| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-23页 |
| 1.1 引言 | 第9-10页 |
| 1.2 北极 | 第10-14页 |
| 1.2.1 北极资源 | 第10-12页 |
| 1.2.2 北极生态系统 | 第12-13页 |
| 1.2.3 北极冻融现象 | 第13-14页 |
| 1.2.4 北极土壤微生物 | 第14页 |
| 1.3 高通量测序 | 第14-20页 |
| 1.3.1 扩增子测序 | 第16-18页 |
| 1.3.2 全基因组测序 | 第18-19页 |
| 1.3.3 宏基因组测序 | 第19-20页 |
| 1.4 本课题研究思路及意义 | 第20-23页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第21页 |
| 1.4.2 研究意义 | 第21-23页 |
| 第二章 北极土壤可培养微生物的分类研究 | 第23-35页 |
| 2.1 实验材料、试剂和仪器 | 第23-25页 |
| 2.1.1 采样地点 | 第23页 |
| 2.1.2 主要实验仪器及试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.3 培养基 | 第24-25页 |
| 2.1.4 数据库及分析软件 | 第25页 |
| 2.2 研究步骤及方法 | 第25-28页 |
| 2.2.1 土壤样品采集 | 第25-26页 |
| 2.2.2 可培养微生物的涂布、分离纯化及保种 | 第26-27页 |
| 2.2.3 可培养微生物的鉴定 | 第27-28页 |
| 2.3 可培养细菌的实验结果 | 第28-32页 |
| 2.3.1 可培养细菌统计计数及形态观察 | 第28-30页 |
| 2.3.2 可培养细菌的序列分析及系统发育树的构建 | 第30-32页 |
| 2.4 可培养真菌的实验结果 | 第32-33页 |
| 2.4.1 可培养真菌统计计数与形态观察 | 第32页 |
| 2.4.2 可培养真菌的菌株初步鉴定及系统发育分析 | 第32-33页 |
| 2.5 讨论 | 第33-35页 |
| 第三章 高通量测序及多样性分析 | 第35-73页 |
| 3.1 材料与方法 | 第35-39页 |
| 3.1.1 土壤样品 | 第35页 |
| 3.1.2 实验试剂与设备 | 第35-36页 |
| 3.1.3 生物信息学数据库 | 第36页 |
| 3.1.4 土壤DNA的提取 | 第36页 |
| 3.1.5 扩增子及宏基因组测序 | 第36-37页 |
| 3.1.6 扩增子及宏基因组测序分析 | 第37-38页 |
| 3.1.7 土壤理化性质的测定 | 第38-39页 |
| 3.2 土壤理化性质结果 | 第39-40页 |
| 3.3 基于细菌16S rDNA扩增子测序结果与分析 | 第40-49页 |
| 3.3.1 细菌扩增子测序下机数据分析 | 第40-42页 |
| 3.3.2 细菌多样性和群落结构的分析 | 第42-48页 |
| 3.3.3 环境因子与细菌群落相关性分析 | 第48-49页 |
| 3.4 基于真核18S rDNA扩增子测序结果与分析 | 第49-60页 |
| 3.4.1 真核扩增子测序数量分析 | 第49-51页 |
| 3.4.2 真核物种多样性和群落结构的分析 | 第51-58页 |
| 3.4.3 环境因子与真核群落相关性分析 | 第58-60页 |
| 3.5 基于宏基因组测序结果与分析 | 第60-67页 |
| 3.5.1 宏基因组测序结果及Metagenome组装 | 第60-61页 |
| 3.5.2 基因预测与信息注释 | 第61-64页 |
| 3.5.3 功能注释 | 第64-66页 |
| 3.5.4 抗性基因注释 | 第66-67页 |
| 3.6 讨论 | 第67-73页 |
| 3.6.1 理化性质分析 | 第67-68页 |
| 3.6.2 16S rDNA扩增子测序分析 | 第68-69页 |
| 3.6.3 18S rDNA扩增子测序分析 | 第69-70页 |
| 3.6.4 宏基因组测序分析 | 第70-71页 |
| 3.6.5 微生物群落与环境因子关联分析 | 第71-73页 |
| 总结 | 第73-75页 |
| 创新点 | 第75页 |
| 不足与建议 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第88-89页 |
