| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第8-19页 |
| 1.1 背景介绍 | 第8-13页 |
| 1.1.1 组蛋白修饰 | 第9-11页 |
| 1.1.2 顺式作用元件--增强子 | 第11-12页 |
| 1.1.3 组蛋白修饰和增强子关系 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-17页 |
| 1.2.1 CSI-ANN方法 | 第15-16页 |
| 1.2.2 ChromaGenSVM方法 | 第16-17页 |
| 1.3 论文主要内容及组织结构 | 第17-19页 |
| 第二章 SVM预测增强子 | 第19-35页 |
| 2.1 SVM方法介绍 | 第20-23页 |
| 2.1.1 SVM原理介绍 | 第20-22页 |
| 2.1.2 SVM的核函数 | 第22-23页 |
| 2.2 数据准备 | 第23-26页 |
| 2.3 SVM算法预测流程 | 第26-28页 |
| 2.4 增强子预测结果分析 | 第28-33页 |
| 2.4.1 分类指标的评价标准 | 第28-29页 |
| 2.4.2 分析预测结果与p300以及DHS的重叠情况 | 第29-32页 |
| 2.4.3 分析预测结果与PhastCons以及PReMod的重叠情况 | 第32-33页 |
| 2.5 本章小结 | 第33-35页 |
| 第三章 集成学习预测增强子 | 第35-49页 |
| 3.1 单碱基上组蛋白修饰富集情况 | 第35-36页 |
| 3.2 集成学习—随机子空间 | 第36-39页 |
| 3.3 随机子空间预测流程 | 第39-41页 |
| 3.4 实验结果分析 | 第41-47页 |
| 3.4.1 分析预测结果与p300以及DHS的重叠情况 | 第42-44页 |
| 3.4.2 分析预测结果与PhastCons以及PReMod的重叠情况 | 第44-45页 |
| 3.4.3 分析增强子特征p300和DHS的不同之处 | 第45-47页 |
| 3.5 本章小结 | 第47-49页 |
| 第四章 论文主要成果及展望 | 第49-51页 |
| 4.1 实验结果分析 | 第49页 |
| 4.2 总结与展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 附录A 组蛋白修饰的排序 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 硕士期间发表论文 | 第57-58页 |
