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盲鳗、七鳃鳗、有颌类的进化关系和重组蛋白活性鉴定

第一篇第1-6页
 摘要第4-5页
 Abstract第5-6页
第二篇第6-12页
 摘要第6-7页
 Abstract第7-12页
第一篇 基于生物信息学的48 个基因家族的系统发生分析揭示盲鳗、七鳃鳗和有颌类进化联系第12-30页
 第一章 基因与基因组进化研究中的生物信息学第12-16页
   ·生物信息学概述第12-13页
   ·基因家族进化研究中的若干概念简述第13-16页
     ·基因家族与蛋白质家族第13-14页
       ·基因家族第13页
       ·蛋白质家族第13-14页
     ·系统发生分析与系统发生树第14-15页
     ·基因或蛋白家族分析方法和步骤第15页
     ·基因家族进化研究中存在的问题第15-16页
 第二章 盲鳗,七鳃鳗,有颌类进化关系的研究进展第16-20页
   ·传统的圆口纲分类及我国的主要种类第16页
   ·最古老脊椎动物的活化石第16-17页
   ·进化关系的研究进展第17-20页
 第三章 48 个基因家族的系统发生分析及其探讨盲鳗、七鳃鳗和有颌类的进化联系第20-28页
   ·数据的获得第20页
     ·下载数据第20页
     ·可用序列的检测第20页
   ·分析方法第20-21页
     ·序列串联第20-21页
     ·构建系统发生树第21页
     ·选用不同的外群建树第21页
   ·结果第21-25页
     ·系统发生树阐明进化关系第21-22页
     ·串联序列构建的系统树第22-25页
   ·讨论第25-28页
     ·圆口纲理论的争议第25-26页
     ·外群选择对系统进化树的影响第26-27页
     ·软件算法对系统进化树的影响第27-28页
 第四章 全文总结第28-30页
第二篇 重组日本七鳃鳗口腔腺分泌L251 蛋白表达纯化及活性鉴定第30-57页
 第一章 文献综述第30-34页
   ·CRD 蛋白及其CRISP 家族第30-31页
     ·CRISP 家族概述第30页
     ·CRD 蛋白及其生化特性第30-31页
   ·T 淋巴细胞与自身免疫性疾病第31-34页
     ·T 淋巴细胞第31-32页
     ·自身免疫性疾病第32-34页
 第二章 L251 蛋白的表达及纯化第34-42页
   ·材料和方法第34-39页
     ·材料第34-35页
     ·方法第35-39页
       ·功能基因的EST 搜索第35页
       ·总RNA 的提取第35页
       ·调取目的基因并构建至质粒表达载体第35-36页
       ·将获取目的cDNA 的pET23b 载体转化入表达菌Rosetta 后进行阳性转化子的筛选鉴定;第36-37页
       ·对阳性重组子进行终浓度为1mmol/L 的IPTG 诱导表达第37页
       ·采用 SDS-PAGE 法对可溶性蛋白进行分析第37-38页
       ·对表达的重组蛋白进行变性条件下的组氨酸亲和层析纯化第38-39页
       ·L251 蛋白的复性第39页
       ·蛋白含量测定第39页
   ·结果第39-41页
     ·L251 的重组表达及纯化第39-41页
   ·讨论第41-42页
 第三章 T 淋巴细胞的分选第42-45页
   ·材料和方法第42-44页
     ·材料第42-43页
     ·方法第43-44页
       ·MNC 准备第43页
       ·预洗磁珠第43页
       ·从MNC 中分选T 细胞第43-44页
   ·结果第44页
   ·讨论第44-45页
 第四章 MTT 法检测T 淋巴细胞增殖抑制第45-47页
   ·材料和方法第45-46页
     ·材料第45页
     ·方法第45-46页
   ·结果第46-47页
   ·讨论第47页
 第五章 细胞周期法检测T 淋巴细胞增殖抑制第47-52页
   ·材料和方法第47-48页
     ·材料第47页
     ·方法第47-48页
   ·结果第48-52页
   ·讨论第52页
 第六章 CFSE 法检测T 淋巴细胞增殖抑制第52-56页
   ·材料和方法第52-53页
     ·材料第52-53页
     ·方法第53页
   ·结果第53-55页
   ·讨论第55-56页
 第七章 全文总结第56-57页
参考文献第57-65页
附录第65-79页
 附录Ⅰ. 48 个蛋白及选择物种第65-74页
 附录Ⅱ第74-76页
 附录Ⅲ. pET23b 质粒图谱第76-77页
 附录Ⅳ:SDS-PAGE 所需试剂第77页
 附录Ⅴ:亲和层析纯化所需试剂第77-79页
发表论文第79-80页
致谢第80页

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