摘要 | 第9-12页 |
英文摘要 | 第12-15页 |
1 前言 | 第16-34页 |
1.1 研究目的与意义 | 第16页 |
1.2 文献综述 | 第16-32页 |
1.2.1 低温介导的ncRNA调控 | 第17-18页 |
1.2.2 LncRNA的研究进展 | 第18-22页 |
1.2.3 LncRNA的研究方法 | 第22-27页 |
1.2.4 miRNA的研究进展 | 第27-32页 |
1.3 本研究的技术路线 | 第32-33页 |
1.4 本研究的创新点 | 第33-34页 |
2 材料与方法 | 第34-53页 |
2.1 试验材料 | 第34-35页 |
2.1.1 实验仪器 | 第34-35页 |
2.1.2 实验试剂 | 第35页 |
2.2 试验方法 | 第35-53页 |
2.2.1 测试设计与取样 | 第35-37页 |
2.2.2 HiSeq测序及生物信息学分析 | 第37-40页 |
2.2.3 预测新lncRNA | 第40-41页 |
2.2.4 新lncRNA鉴定及家族分析 | 第41页 |
2.2.5 筛选抗寒相关lncRNA及与互作RNA的调控网络构建 | 第41-42页 |
2.2.6 miR398与抗寒相关lncRNA互作调控网络的构建 | 第42页 |
2.2.7 抗寒相关lncRNA-miR398-靶mRNA的互作验证 | 第42-46页 |
2.2.8 miR398与其靶基因及互作lncRNA的表达检测 | 第46-47页 |
2.2.9 与miR398互作的lncRNA的功能验证 | 第47-53页 |
3 结果与分析 | 第53-99页 |
3.1 冬小麦lncRNA在不同温度下表达谱的构建 | 第53-70页 |
3.1.1 Dn1测序数据处理及统计分析 | 第53-58页 |
3.1.2 冬小麦Dn1中新lncRNA的预测 | 第58-61页 |
3.1.3 冬小麦Dn1中lncRNA鉴定及表达分析 | 第61-70页 |
3.2 冬小麦Dn1中抗寒相关lncRNA的互作网络构建及功能预测 | 第70-82页 |
3.2.1 抗寒相关lncRNA的筛选 | 第70-74页 |
3.2.2 筛选抗寒相关lncRNA及与其互作RNA的调控网络构建 | 第74-82页 |
3.3 Dn1中抗寒相关lncRNA-miR398-靶mRNA的互作鉴定 | 第82-87页 |
3.3.1 miR398-lncRNA-靶mRNA的互作网络 | 第82-83页 |
3.3.2 miR398-靶mRNA的互作验证 | 第83页 |
3.3.3 RAP验证miR398-lncRNA-靶mRNA在RNA水平的互作 | 第83-87页 |
3.4 抗寒相关lncRNA与miR398的互作表达分析 | 第87-99页 |
3.4.1 与tae-miR398互作的lncRNA的克隆 | 第87-88页 |
3.4.2 LncRNA植物表达载体的构建 | 第88-90页 |
3.4.3 重组质粒的转化与检测 | 第90-91页 |
3.4.4 低温下转基因拟南芥中miR398-lncRNA-靶mRNA的表达分析 | 第91-95页 |
3.4.5 二穗短柄草中转入lncR9A的表达验证 | 第95-99页 |
4 讨论 | 第99-106页 |
4.1 生物信息学分析lncRNAs实验的可靠性 | 第99-100页 |
4.2 低温诱导下lncRNA介导的抗寒防御机制 | 第100-101页 |
4.3 基于ceRNA的RNA的调控功能分析 | 第101-102页 |
4.4 低温对lncRNA-miR398-靶mRNA(CSD1)的影响 | 第102-104页 |
4.5 下一步工作计划 | 第104-106页 |
5 结论 | 第106-107页 |
致谢 | 第107-108页 |
参考文献 | 第108-120页 |
附录 | 第120-121页 |
攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第121页 |