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肿瘤PIK3CA突变的富集检测新方法研究

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
第一章 绪论第12-35页
    第一节 PIK3CA突变与肿瘤分子靶向治疗第12-19页
        1.1 肿瘤的分子靶向治疗第12-14页
        1.2 PI3K-AKT-mTOR信号通路概述第14-15页
        1.3 PIK3CA基因突变及其分子生物学意义第15-16页
        1.4 PIK3CA基因突变在靶向治疗中的预测作用第16-18页
        1.5 PIK3CA基因突变检测的意义第18-19页
    第二节 PIK3CA突变检测方法第19-24页
            2.1直接测序法(Direct Sequencing)第20页
        2.2 COLD-PCR 测序法(COLD-PCR Sequencing)第20-21页
        2.3 变性高效液相色谱法(Denaturing High Performance LiquidChromatography, dHPLC)第21-22页
        2.4 高分辨率熔解曲线分析技术(High Resolution Melting Curve analysis,HRM)第22页
        2.5 扩增阻碍突变系统(Amplification Refractory Mutation System, ARMS)第22-23页
        2.6 数字 PCR (Digital PCR)第23-24页
    第三节 锁核酸概述第24-26页
        3.1 LNA简介第24-25页
        3.2 LNA的性质第25-26页
        3.3 LNA在肿癟稀有突变检测中的应用第26页
    第四节 本论文的研究内容第26-28页
    参考文献第28-35页
第二章 PIK3CA稀有突变富集检测技术的的研究和应用第35-92页
    第一节 Looping out锁核酸探针用于PIK3CA突变检测第35-63页
        1.1 引言第35-36页
        1.2 材料与方法第36-45页
            1.2.1 细胞系DNA与临床标本第36-37页
            1.2.2 突变型阳性质粒的构建第37-40页
            1.2.3 引物和探针设计第40-42页
            1.2.4 人工合成靶序列熔解曲线分析第42页
            1.2.5 检测体系的优化第42-43页
            1.2.6 检测体系灵敏度考察第43页
            1.2.7 检测体系选择性考察第43-44页
            1.2.8 临床标本检测第44-45页
            1.2.9 数字PCR体系建立第45页
        1.3 结果第45-60页
            1.3.1 LPO-MMCA检测体系的建立第45-51页
            1.3.2 LPO-MMCA体系灵敏度考察第51页
            1.3.3 LPO-MMCA体系选择性考察第51-53页
            1.3.4 临床冰冻组织标本检测第53-60页
        1.4 讨论第60-63页
    第二节 LNA阻抑子预富集技术用于PIK3CA突变检测第63-84页
        2.1 引言第63-64页
        2.2 材料与方法第64-69页
            2.2.1 细胞系DNA、临床样本来源和突变阳性质粒的构建第64页
            2.2.2 引物和探针的设计第64-66页
            2.2.3 BK-MMCA检测体系的建立第66-68页
            2.2.4 检测体系灵敏度考察第68-69页
            2.2.5 检测体系选择性考察第69页
            2.2.6 临床标本检测第69页
        2.3 结果第69-81页
            2.3.1 BK-MMCA体系的建立第69-71页
            2.3.2 预富集体系LNA阻抑子阻抑性能考察第71-73页
            2.3.3 BK-MMCA体系高保真酶保真性考察第73-74页
            2.3.4 BK-MMCA体系灵敏度考察第74-75页
            2.3.5 BK-MMCA体系选择性考察第75-76页
            2.3.6 临床标本检测第76-81页
        2.4 讨论第81-84页
    第三节 PIK3CA稀有突变富集检测技术总结第84-88页
    参考文献第88-92页
英文缩写索引第92-93页
硕士期间发表交流论文第93-94页
致谢第94页

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