| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-44页 |
| ·脱氧核糖核酸(DNA)简介 | 第11-12页 |
| ·单一碱基的激发态动力学研究进展 | 第12-14页 |
| ·堆积碱基的长寿命激发态动力学研究进展 | 第14-24页 |
| ·激基复合物(Excimer/Exciplex)和激子(Exciton) | 第15-16页 |
| ·长寿命、红移的发射光谱是堆积碱基excimer/exciplex激发态的体现 | 第16-18页 |
| ·从Franck-Condon态至长寿命激发态的动力学演化 | 第18-21页 |
| ·堆积构型在excimer、单体似失活通道中的作用 | 第21-24页 |
| ·碱基对质子转移对DNA激发态性质的影响 | 第24-26页 |
| ·光化学的衰减——形成环丁烷型嘧啶二聚体 | 第26-30页 |
| ·结论及展望 | 第30-31页 |
| ·选题依据 | 第31页 |
| 参考文献 | 第31-44页 |
| 第二章 理论模型与方法 | 第44-57页 |
| ·前言 | 第44页 |
| ·分子动力学(Molecular Dynamics)简介 | 第44-45页 |
| ·波恩-奥本海默近似(Born-Oppenheimer approximation) | 第45-48页 |
| ·势能面及势能面的相交 | 第48-49页 |
| ·非绝热跃迁和势能面相交 | 第48-49页 |
| ·非绝热动力学的近似方法 | 第49-51页 |
| ·Ehrenfest动力学 | 第50页 |
| ·Surface Hopping | 第50-51页 |
| ·半经典的电子-辐射-离子动力学(SERID)模拟 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 第三章 堆积胞嘧啶激发态失活的动力学模拟 | 第57-96页 |
| ·初始构型 | 第58-60页 |
| ·基态平衡构型 | 第58页 |
| ·模拟的初始原子坐标和速度 | 第58-60页 |
| ·激光脉冲的选择 | 第60页 |
| ·通道Ⅰ——二聚体光化学通道 | 第60-71页 |
| ·模拟结果 | 第61-65页 |
| ·讨论 | 第65-71页 |
| ·通道Ⅱ——excimer光物理失活通道 | 第71-78页 |
| ·模拟结果 | 第71-74页 |
| ·讨论 | 第74-78页 |
| ·通道Ⅲ 单体式失活 | 第78-83页 |
| ·模拟结果 | 第78-80页 |
| ·讨论 | 第80-83页 |
| ·通道Ⅳ——单体式失活+二聚体通道 | 第83-89页 |
| ·模拟结果 | 第83-86页 |
| ·讨论 | 第86-89页 |
| ·通道Ⅴ——单体式失活+excimer光物理失活通道 | 第89-91页 |
| ·结论 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-96页 |
| 第四章 堆积腺嘌呤激发态失活的动力学模拟 | 第96-117页 |
| ·B-DNA堆积腺嘌呤模型体系的激发态性质 | 第96-105页 |
| ·通道Ⅰ——单体式的无辐射失活 | 第97-100页 |
| ·通道Ⅱ——"C2-C4’成键的excimer"无辐射失活 | 第100-105页 |
| ·B-like型堆积腺嘌呤模型体系的激发态性质 | 第105-114页 |
| ·通道Ⅲ——长寿命excimer失活 | 第105-110页 |
| ·通道Ⅳ——"C2-C2’成键的excimer"无辐射失活 | 第110-114页 |
| ·结论 | 第114-115页 |
| 参考文献 | 第115-117页 |
| 第五章 胸腺嘧啶二聚体形成及解离反应的动力学模拟 | 第117-136页 |
| ·形成胸腺嘧啶二聚体的动力学模拟 | 第117-127页 |
| ·形成环丁烷型嘧啶二聚体 | 第118-122页 |
| ·"成键excimer"的失活通道 | 第122-126页 |
| ·结论 | 第126-127页 |
| ·胸腺嘧啶二聚体解离反应的动力学模拟 | 第127-132页 |
| ·模拟结果 | 第127-132页 |
| ·结论 | 第132页 |
| 参考文献 | 第132-136页 |
| 结论及展望 | 第136-138页 |
| 结论 | 第136-137页 |
| 展望 | 第137-138页 |
| 读博期间的科研成果 | 第138-139页 |
| 致谢 | 第139-140页 |
| 作者简介 | 第140页 |
