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猪圆环病毒Ⅱ型Capsid表面Loop BC的结构与功能研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
第一章 绪论第9-21页
    1.1 猪圆环病毒的防治第9-11页
    1.2 国内外研究现状第11-15页
        1.2.1 猪圆环病毒的病原学历史第11-13页
        1.2.2 PCV2的基因组研究第13-14页
        1.2.3 PCV2病毒核衣壳蛋白质(Cap)蛋白的研究进展第14-15页
        1.2.4 Cap蛋白组装体(capsid)的研究进展第15页
    1.3 PCV1与PCV2在五倍轴的差异第15-18页
        1.3.1 LoopBC上的抗原表位第17页
        1.3.2 PCV2的capsid表面五倍轴loops的相互作用第17-18页
    1.4 分子生物学以及蛋白组学检测方法研究进展第18-20页
        1.4.1 PCR检测技术第18页
        1.4.2 实时荧光定量PCR第18-19页
        1.4.3 间接免疫荧光技术第19页
        1.4.4 病毒感染性DNA克隆第19页
        1.4.5 质粒转染第19-20页
    1.5 研究目的与意义第20-21页
第二章 PCV2的Cap蛋白LoopBC突变体的构建与原核表达第21-34页
    2.1 试验材料与仪器第21-22页
        2.1.1 试验材料第21页
        2.1.2 主要仪器第21-22页
        2.1.3 主要试剂的配制第22页
    2.2 Cap蛋白差异性比对第22-23页
        2.2.1 PCV1与PCV2的氨基酸序列比对第22-23页
        2.2.2 PCV2的Cap与突变体Cap的3D蛋白结构比对第23页
    2.3 PCV2Cap突变体蛋白的质粒构建第23-27页
        2.3.1 Overlap-PCR的引物设计第23-24页
        2.3.2 PCR与overlap-PCR扩增第24页
        2.3.3 PCR产物回收并纯化第24-25页
        2.3.4 双酶切胶回收产物第25页
        2.3.5 胶回收产物的普通回收第25-26页
        2.3.6 载体与片段的连接反应第26页
        2.3.7 连接产物转化第26-27页
        2.3.8 质粒提取第27页
    2.4 野生型Cap以及Cap突变体蛋白的原核表达第27-29页
        2.4.1 质粒转化第27-28页
        2.4.2 突变体蛋白可溶性分析的检测第28页
        2.4.3 Cap蛋白以及Cap突变体蛋白的纯化第28-29页
        2.4.4 纯化后蛋白的鉴定第29页
    2.5 结果与分析第29-32页
        2.5.1 PCV1与PCV2的在LoopBC区域的氨基酸序列比对第29-30页
        2.5.2 PCV2Cap蛋白突变体的3D结构模拟第30页
        2.5.3 ORF2基因的扩增以及酶切鉴定与测序结果分析第30-31页
        2.5.4 蛋白的可溶性分析第31-32页
        2.5.5 蛋白的纯化与鉴定第32页
    2.6 讨论第32-34页
第三章 Cap蛋白及其突变体VLPs的制备与感染性克隆DNA的构建第34-50页
    3.1 试验材料与仪器第34-35页
        3.1.1 试验材料第34页
        3.1.2 主要实验设备第34-35页
    3.2 Cap蛋白及其突变体VLPs的组装第35-36页
        3.2.1 Cap蛋白的体外组装第35页
        3.2.2 色谱法检测VLPs的颗粒大小第35-36页
        3.2.3 硫酸乙酰肝素纯化野生型与突变型VLPs第36页
    3.3 VLPs侵染PK-15细胞第36-37页
        3.3.1 复苏PK-15细胞第36-37页
        3.3.2 测量Cap蛋白浓度第37页
        3.3.3 IFA法检测突变体Cap蛋白内化PK-15细胞第37页
    3.4 PCV2感染性克隆以及突变型感染性克隆DNA的构建第37-39页
        3.4.1 OverlapPCR扩增反应第37-38页
        3.4.2 双酶切PCR产物第38-39页
        3.4.3 连接产物的测序第39页
    3.5 野生型与突变型感染性克隆DNA的质粒大提第39-40页
        3.5.1 质粒DNA的大量扩增第39页
        3.5.2 质粒大提第39-40页
    3.6 质粒转染以及PK-15细胞内病毒拷贝数的检测第40-42页
        3.6.1 质粒转染第40-41页
        3.6.2 FQ-PCR检测PCV2病毒载量第41-42页
        3.6.3 PK-15细胞内病毒的IFA染色第42页
    3.7 PCV2感染性DNA克隆转染至PK-15细胞后的测序第42-44页
        3.7.1 PK-15细胞的DNA提取第42-43页
        3.7.2 PK-15细胞的DNA检测第43页
        3.7.3 PK-15细胞的DNA检测第43-44页
    3.8 结果与分析第44-48页
        3.8.1 蛋白组装结果第44-45页
        3.8.2 VLPs的纯化与分子筛结果第45页
        3.8.3 VLPs通过肝素填料纯化后的分析第45-46页
        3.8.4 VLPs内化入PK-15细胞的间接免疫荧光(IFA)验证第46页
        3.8.5 感染性克隆转染PK-15细胞后的Q-PCR结果第46-47页
        3.8.6 转染感染性克隆后的PK-15细胞IFA检测第47-48页
    3.9 讨论第48-50页
第四章 结论第50-51页
参考文献第51-59页
附录Ⅰ第59-60页
致谢第60-61页
作者简介第61页

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