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冬小麦抗寒lncRNA筛选及与tae-miR398应答低温胁迫的互作研究

摘要第9-12页
英文摘要第12-15页
1 前言第16-34页
    1.1 研究目的与意义第16页
    1.2 文献综述第16-32页
        1.2.1 低温介导的ncRNA调控第17-18页
        1.2.2 LncRNA的研究进展第18-22页
        1.2.3 LncRNA的研究方法第22-27页
        1.2.4 miRNA的研究进展第27-32页
    1.3 本研究的技术路线第32-33页
    1.4 本研究的创新点第33-34页
2 材料与方法第34-53页
    2.1 试验材料第34-35页
        2.1.1 实验仪器第34-35页
        2.1.2 实验试剂第35页
    2.2 试验方法第35-53页
        2.2.1 测试设计与取样第35-37页
        2.2.2 HiSeq测序及生物信息学分析第37-40页
        2.2.3 预测新lncRNA第40-41页
        2.2.4 新lncRNA鉴定及家族分析第41页
        2.2.5 筛选抗寒相关lncRNA及与互作RNA的调控网络构建第41-42页
        2.2.6 miR398与抗寒相关lncRNA互作调控网络的构建第42页
        2.2.7 抗寒相关lncRNA-miR398-靶mRNA的互作验证第42-46页
        2.2.8 miR398与其靶基因及互作lncRNA的表达检测第46-47页
        2.2.9 与miR398互作的lncRNA的功能验证第47-53页
3 结果与分析第53-99页
    3.1 冬小麦lncRNA在不同温度下表达谱的构建第53-70页
        3.1.1 Dn1测序数据处理及统计分析第53-58页
        3.1.2 冬小麦Dn1中新lncRNA的预测第58-61页
        3.1.3 冬小麦Dn1中lncRNA鉴定及表达分析第61-70页
    3.2 冬小麦Dn1中抗寒相关lncRNA的互作网络构建及功能预测第70-82页
        3.2.1 抗寒相关lncRNA的筛选第70-74页
        3.2.2 筛选抗寒相关lncRNA及与其互作RNA的调控网络构建第74-82页
    3.3 Dn1中抗寒相关lncRNA-miR398-靶mRNA的互作鉴定第82-87页
        3.3.1 miR398-lncRNA-靶mRNA的互作网络第82-83页
        3.3.2 miR398-靶mRNA的互作验证第83页
        3.3.3 RAP验证miR398-lncRNA-靶mRNA在RNA水平的互作第83-87页
    3.4 抗寒相关lncRNA与miR398的互作表达分析第87-99页
        3.4.1 与tae-miR398互作的lncRNA的克隆第87-88页
        3.4.2 LncRNA植物表达载体的构建第88-90页
        3.4.3 重组质粒的转化与检测第90-91页
        3.4.4 低温下转基因拟南芥中miR398-lncRNA-靶mRNA的表达分析第91-95页
        3.4.5 二穗短柄草中转入lncR9A的表达验证第95-99页
4 讨论第99-106页
    4.1 生物信息学分析lncRNAs实验的可靠性第99-100页
    4.2 低温诱导下lncRNA介导的抗寒防御机制第100-101页
    4.3 基于ceRNA的RNA的调控功能分析第101-102页
    4.4 低温对lncRNA-miR398-靶mRNA(CSD1)的影响第102-104页
    4.5 下一步工作计划第104-106页
5 结论第106-107页
致谢第107-108页
参考文献第108-120页
附录第120-121页
攻读博士学位期间发表的学术论文第121页

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