致谢 | 第4-5页 |
摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
文献综述 | 第13-26页 |
1. 家蚕中肠的结构和功能 | 第13页 |
2. 近等基因系 | 第13页 |
3. 昆虫杆状病毒的研究进展 | 第13-16页 |
3.1 NPV的类型 | 第14页 |
3.2 NPV的形态结构 | 第14页 |
3.3 NPV的生活史 | 第14-15页 |
3.4 NPV的两种表型 | 第15页 |
3.5 NPV侵染宿主的途径以及宿主对病毒的应答 | 第15-16页 |
4. 转录水平上家蚕抗BmNPV分子机理的研究进展 | 第16页 |
5. 蛋白水平上家蚕抗BmNPV分子机理的研究进展 | 第16-17页 |
6 转录组学研究概况 | 第17-20页 |
6.1 转录组测序技术 | 第17-18页 |
6.2 转录组测序的原理 | 第18页 |
6.3 基于转录组分析宿主应答病毒的侵染 | 第18-19页 |
6.4 转录组在家蚕抗逆方面的研究 | 第19-20页 |
7 蛋白质组学 | 第20-22页 |
7.1 2-DE在抗逆相关的研究进展 | 第20-21页 |
7.2 基于蛋白质组学分析家蚕抗性相关蛋白 | 第21-22页 |
8. 亚细胞蛋白质组学的研究概况 | 第22-24页 |
8.1 亚细胞蛋白质组学的研究进展 | 第22-23页 |
8.2 亚细胞蛋白质组学在宿主应答病原侵染方面的研究 | 第23-24页 |
8.3 亚细胞蛋白组学存在的局限性 | 第24页 |
9. 蛋白互作相关的研究 | 第24-26页 |
9.1 蛋白互作相关研究的技术 | 第24-25页 |
9.2 基于Far-western blot筛选病毒互作蛋白的研究概况 | 第25-26页 |
1 引言 | 第26-28页 |
1. 研究的目的和意义 | 第26页 |
2. 本文研究内容 | 第26-27页 |
3. 技术路线 | 第27-28页 |
2 材料与方法 | 第28-41页 |
2.1 实验材料 | 第28-29页 |
2.1.3 主要耗材、试剂 | 第28页 |
2.1.4 主要仪器 | 第28-29页 |
2.2 实验方法 | 第29-41页 |
2.2.1 样品制备 | 第29-30页 |
2.2.2 转录组分析 | 第30-34页 |
2.2.3 亚细胞蛋白质组分析 | 第34-38页 |
2.2.4 BmNPV互作蛋白筛选 | 第38-40页 |
2.2.5 转录组与亚细胞蛋白质组关联性分析 | 第40-41页 |
第一章 基于比较转录组学分析不同抗性家蚕中肠应答BmNPV的侵染 | 第41-61页 |
1.1 实验结果 | 第41-55页 |
1.1.1 家蚕抗病性分析 | 第41页 |
1.1.2 转录组数据统计 | 第41-42页 |
1.1.3 转录组数可信度分析 | 第42-44页 |
1.1.4 差异表达基因及在应答BmNPV侵染中的作用 | 第44-45页 |
1.1.5 蛋白代谢,细胞骨架及细胞凋亡相关差异表达基因分析 | 第45-49页 |
1.1.6 免疫相关基因在不同抗性品系感染BmNPV后的表达分析 | 第49-52页 |
1.1.7 候选差异表达基因在BmNPV侵染中的功能分析 | 第52-55页 |
1.2 分析和讨论 | 第55-60页 |
1.2.1 不同抗性品系感染BmNPV后特异差异表达基因分析 | 第55页 |
1.2.2 蛋白代谢、细胞骨架和细胞凋亡在宿主应答BmNPV侵染中的作用 | 第55-57页 |
1.2.3 免疫相关基因应答BmNPV的侵染 | 第57页 |
1.2.4 BmNPV抗性相关差异表达基因分析 | 第57-58页 |
1.2.5 候选抗性相关基因在BmNPV侵染过程中的功能分析 | 第58-60页 |
1.3 小结 | 第60-61页 |
第二章 基于亚细胞蛋白质组学分析不同抗性家蚕中肠应答BmNPV的侵染 | 第61-89页 |
2.1 结果 | 第61-85页 |
2.1.1 不同家蚕品系的抗性分析 | 第61页 |
2.1.2 家蚕中肠亚细胞组分分离质量分析 | 第61-62页 |
2.1.3 不同抗性家蚕品系中胞质酶源蛋白组分差异表达分析 | 第62-68页 |
2.1.4 不同抗性家蚕品系中线粒体蛋白组分差异表达分析 | 第68-72页 |
2.1.5 不同家蚕抗性品系中肠微粒体组分的表达分析 | 第72-77页 |
2.1.6 Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路分析各亚组分中差异表达蛋白 | 第77-81页 |
2.1.7 BmNPV感性相关差异表达蛋白分析 | 第81页 |
2.1.8 候选抗性相关的差异表达蛋白分析 | 第81-82页 |
2.1.9 Protein-protein interactions(PPIs)分析抗BmNPV相关蛋白 | 第82-83页 |
2.1.10 候选抗BmNPV相关蛋白的功能分析 | 第83-85页 |
2.2 讨论 | 第85-88页 |
2.2.1 亚细胞组分质量及质谱结果分析 | 第85页 |
2.2.2 Disease途径相关差异表达蛋白分析 | 第85页 |
2.2.3 候选抗性差异表达蛋白在BmNPV侵染过程中的功能分析 | 第85-88页 |
2.3 小结 | 第88-89页 |
第三章 家蚕转录组与亚细胞蛋白组的关联性分析 | 第89-92页 |
3.1 结果分析 | 第89-91页 |
3.1.1 能量代谢相关通路关联分析 | 第89-90页 |
3.1.2 其他通路的关联分析 | 第90-91页 |
3.2 小结 | 第91-92页 |
第四章 家蚕中肠Vacuolar ATP synthase (V-ATPase)与BmNPV的互作分析 | 第92-98页 |
4.1 结果分析 | 第92-96页 |
4.1.1 样品感染情况分析 | 第92-93页 |
4.1.2 家蚕中肠亚细胞蛋白组分分离质量分析 | 第93页 |
4.1.3 家蚕中肠亚细胞组分蛋白与BmNPV病毒粒子的互作分析 | 第93-94页 |
4.1.4 基于Far-Western blot验证鉴定的病毒互作蛋白 | 第94-95页 |
4.1.7 V-ATPaseA和B在不同家蚕抗性品系中的表达分析 | 第95-96页 |
4.2 讨论 | 第96页 |
4.3 小结 | 第96-98页 |
结论与展望 | 第98-99页 |
创新点 | 第99-100页 |
参考文献 | 第100-119页 |
个人简介 | 第119-120页 |
附录 | 第120页 |