| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 基因芯片技术及基因表达数据分析 | 第8-26页 |
| ·基因芯片技术 | 第8-12页 |
| ·基因芯片实验 | 第10-11页 |
| ·图像分析 | 第11-12页 |
| ·基因芯片数据分析 | 第12-24页 |
| ·缺失基因的估计 | 第12-13页 |
| ·数据归一化 | 第13-14页 |
| ·寻找差异表达基因 | 第14-15页 |
| ·聚类分析 | 第15页 |
| ·基因集合富集分析 | 第15-24页 |
| ·本论文的研究内容 | 第24-26页 |
| 第二章 CEPA：一种基于网络中心性的生物途径富集新方法 | 第26-43页 |
| ·研究背景 | 第26-30页 |
| ·CEPA方法的建立 | 第30-37页 |
| ·基因到节点的映射 | 第30-31页 |
| ·Pathway水平统计量的计算 | 第31-32页 |
| ·中心性度量(Centrality) | 第32-33页 |
| ·关键基因的影响 | 第33-34页 |
| ·真实数据的分析 | 第34-37页 |
| ·讨论 | 第37-38页 |
| ·CEPA的实现 | 第38-43页 |
| ·PID数据解析 | 第39-40页 |
| ·生成映射规则 | 第40页 |
| ·中心性度量的计算 | 第40-41页 |
| ·Pathway分值的计算 | 第41页 |
| ·Pathway分值的理论分布 | 第41-42页 |
| ·Pathway分值的非参数分布 | 第42-43页 |
| 第三章 CEPA在线分析平台的搭建 | 第43-63页 |
| ·CEPA的网站架构 | 第44-62页 |
| ·CePa的客户端 | 第45-53页 |
| ·网站服务器端 | 第53-57页 |
| ·计算服务器端 | 第57-62页 |
| ·本章小结 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-72页 |
| 研究生期间研究成果 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |