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土壤宏基因组文库构建与土壤微生物群落结构指示方法的初步建立

目录第1-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
前言第10-12页
第一章 文献综述第12-34页
 1 微生物生态学研究方法进展第12-21页
   ·荧光染料染色法第12页
   ·BIOLOG GN微平板研究单一碳源底物利用能力第12-13页
   ·生物标志法第13-14页
   ·DNA熔解(解链)及复性分析第14-15页
   ·PCR特异性扩增技术第15-16页
   ·rRNA基因同源性分析方法第16-18页
   ·核酸探针杂交技术第18-19页
   ·变性梯度凝胶电泳第19-20页
   ·荧光原位杂交方法第20-21页
 2 污染环境微生物分子生态学研究第21-28页
   ·分子生态学技术在污染环境中的应用第22-25页
     ·污染环境中微生物群落结构多样性第22页
     ·污染环境微生物种群动态分析第22-23页
     ·污染环境微生物适应性——质粒的分子生态效应第23-24页
     ·降解基因的分子生态学第24-25页
   ·微生物在污染环境中的分子生态效应第25-28页
     ·调节噪声假说第25-26页
     ·微生物对环境污染物获得适应性的途径第26-28页
 3 环境宏基因组研究第28-31页
   ·环境细菌多样性第28-29页
   ·建立宏基因组文库,寻求目标活性表达第29-31页
   ·机遇与挑战第31页
 4 REP与ERIC序列第31-34页
第二章 土壤宏基因组文库的构建第34-50页
 1 试验材料第34页
 2 试验方法第34-43页
   ·土壤DNA的提取第34-35页
   ·粗提DNA的纯化第35-36页
   ·土壤DNA酶切体系的建立第36页
   ·酶切片段回收与纯化第36-37页
   ·质粒DNA的提取(碱裂解法)第37-38页
   ·载体脱磷第38-39页
   ·酶连第39-40页
   ·感受态细胞的制备第40页
   ·转化第40-41页
   ·电转化第41-43页
   ·文库质量检查第43页
   ·文库构建策略第43页
 3 结果与分析第43-47页
   ·土壤总DNA的提取与纯化第43-45页
   ·Sau3AI部分酶切和DNA片段的回收纯化第45页
   ·质粒载体脱磷酸化效果验证第45页
   ·外源片段插入效率的验证第45-47页
   ·电转化效果第47页
   ·电转化所建文库质量的检查第47页
 4 讨论第47-50页
第三章 土壤微生物性状分子判别方法的初步建立第50-59页
 1 材料与方法第50-51页
   ·菌株第50页
   ·ERIC-PCR的引物序列第50页
   ·总DNA提取第50-51页
   ·PCR扩增条件第51页
 2 结果与分析第51-57页
   ·对单菌总DNA进行ERIC-PCR扩增第51-53页
   ·对混合微生物总DNA进行ERIC-PCR扩增第53-54页
   ·对土壤总DNA进行ERIC-PCR扩增第54-55页
   ·ERIC-PCR指纹图聚类分析第55-57页
 3 讨论第57-59页
全文总结第59-60页
参考文献第60-70页
附录Ⅰ第70-71页
附录Ⅱ第71-72页
致谢第72页

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