| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 前言 | 第11-21页 |
| 1.1 贝类养殖概况 | 第11-13页 |
| 1.1.1 我国贝类养殖现状 | 第11页 |
| 1.1.2 贝类大规模死亡的原因 | 第11-13页 |
| 1.2 微生物生态及其与水产养殖的关系 | 第13-17页 |
| 1.2.1 微生物生态学的概念 | 第13页 |
| 1.2.2 细菌群落与水产养殖 | 第13-14页 |
| 1.2.3 环境因子与微生物群落 | 第14-15页 |
| 1.2.4 微生物生态研究方法 | 第15-17页 |
| 1.3 含CARD基因研究 | 第17-19页 |
| 1.3.1 CARD的简介 | 第18页 |
| 1.3.2 含CARD基因命名与分类 | 第18页 |
| 1.3.3 含CARD基因参与的免疫反应与调控机制 | 第18-19页 |
| 1.3.4 含CARD基因在无脊椎动物中的研究进展 | 第19页 |
| 1.4 立题依据和研究内容 | 第19-21页 |
| 1.4.1 立题依据 | 第19-20页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第20-21页 |
| 2 实验材料和方法 | 第21-41页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-24页 |
| 2.1.1 实验菌株、细胞系及动物和实验引物 | 第21-22页 |
| 2.1.2 试剂耗材及仪器设备 | 第22-24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-41页 |
| 2.2.1 采样站点设置与样品采集处理 | 第24-26页 |
| 2.2.2 环境参数的测定 | 第26页 |
| 2.2.3 海水样品基因组DNA的提取 | 第26-27页 |
| 2.2.4 16SrDNA的高通量测序与数据分析 | 第27页 |
| 2.2.5 绝对定量PCR标准曲线的建立 | 第27-30页 |
| 2.2.6 细菌16SrDNA及致病菌毒力基因拷贝数的检测 | 第30页 |
| 2.2.7 长牡蛎RNA的提取及cDNA文库的构建 | 第30-32页 |
| 2.2.8 CgCARDCP-1基因的序列分析 | 第32-33页 |
| 2.2.9 CgCARDCP-1重组蛋白表达及纯化 | 第33-35页 |
| 2.2.10 多克隆抗体制备 | 第35页 |
| 2.2.11 WesternBlotting | 第35-36页 |
| 2.2.12 相对定量实时荧光PCR | 第36页 |
| 2.2.13 免疫荧光组化 | 第36-37页 |
| 2.2.14 重组蛋白与LPS结合实验 | 第37页 |
| 2.2.15 细胞培养与转染 | 第37-39页 |
| 2.2.16 细胞裂解及Luciferase检测 | 第39-40页 |
| 2.2.17 长牡蛎免疫刺激实验 | 第40页 |
| 2.2.18 实验数据处理 | 第40-41页 |
| 3 实验结果 | 第41-65页 |
| 3.1 贝类养殖水域环境因子的年际变化 | 第41-43页 |
| 3.2 贝类养殖水域细菌群落的时空变化 | 第43-54页 |
| 3.2.1 细菌多样性变化 | 第43-46页 |
| 3.2.2 细菌群落组成及其动态变化 | 第46-51页 |
| 3.2.3 致病菌丰度的时空变化 | 第51-54页 |
| 3.3 细菌群落与环境因子的相关性 | 第54-56页 |
| 3.4 长牡蛎CARDCP-1基因的序列及组织分布特征 | 第56-60页 |
| 3.4.1 CgCARDCP-1基因的克隆及序列特征分析 | 第56-59页 |
| 3.4.2 CgCARDCP-1基因的组织分布特征 | 第59页 |
| 3.4.3 CgCARDCP-1重组蛋白的表达和抗体制备 | 第59-60页 |
| 3.4.4 CgCARDCP-1蛋白在血淋巴细胞中的定位 | 第60页 |
| 3.5 长牡蛎CARDCP-1对免疫刺激的响应模式 | 第60-61页 |
| 3.6 长牡蛎CARDCP-1分子的免疫学功能探究 | 第61-65页 |
| 3.6.1 CgCARDCP-1与LPS的结合 | 第61-62页 |
| 3.6.2 CgCARDCP-1参与NF-κB信号通路激活 | 第62-65页 |
| 4 分析与讨论 | 第65-71页 |
| 4.1 贝类养殖水域细菌的时空演替 | 第65-66页 |
| 4.2 贝类养殖水域细菌群落与环境因子间的关系 | 第66页 |
| 4.3 贝类相关致病菌的变化与其疾病发生的内在联系 | 第66-67页 |
| 4.4 长牡蛎CARDCP-1基因的分子特征及分布 | 第67-68页 |
| 4.4.1 CgCARDCP-1分子的基本特征 | 第67页 |
| 4.4.2 CgCARDCP-1在长牡蛎组织分布及在血淋巴细胞中的定位 | 第67-68页 |
| 4.5 长牡蛎CARDCP-1参与的免疫防御机制 | 第68-71页 |
| 4.5.1 免疫刺激后CgCARDCP-1分子mRNA时序表达变化 | 第68-69页 |
| 4.5.2 CgCARDCP-1可作为细胞内LPS特异性识别受体 | 第69页 |
| 4.5.3 CgCARDCP-1参与NF-κB信号通路的激活 | 第69-71页 |
| 5 结论 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-83页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第83-89页 |
| 致谢 | 第89页 |
