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水稻细胞周期关键调节基因的全基因组分析及Orysa;DEL1功能的初步鉴定

摘要第1-15页
ABSTRACT第15-18页
1 引言第18-54页
   ·控制细胞周期的原理第18-21页
   ·细胞周期的主要调节因子第21-32页
     ·细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶(cyclin-dependent kinase, CDK)第21-25页
     ·细胞周期蛋白(cyclin)第25-28页
     ·细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶抑制剂(CDK inhibitor, CKI)第28-29页
     ·细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶亚单位(CDK subunit, CKS)第29页
     ·成视网膜瘤蛋白(Retinoblastoma, Rb)第29-30页
     ·E2F 转录因子第30-32页
   ·细胞周期的转换第32-38页
     ·G_1→S 的转换第32-35页
       ·Rb 蛋白的磷酸化调控细胞进入S 期第32-34页
       ·E2F/DP 调控G_1/S 的转换第34-35页
     ·G_2→M 的转换第35-36页
     ·核内再复制(endoreduplication)第36-38页
   ·激素调控细胞周期第38-43页
     ·生长素对细胞周期的调控第38-40页
     ·细胞分裂素对细胞周期的调控第40-42页
     ·其他激素对细胞周期的调控第42-43页
   ·细胞周期与生长发育第43-52页
     ·细胞周期的进入第44-48页
     ·细胞周期的退出第48-51页
       ·细胞周期的退出和细胞的分化第49-50页
       ·细胞周期的退出和环境的胁迫第50-51页
     ·控制DNA 完整性的检查点第51-52页
   ·本研究的目的和意义第52-54页
2 材料与方法第54-78页
   ·实验材料第54-55页
     ·水稻材料第54页
     ·菌株和质粒载体第54页
     ·酶、试剂盒、培养基、杂交膜、各种化学药品及仪器第54-55页
     ·PCR 引物第55页
   ·实验方法第55-78页
     ·序列数据的获取第55页
     ·进化树分析第55-56页
     ·蛋白质的亚细胞定位预测第56页
     ·植物基因组DNA 的提取、纯化第56-57页
       ·植物基因组DNA 的提取第56页
       ·植物基因组DNA 的纯化第56-57页
     ·植物组织总RNA 的提取、cDNA 的制备第57-59页
       ·植物总RNA 的提取第57-58页
       ·反转录cDNA 第一链的合成第58-59页
     ·PCR 的扩增及半定量RT-PCR第59-60页
       ·PCR 扩增第59页
       ·细胞周期基因在不同器官中的表达分析第59页
       ·生长素和细胞分裂素调节细胞周期基因表达的分析第59-60页
       ·转基因水稻的半定量RT-PCR 分析第60页
     ·目的基因的分离第60-61页
       ·目的基因的PCR 扩增第60-61页
       ·质粒DNA 的酶切鉴定第61页
       ·序列测定第61页
     ·表达载体的构建第61-63页
       ·Orysa;DEL 基因正义表达载体的构建第61-62页
       ·RNAi 表达载体的构建第62页
       ·GFP 融合表达载体的构建第62-63页
     ·Northern 杂交分析第63-66页
       ·总RNA 的提取第63页
       ·甲醛变性胶电泳第63-64页
       ·转膜第64页
       ·预杂交第64-65页
       ·探针的制备第65-66页
     ·RNA 原位杂交第66-72页
       ·材料的固定第66页
       ·材料的包埋第66-67页
       ·切片第67页
       ·正义和反义探针的制备第67-70页
       ·脱蜡、消化、乙酰化、杂交第70-71页
       ·洗片第71页
       ·检测第71-72页
     ·蛋白的亚细胞定位第72-74页
       ·材料准备第72页
       ·金粉准备第72页
       ·DNA 包裹金粉微粒第72-73页
       ·轰击操作第73-74页
     ·农杆菌介导的水稻转化第74-76页
       ·根癌农杆菌EHA105 感受态细胞的制备第74页
       ·电转法转化农杆菌第74-75页
       ·水稻成熟胚愈伤组织的诱导第75页
       ·水稻愈伤组织的转化第75-76页
     ·转基因水稻的组织化学鉴定第76-77页
     ·扫描电镜观察第77页
     ·共聚焦显微镜观察第77-78页
3 结果与分析第78-106页
   ·水稻细胞周期关键调节基因的获得第78-86页
     ·细胞周期蛋白家族第78-79页
     ·细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶家族第79-80页
     ·细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶抑制剂家族第80-83页
     ·E2F/DP 和Rb第83-85页
     ·CKS 和Wee第85-86页
   ·水稻细胞周期关键基因的基因组定位第86-88页
   ·水稻细胞周期关键基因的表达分析第88-96页
     ·水稻细胞周期关键基因的半定量RT-PCR 分析第88-90页
     ·水稻细胞周期基因的Northern 表达分析第90页
     ·水稻细胞周期关键基因的原位表达分析第90-92页
     ·水稻细胞周期关键基因表达对激素的响应第92-96页
       ·水稻细胞周期关键基因对生长素的响应第94页
       ·水稻细胞周期关键基因对细胞分裂素的响应第94-96页
   ·第96-106页
     ·Orysa DEL1 基因的分离第96-97页
     ·Orysa;DEL1 基因的核苷酸序列分析以及推导的氨基酸序列第97-99页
     ·Orysa;DEL1 蛋白的亚细胞定位第99-100页
     ·Orysa;DEL1 基因时空表达模式分析第100-101页
     ·Orysa;DEL1 基因在水稻中的遗传转化第101-104页
       ·正义和RNAi 表达载体的构建第101-102页
       ·转基因植株的鉴定第102-104页
     ·Orysa;DEL1 基因的过量表达影响转基因水稻的发育第104-106页
4 讨论第106-113页
   ·细胞周期关键基因的数目第106页
   ·细胞周期关键基因的结构与功能第106-107页
   ·细胞周期关键基因的表达第107-108页
   ·植物激素与细胞分裂第108-110页
   ·染色体片断重复与新基因的产生第110-111页
   ·Orysa;DEL1 基因的作用机制第111-113页
5 结论第113-114页
参考文献第114-140页
附录一第140-153页
攻读学位期间发表论文第153-154页
致谢第154页

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