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基于转录组和亚细胞蛋白组学研究家蚕应答BmNPV感染的机制

致谢第4-5页
摘要第5-7页
Abstract第7-9页
文献综述第13-26页
    1. 家蚕中肠的结构和功能第13页
    2. 近等基因系第13页
    3. 昆虫杆状病毒的研究进展第13-16页
        3.1 NPV的类型第14页
        3.2 NPV的形态结构第14页
        3.3 NPV的生活史第14-15页
        3.4 NPV的两种表型第15页
        3.5 NPV侵染宿主的途径以及宿主对病毒的应答第15-16页
    4. 转录水平上家蚕抗BmNPV分子机理的研究进展第16页
    5. 蛋白水平上家蚕抗BmNPV分子机理的研究进展第16-17页
    6 转录组学研究概况第17-20页
        6.1 转录组测序技术第17-18页
        6.2 转录组测序的原理第18页
        6.3 基于转录组分析宿主应答病毒的侵染第18-19页
        6.4 转录组在家蚕抗逆方面的研究第19-20页
    7 蛋白质组学第20-22页
        7.1 2-DE在抗逆相关的研究进展第20-21页
        7.2 基于蛋白质组学分析家蚕抗性相关蛋白第21-22页
    8. 亚细胞蛋白质组学的研究概况第22-24页
        8.1 亚细胞蛋白质组学的研究进展第22-23页
        8.2 亚细胞蛋白质组学在宿主应答病原侵染方面的研究第23-24页
        8.3 亚细胞蛋白组学存在的局限性第24页
    9. 蛋白互作相关的研究第24-26页
        9.1 蛋白互作相关研究的技术第24-25页
        9.2 基于Far-western blot筛选病毒互作蛋白的研究概况第25-26页
1 引言第26-28页
    1. 研究的目的和意义第26页
    2. 本文研究内容第26-27页
    3. 技术路线第27-28页
2 材料与方法第28-41页
    2.1 实验材料第28-29页
        2.1.3 主要耗材、试剂第28页
        2.1.4 主要仪器第28-29页
    2.2 实验方法第29-41页
        2.2.1 样品制备第29-30页
        2.2.2 转录组分析第30-34页
        2.2.3 亚细胞蛋白质组分析第34-38页
        2.2.4 BmNPV互作蛋白筛选第38-40页
        2.2.5 转录组与亚细胞蛋白质组关联性分析第40-41页
第一章 基于比较转录组学分析不同抗性家蚕中肠应答BmNPV的侵染第41-61页
    1.1 实验结果第41-55页
        1.1.1 家蚕抗病性分析第41页
        1.1.2 转录组数据统计第41-42页
        1.1.3 转录组数可信度分析第42-44页
        1.1.4 差异表达基因及在应答BmNPV侵染中的作用第44-45页
        1.1.5 蛋白代谢,细胞骨架及细胞凋亡相关差异表达基因分析第45-49页
        1.1.6 免疫相关基因在不同抗性品系感染BmNPV后的表达分析第49-52页
        1.1.7 候选差异表达基因在BmNPV侵染中的功能分析第52-55页
    1.2 分析和讨论第55-60页
        1.2.1 不同抗性品系感染BmNPV后特异差异表达基因分析第55页
        1.2.2 蛋白代谢、细胞骨架和细胞凋亡在宿主应答BmNPV侵染中的作用第55-57页
        1.2.3 免疫相关基因应答BmNPV的侵染第57页
        1.2.4 BmNPV抗性相关差异表达基因分析第57-58页
        1.2.5 候选抗性相关基因在BmNPV侵染过程中的功能分析第58-60页
    1.3 小结第60-61页
第二章 基于亚细胞蛋白质组学分析不同抗性家蚕中肠应答BmNPV的侵染第61-89页
    2.1 结果第61-85页
        2.1.1 不同家蚕品系的抗性分析第61页
        2.1.2 家蚕中肠亚细胞组分分离质量分析第61-62页
        2.1.3 不同抗性家蚕品系中胞质酶源蛋白组分差异表达分析第62-68页
        2.1.4 不同抗性家蚕品系中线粒体蛋白组分差异表达分析第68-72页
        2.1.5 不同家蚕抗性品系中肠微粒体组分的表达分析第72-77页
        2.1.6 Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路分析各亚组分中差异表达蛋白第77-81页
        2.1.7 BmNPV感性相关差异表达蛋白分析第81页
        2.1.8 候选抗性相关的差异表达蛋白分析第81-82页
        2.1.9 Protein-protein interactions(PPIs)分析抗BmNPV相关蛋白第82-83页
        2.1.10 候选抗BmNPV相关蛋白的功能分析第83-85页
    2.2 讨论第85-88页
        2.2.1 亚细胞组分质量及质谱结果分析第85页
        2.2.2 Disease途径相关差异表达蛋白分析第85页
        2.2.3 候选抗性差异表达蛋白在BmNPV侵染过程中的功能分析第85-88页
    2.3 小结第88-89页
第三章 家蚕转录组与亚细胞蛋白组的关联性分析第89-92页
    3.1 结果分析第89-91页
        3.1.1 能量代谢相关通路关联分析第89-90页
        3.1.2 其他通路的关联分析第90-91页
    3.2 小结第91-92页
第四章 家蚕中肠Vacuolar ATP synthase (V-ATPase)与BmNPV的互作分析第92-98页
    4.1 结果分析第92-96页
        4.1.1 样品感染情况分析第92-93页
        4.1.2 家蚕中肠亚细胞蛋白组分分离质量分析第93页
        4.1.3 家蚕中肠亚细胞组分蛋白与BmNPV病毒粒子的互作分析第93-94页
        4.1.4 基于Far-Western blot验证鉴定的病毒互作蛋白第94-95页
        4.1.7 V-ATPaseA和B在不同家蚕抗性品系中的表达分析第95-96页
    4.2 讨论第96页
    4.3 小结第96-98页
结论与展望第98-99页
创新点第99-100页
参考文献第100-119页
个人简介第119-120页
附录第120页

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