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生长素及苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因克隆与酶活性鉴定

摘要第10-12页
ABSTRACT第12-14页
一 文献综述第16-38页
    (一) 植物小分子化合物的糖基化与糖基转移酶第16-22页
        1 植物的糖基转移酶多基因家族第16-19页
            1.1 植物的糖基转移酶多基因家族第16-17页
            1.2 植物小分子糖基转移酶的结构第17-19页
        2 糖基转移酶基因鉴定第19-20页
            2.1 生物信息学和生物化学结合的方法第19页
            2.2 生物化学方法第19页
            2.3 分子生物学方法第19-20页
            2.4 遗传学方法第20页
        3 糖基转移酶的生物学功能第20-22页
            3.1 参与植物激素平衡第20-21页
            3.2 参与植物次生代谢第21页
            3.3 参与植物防御反应第21页
            3.4 参与植物脱毒反应第21-22页
            3.5 参与植物信号转导第22页
    (二) 生长素的生物合成第22-27页
        1 植物生长素的色氨酸合成途径第22-23页
        2 ANA与色氨酸合成第23-24页
        3 YUCCA途径第24-25页
        4 IPA途径第25页
        5 非色氨酸依赖的生长素合成第25-26页
        6 生长素的共价结合修饰第26-27页
            6.1 低分子化合物的缀合态生长素第27页
            6.2 高分子化合物的缀合态生长素第27页
    (三) 苯丙烷代谢途径第27-36页
        1 苯丙烷代谢第27-29页
        2 简单酚类化合物第29-31页
            2.1 简单酚类化合物的分类第29-30页
            2.2 简单酚类化合物的作用第30-31页
        3 木质素的合成途径及作用第31-32页
            3.1 木质素单体以及合成途径第31页
            3.2 木质素的作用第31-32页
        4 黄酮类化合物合成及其生物合成途径第32-33页
            4.1 黄酮类的代谢途径第32-33页
        5 芥子酸的性质第33-36页
            5.1 芥子酸的代谢第33-35页
            5.2 芥子酸糖基转移酶第35页
            5.3 酰基转移酶第35-36页
            5.4 芥子酰胆碱酯酶第36页
    (四) 本研究的目的意义第36-38页
二 材料方法第38-52页
    (一) 实验材料第38-40页
        1 菌株与载体第38页
        2 植物材料第38页
        3 主要试剂第38-39页
        4 主要溶液与培养第39-40页
            4.1 主要溶液配方第39页
            4.2 主要培养基第39-40页
    (二) 实验方法第40-52页
        1 候选基因的预测第40-41页
            1.1 水稻生长素糖基转移酶基因的预测第40页
            1.2 水稻苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的预测第40页
            1.3 毛白杨苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的预测第40-41页
        2 候选基因的克隆第41-45页
            2.1 RNA提取第41页
            2.2 PCR法扩增候选基因第41-43页
            2.3 候选基因的平端克隆转化第43页
            2.4 大肠杆菌感受态制备及转化第43-44页
            2.5 阳性克隆的筛选第44-45页
                2.5.1 质粒的提取第44-45页
                2.5.2 质粒的酶切验证第45页
        3 原核表达载体的构第45-46页
            3.1 质粒和基因片段的酶切第45-46页
            3.2 XL1-Blue感受态的制备及转化(同2.4)第46页
            3.3 阳性克隆的筛选(同2.5)第46页
        4 GST融合蛋白的表达纯化第46-47页
            4.1 GST融合蛋白的表达及提取第46页
            4.2 GST融合蛋白的纯化第46-47页
                4.2.1 Glutathione Sepharose 4B的制备第46-47页
        5 蛋白纯度和浓度测定第47-48页
            5.1 SDS-PAGE胶测蛋白纯度第47-48页
            5.2 蛋白浓度测定第48页
        6 酶促反应条件第48-49页
            6.1 体外酶活鉴定(定性反应)第48-49页
            6.2 原核表达蛋白对不同底物转化率的影响第49页
        7 影响酶活的因素分析第49-50页
            7.1 温度对酶活性影响第49页
            7.2 pH对酶活性影响第49-50页
        8 动力学参数分析第50页
            8.1 重组蛋白与底物的时间线性关系第50页
            8.2 重组蛋白与底物反应的动力学常数测定第50页
        9 HPLC分析条件第50页
        10 标准曲线的制作第50-52页
            10.1 IAA标准曲线制作第50-51页
            10.2 IBA标准曲线制作第51-52页
三 实验结果第52-94页
    (一) 水稻生长素糖基转移酶基因克隆与酶活性鉴定第52-66页
        1 水稻生长素糖基转移酶基因的预测及进化树分析第52-54页
            1.1 水稻生长素糖基转移酶基因预测第52页
            1.2 候选基因的进化树分析第52-54页
        2 水稻生长素糖基转移酶基因的克隆与原核表达载体的构建第54-56页
            2.1 水稻生长素糖基转移酶基因的克隆第54页
            2.2 OsIAGT1基因阳性克隆载体鉴定第54-55页
            2.3 OsIAGT1基因原核表达载体的构建第55-56页
        3 纯化的原核表达蛋白与生长素的反应第56-61页
