| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-16页 |
| ·引言 | 第8-9页 |
| ·基因 | 第9-11页 |
| ·基因的概述 | 第9页 |
| ·编码蛋白质基因 | 第9-10页 |
| ·非编码基因 | 第10-11页 |
| ·染色体进化 | 第11-13页 |
| ·染色体进化的概述 | 第11页 |
| ·染色体进化的研究进展 | 第11-12页 |
| ·染色体进化的生物学意义 | 第12-13页 |
| 参考文献 | 第13-16页 |
| 第二章 人类和黑猩猩染色体同义和非同义替代的非平行累积 | 第16-26页 |
| ·背景介绍 | 第16-17页 |
| ·材料和方法 | 第17-18页 |
| ·数据的获取 | 第17页 |
| ·替代速率的计算 | 第17页 |
| ·基因密度的计算 | 第17页 |
| ·重组速率 | 第17页 |
| ·统计分析 | 第17-18页 |
| ·结果和讨论 | 第18-24页 |
| ·人类和黑猩猩染色体有显著差异的同义替代速率 | 第18-20页 |
| ·不同系谱间dN 和dS 的相似性 | 第20-22页 |
| ·局部染色质环境对碱基替代的影响 | 第22页 |
| ·microRNA 基因对人类和黑猩猩进化的影响 | 第22-24页 |
| 参考文献 | 第24-26页 |
| 第三章 转座元件对人类组织特异性基因进化速率的影响 | 第26-37页 |
| ·背景介绍 | 第26-27页 |
| ·材料和方法 | 第27页 |
| ·数据的获得 | 第27页 |
| ·替代速率的计算 | 第27页 |
| ·转座元件的计算 | 第27页 |
| ·统计检验 | 第27页 |
| ·结果和讨论 | 第27-33页 |
| ·不同功能种类基因的进化速率 | 第27-29页 |
| ·转座元件密度和进化速率的相关性 | 第29-30页 |
| ·不同功能种类基因的转座元件密度的差异 | 第30-31页 |
| ·外显子和相应内含子的共进化性 | 第31-33页 |
| 参考文献 | 第33-37页 |
| 第四章 全文小结 | 第37-39页 |
| 附录一 《人类和黑猩猩染色体同义和非同义替代非平行累积》 | 第39-41页 |
| 附录二 《转座元件对人类组织特异性基因进化速率的影响》 | 第41-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第58页 |
