| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 缩写词 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-26页 |
| 1.1 杂种优势 | 第12-15页 |
| 1.1.1 古典理论和分子生物学解析 | 第12-13页 |
| 1.1.2 显性假说 | 第13页 |
| 1.1.3 超显性假说 | 第13页 |
| 1.1.4 伪超论假说 | 第13-14页 |
| 1.1.5 上位假说 | 第14页 |
| 1.1.6 整体假设 | 第14-15页 |
| 1.2 基因表达和杂种优势 | 第15-21页 |
| 1.2.1 转录调控模式 | 第16-18页 |
| 1.2.2 非编码区和转录控制杂种优势 | 第18页 |
| 1.2.3 表观遗传学和杂种优势 | 第18-20页 |
| 1.2.4 小RNA和杂种优势 | 第20-21页 |
| 1.3 基因功能和杂种优势 | 第21-22页 |
| 1.4 能源利用效率和杂种优势 | 第22页 |
| 1.5 未来的杂种优势研究方向 | 第22-24页 |
| 1.5.1 表型和基因型之间的对应关系 | 第23页 |
| 1.5.2 杂种优势的表观遗传学 | 第23页 |
| 1.5.3 生成交互网络 | 第23页 |
| 1.5.4 杂种优势研究的总体目标 | 第23-24页 |
| 1.6 立题依据 | 第24-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-34页 |
| 2.1 供试材料 | 第26页 |
| 2.2 实验仪器 | 第26-27页 |
| 2.3 实验试剂 | 第27页 |
| 2.4 实验方法 | 第27-31页 |
| 2.4.1 供试材料准备 | 第27页 |
| 2.4.2 植株总RNA提取 | 第27-28页 |
| 2.4.3 琼脂糖凝胶电泳 | 第28-29页 |
| 2.4.4 cDNA文库构建 | 第29-31页 |
| 2.5 部分测序结果荧光定量验证 | 第31-34页 |
| 2.5.1 棉花植株总RNA提取 | 第31页 |
| 2.5.2 RNA反转录 | 第31页 |
| 2.5.3 荧光定量PCR检测 | 第31-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-62页 |
| 3.1 杂交种与亲本之间全株干鲜重比较 | 第34-35页 |
| 3.2 杂交种与亲本之间根干鲜重比较 | 第35-36页 |
| 3.3 RNA电泳检测结果 | 第36-37页 |
| 3.4 RNA的完整性检测 | 第37-38页 |
| 3.5 lncRNA测序数据结果统计 | 第38-52页 |
| 3.5.1 测序数据质量评估 | 第38页 |
| 3.5.2 样品间相关性分析 | 第38-39页 |
| 3.5.3 候选lncRNA筛选 | 第39-40页 |
| 3.5.4 lncRNA表达水平分析 | 第40-41页 |
| 3.5.5 lncRNA靶基因预测 | 第41-42页 |
| 3.5.6 差异表达lncRNA靶基因GO富集分析 | 第42-44页 |
| 3.5.7 差异表达lncRNA靶基因KEGG富集分析 | 第44-46页 |
| 3.5.8 差异表达靶基因GO富集分析 | 第46-47页 |
| 3.5.9 差异表达转录本KEGG富集分析 | 第47-50页 |
| 3.5.10 差异表达lncRNA与mRNA水平分析 | 第50-51页 |
| 3.5.11 lncRNA与mRNA差异表达聚类分析 | 第51页 |
| 3.5.12 差异表达转录本韦恩图 | 第51-52页 |
| 3.6 基于上位假说的转录本分析 | 第52-54页 |
| 3.7 烟酸和烟酰胺代谢途径参与杂种优势的基因 | 第54-55页 |
| 3.8 甘油酯代谢中参与杂种优势的基因 | 第55-57页 |
| 3.9 昼夜节律及碳固定途径中参与杂交优势的基因 | 第57-60页 |
| 3.10 荧光定量PCR验证相关基因 | 第60-62页 |
| 4 讨论 | 第62-68页 |
| 4.1 烟酸和烟酰胺代谢途径参与杂种优势 | 第63-64页 |
| 4.2 甘油酯代谢参与杂种优势 | 第64-66页 |
| 4.3 昼夜节律和碳固定与杂种优势 | 第66-68页 |
| 5 结论 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-84页 |
| 致谢 | 第84-85页 |
