
| ·结果与讨论 | 第119-131页 |
| ·结论 | 第131页 |
| ·实验部分 | 第131-139页 |
| ·化学 | 第131-139页 |
| ·反向对接 | 第139页 |
| ·体外酶活性测试 | 第139页 |
| ·本章总结 | 第139-140页 |
| 参考文献 | 第140-141页 |
| 第五章 全文总结 | 第141-143页 |
| ·主要结论 | 第141-142页 |
| ·研究展望 | 第142-143页 |
| 攻读博士期间发表的学术论文 | 第143-147页 |
| 攻读博士学位期间申请的专利 | 第147-149页 |
| 致谢 | 第149-150页 |
| 附录 | 第150-210页 |