            3.1 生长素糖基转移酶活性基因的筛选第56页
            3.2 OsIAGT1对生长素IAA的反应第56-58页
            3.3 OsIAGT1对生长素IBA的反应第58-59页
            3.4 OsIAGT1对生长素类似物NAA的反应第59页
            3.5 OsIAGT1对生长素类似物2,4-D的反应第59-60页
            3.6 OsIAGT1对生长素前体物IPA的反应第60-61页
            3.7 OsIAGT1对生长素ICA的反应第61页
        4 OsIAGTl对不同底物转化率的比较第61-62页
        5 影响酶活性因素分析第62-64页
            5.1 温度对OsIAGT1活性的影响第62-63页
            5.2 Buffer和pH对OsIAGT1活性的影响第63-64页
        6 动力学常数分析第64-66页
            6.1 OsIAGT1参与IAA催化反应的时间线性关系第64页
            6.2 OsIAGT1参与IAA催化反应的动力学常数计算第64-65页
            6.3 OsIAGT1对IAA、IBA的动力学常数第65-66页
    (二) 水稻和杨树苯丙烷代谢糖基转移酶基因克隆与酶活性鉴定第66-85页
        1 水稻苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的预测及进化树分析第66-67页
            1.1 水稻苯丙烷代谢糖基转移酶基因预测第66页
            1.2 候选基因的进化树分析第66-67页
        2 水稻苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的克隆与原核表达载体的构建第67-69页
            2.1 水稻苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的克隆第67页
            2.2 OsSGT1基因阳性克隆载体鉴定第67-68页
            2.3 OsSGT1基因原核表达载体的构建第68-69页
        3 纯化的原核表达蛋白与苯丙烷代谢相关底物的反应第69-73页
            3.1 苯丙烷代谢相关底物糖基转移酶活性基因的筛选第69页
            3.2 OsSGT1对芥子酸的反应第69-70页
            3.3 OsSGT1对阿魏酸的反应第70-71页
            3.4 OsSGT1对咖啡酸的反应第71页
            3.5 OsSGT1对肉桂酸的反应第71-72页
            3.6 OsSGT1对对香豆酸的反应第72-73页
        4 毛白杨苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的预测及进化树分析第73页
            4.1 毛白杨苯丙烷代谢糖基转移酶基因预测第73页
            4.2 候选基因的进化树分析第73页
        5 毛白杨苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的克隆与原核表达载体的构建第73-77页
            5.1 杨树苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的克隆第73-74页
            5.2 杨树苯丙烷代谢相关基因阳性克隆载体鉴定第74-76页
            5.3 PtSGT1-3基因原核表达载体的构建第76-77页
        6 纯化的原核表达蛋白与苯丙烷代谢相关底物的反应第77-85页
            6.1 苯丙烷代谢相关底物糖基转移酶活性基因的筛选第77-78页
            6.2 PtSGT1对芥子酸的催化活性第78-79页
            6.3 PtSGT1对阿魏酸的催化活性第79页
            6.4 PtSGT1对咖啡酸的催化活性第79-80页
            6.5 PtSGT1对肉桂酸的催化活性第80-81页
            6.6 PtSGT1对对香豆酸的催化活性第81页
            6.7 PtSGT3对芥子酸的反应第81-82页
            6.8 PtSGT3对阿魏酸的反应第82-83页
            6.9 PtSGT3对咖啡酸的反应第83页
            6.10 PtSGT3对肉桂酸的反应第83-84页
            6.11 PtSGT3对对香豆酸的反应第84-85页
    (三) 基因突变对糖基转移酶UGT76C2酶活性的影响以及转基因植物的表型分析第85-94页
        1 突变位点以及蛋白保守性分析第85-86页
            1.1 氨基酸突变位点(L31H)第85-86页
            1.2 突变位点保守性第86页
        2 原核表达载体构建与蛋白纯化第86-87页
            2.1 含UGT76C2,UGT76C2m的表达载体构建第86页
            2.2 表达载体的验证第86-87页
        3 纯化GST融合蛋白第87-88页
        4 体外融合蛋白对细胞分裂素的糖基转移酶活性验证第88-90页
            4.1 UGT76C2和UGT76C2m对6-BA的催化活性第88-90页
            4.2 UGT76C2和UGT76C2m对Trans-Zeatin的催化活性第90页
        5 拟南芥UGT76C2m过表达纯合体株系的表型及生理分析第90-94页
            5.1 根延伸抑制第91-92页
            5.2 细胞分裂素及其糖苷含量测定第92-94页
四 讨论及创新点第94-100页
    (一) 水稻生长素糖基转移酶活性及生化特性第94-96页
        1 水稻生长素糖基转移酶活性第94-95页
        2 水稻生长素糖基转移酶的酶学性质第95-96页
    (二) 水稻和杨树中苯丙烷代谢相关糖基转移酶第96-97页
        1 水稻苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因克隆第96-97页
        2 杨树苯丙烷代谢相关糖基转移酶基因的克隆鉴定第97页
    (三) 基因突变对糖基转移酶UGT76C2酶活性的影响以及转基因植物的表型分析第97-99页
    (四) 本论文的创新点第99-100页
参考文献第100-105页
致谢第105-106页
学位论文评阅及答辩情况表第106页

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